Ll_transcript_476626

Id TrinityTRINITY_DN47436_c5_g1_i5
Name TranscriptLl_transcript_476626
SequenceTGTGAATCATTTTGTGATTAAAAAATATTTTTAAATTTGATGTGGCCCAAATGGGGTCTGATGCGGCTTAAATGCAGTTCCATGTGACTGCATGAATGCA TCCTTATGATTCAGTGTCACACTGCAATTACGGCAGTCACCGCAACTGCAAATATCGTGGCTGCATCACGTGATATGGTCCACAATTTGAATCACTACTT GAAATATAAAAAATTCTTAATCCTTGTGTTCTTTATAGTTGGAATTATTTAGTGTTCCCTGCATCAGTATGGAGCTAGATTCCTTTGCTTTAAGCTTAAT TAGGCTACAATAATTTCAACATGCTTGCTAGGTTTAAATCAAAGTGTTGTTTTTAACTTTTTATCTATAAATGACTGCAGTTTCTTGTATTTTAGGTAAT TGTGGCTGACGAGGATAACAGGAAATTGATCTTCTCTGAAAAGGAAGCTGCCTGGTCTAAATTCTCTGGACGGGTCAAGGTTGGAGACATTTTTGAAGCA AGAGTTGGCTCTGTTGAGGATTATGGTGCTTTTGTTCATTTGCGCTTCCCCGATGGTCTTTATCGCCTTACTGGACTAGTACACATCTCAGAAGTGTCAT GGGATCTAGTTCATGATGTAAGAGACATCTTAACAGAAGGTGATAAATTGAGGGTTAAAGTTATCAATGTTGATAGAGAAAAATCAAGGATTAAACTGTC AATTAAACAGTTAGAAGAAGATCCACTTCTAGAAACTCTGGACAAAGTAATACCTCAGGATGATTCAGCATATTCTGATTCTTTGAGCGATGATGATAGC AGTGTTATTGAGCCTCTTCCAGGACTTGAGACAATCCTTGAAGAGCTACATAAGGAAGATGGGTATGCTTCCATCCTTATATCTTGTTCTGTAAATTGTA ATGTTCTAGGTAGCAAGAGTTTAACTACTTGAAATAACCCGTGGTTACATCCAAAATCCCTAGCCACATGGTCTAAATAATTCTTTTAATAAAAAGATAA AAATACTACTGCCATGGTTTTAAGTTACAGTTGTGGCCATTATGATTGTGTTCATCGTGATACAGATTGTGGTCGTTTTTGTGGTTCAAAATTTGATTTC AGAATATGATGCGGTCCAAACTGCTCCTACATAGAATGTGAAATATTCCTAACAACTATATGGACTTTTTATTGCATAATGAATAGGAACATAACAGCTT CTGAGTCATACTAATCCAGACATGCTTAGCAAATCTTGTTCTTTTGAAATACCTTTTATAATATATGTGATGATATGAATTGTCTGATAAATTTTCAATG GTGAAATATGTGACAGTATATTTGATGCAAGAATCAGTCGTCAAGGGTTTGAAAAACGTGTTGTCTCACCAGACTTGCAGCTTTGGCTTTCCAATGCACC TCCTTCAAACCAAAGGTTTACTCTCCTTGCTAGAGCTGGAAGACAGGTGCAGGAGATCCACTTAACTACATCCCTTGATCAAGAAGGTATCAAAAGGGCA TTACAAAGAGTATTGGAGCGTGTCCCCTGAATCTCACTCAGGAACAGTTCTTCCAGCTCCATAATATCTCAATGATTTTGTACAGTTATCACACATTTAA AGTTCAGATATGACCCTGCATATTCCATTACATCAAATCATCGTGATTTAACTCTAAAAAAAAGTCCTTATAAGAACACTCCATCAAATAACATTTGCTT GAATTCATTCATTCAAAACAAGTACTATTTTGAATAGATAATGAAGAATCAGCAACACAGGAAACATAAAAACTTATTACATATTGTCCTGAAATGGGTG TTCCCTATCATGTCATATTCATAGATGATATTATTTTCCCTTTAGGATTCGTAATTGTTCATTCAAGCAAGTGTCGTTTTCAGGAATTAAATCATTGATC TTTTGGTTTTTTTGGGGTTTTACATGATTAGATTAATATTTTGTTAGTATATATATATAGATGATATTATCATTGATTAACTTATTAAATAGTTCTTCAA TTAATGCATCTTTCATTAGATGATGCACCATAGTTATTGAATGAATGAGGATCATTGATTTGGATAAACTTTTAAATCAATGATTAGATTAGTATAGGTT ATTCGATAGGCATGTTGAATGTTGTTTATATGGAATTAAGAAGTTTTAATATTCCTGTTTCTTTTTTTATAGCACCATTTTGGATAATTTTATACTAATT AAGAGTTGTAAAAATATGTTTTAAATTTGTAAATGATTGTACCTAGTTTACAAAATTGTCATTATTTTTTTAAGTGTGATGCTTGAAAAAATAAACCTAT TTCAATAATCTCTTTTCAGTGTTGTGATATGATTGAATAACAGTGTTCATTAATCATGATGAATTGGGTCCAATATTAGTTTGATAGAAACTAGTACTTA TTTTTCTTCCTTTTTGTAAAGTGCATCATGTGGCATATGAAAAAAGGTTTGTGGCCAAG BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_152583; 
Additional information-

Expression of Ll_transcript_476626

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_476626

Blastp-
Blastx30S ribosomal protein S1 from Leuconostoc with 36.54% of identity
Eggnogthus facilitating recognition of the initiation point. It is needed to translate mRNA with a short Shine-Dalgarno (SD) purine-rich sequence (By similarity)(COG0539)
Kegg-
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019438287.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;