| Id Trinity | TRINITY_DN47545_c0_g1_i2 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_525254 |
| Sequence | GTTGATTTATATTATTTTTATTTGAGAGTCATTAATAGTTATTCTACCACCTTTCTCCTTTTTGGAAGAGAATCTTCTTCACCTTAAATTAATATACCCC TACTCTTTAAAAAAATCAATTACAAGTCTGGCTTCCCTTTTCTAATTTGACCTCAATCTTTCCAATTTTGAAGCTTATGTGTAAAGAGAAATTAGATAAT TGATTTATCTGTATATAGTGGTTTAAGATTATTAAAGCAGTTATATAATAGAATGGGCCATTGGCCCAAAACAGGTGTCGCTGTAGATATAAGTAACGAA TCGAAAGTTGAATGATTGAATTAATCGAAATTGAAAATCATCATCAACATCGATGGATCTGGAGGTAGTTGGGCGTCACGCGATGCTGTTCGACGATGAC AGCTTGGCGGCGTTTGTGAACTCACCTTCTGCTCTCGTCGATTGGAACTCTCTCTCTATTGATCGCTACGATGTTCGCCACCTCCTCCCTTCTCCGCTTC CACCTCGCCGCCATCTTCACCGCCCTTCCCTTCAACCTTACCTTGACCACGAACGCTATCTCTATCTCCCTTCTTCTTCTCCCAACCAACAACCACAAGG ATGGAAGGTAATTCGCTACGGTTCCTGTGTCAGAATACAAGTAAGGATGTTTTCGCATGGCTTCCATTTTCCTTTAGAATCTTCTGTCAATATGATGGTT CAGATCCAGTGATCTCGGATGGGGATGGCTATCGTGCTGTTCCGTTTAAATATGCAAATCCTAATGACCCGGCTGAGACAAGAGACAGTGATACGGAGTC TGCATATCGTCCTCCCTTCCCTGTACCAGAAAGATTACTCCATAGTCTGGTTAGTGACCTCAGTCTTAACATTTATTTTCGTCGTGTGATTTTCAGATGT TACAGATTTATTTAACCTTTTAATTTCTTAACCAGTGTGATTAGGTGATAATTGTCTAGGGTGCATATGTTATTCTAAGGCTTACAATGTCTAAGTTTCA GATGCTTGGAGCATAAATGGAGTTCTTGTGACTCAAGGTAGCCATTCTCAGGCACCTTGTTTCCTTTTGATGTCATGAGAAGGGTCTGTGCAGGTTGGAT TAGGATGATAGAAATTGGTTGATTCTTTACCTCGAGAGCAAATGGGATGAAATTTATCTTCTTAAAGTCCTGTTTCTTGATCTTTATGGTTATGCAAGTA TATTTGAGGTTATCTTATGTTTGTTTAGTGAGATATTTATGTATTTCTGCCTGCGAAGACCTTTTAAAAGTTATATTTATGCTAATTTTTTGAAATTCAC ACTTATTGATGAAGAAACCTTTTTTGTTTGTATTTTCAGCCTCCAAACGAGAAGGTACATCAGATTATCTCAAGGACTGCAATTTTTGTCAGCAAACATG GAAGCCAGTCAGAAATTGTCCTGAGGGTGAAACAAGGAAACAATCCAACATTTGGGTTCCTGATGCCTGATCATCATCTTCATGCATATTTTAGGTTTCT TGTTGATCATCAAGAACTTTTGAAAGGTGACAAAGATGATACCATCGGCAACCCATCTGTTGACAAGAATAAAAGTCAGGGGCTTGACCAAACAGGTGGT GCATTGTCTTTGCTTGGATCAGTTTATGGATCTGGAGAGGATGAGGATGGTACAACCGATAATACTCATGACTTCAAGAGAAACGAATGTGAAGGAGCTG TTGATGCTGTTAGTGCTCATGATTCTGCAGGAGTAGAACCCGCAGAGTCATCTCCAGATGCAGCCAAGAAGGATGGAAGCATTTCTAGAAGTCCGATATC TTCGAAAGAAAATGTTCCTGTCATTAAGCGGAACCAGCCTATCAGTACTGTCAAGGCAGCAATCGCAGCTAGGGCAAAAACAACTGATGCATTGGATTTA GTGTCTAATGTGGTAGACAAATCACAGGTTTCTGTGCCCAATAAAGTTAAGATTGAACTACCCGTTGTGGAGCCCCCATCTAGCATAAAGGAAGTTATTG AGAAGGTGGTTGAGTTCATTTCAAAAAATGGAAAACAATTTGAGGCTGTTCTTGCTGAACAGGATCGTGCTAATGGAAGGTTCCCATTTCTTGTGCCGTC TAATCGATATCATACCTATTATCTGAAAGTTCTTCAAACTTCTGAAGATGTATGTTTCTCAGAATAATTAAAATTTGCTACAATTTCTTTTATCTGTTCC ATGCGATTCGTATCCTACTTTGAGAATCAATAATTTCACTTTACACTTTTATAGGGCATGATCTACGTCATGCTATCATTGTATTCCTTCTACCCTAGCT CTTCACTGAAGCTAAAATATAATTTCATTTACAGAGATCATCAGCCATTGGCTTGTCCACTAATGTTGGTTATTCTCACTAGTCATTGGTTCATGTTTGT ATTTCTGTATGTGATGCGGATTTGTGTTAATTTATGAATCTTCAAAGTATTCATGCATGTTCGGGGAGATATTTTTGTGCAGTGGGTGAATTCCATGGTT TATTTTTGGGCATCATTGTGTGATTAATTCTAAGATATTGTTGAATTTAACTTTCAACTGCAACTTACTGGTCTTTTCAATTGCTTACAGTCTAAGTTAC CAGGCAAGGGCTTGCAAAGGCACAATTCAGCAGGTCGTTCAGGGGACAATAATTCTATTGCACACGAAGAAAGTGATAATTCTTCATTTGGATCTGTGAG CTCTGATATACCACATGATATGGACCGCAAAGAGAAGTTTAAGTCGATTGTCAGAAAGTCGAAGAAGGATGGTCAAGATGCAACTCCCGAAGACATCCAA ACTCAGACCATGGTGTGCATGGATGCAGCAGCAGCTGCTGCTATTCTTCAGGCTGCCACTAGGGGTATTAAAAACCCTAATTTAGAAATATTTAGCAAGA CATCAAGTGGTAGCAGTCAAGGCCTTGGAAGTTATGTCAAAAGCCCAAATCTGAATGCAGAGGATAGTGCTTCTGTCCCTGTTGGCAAGGCTATTCGAGA AAAGGTCAATATTGCTGTAGCAGGTGAGGCAGACTCCTCTGAAGCAAATATGACTAAAGAGAAGATTAAGGCAGAGAGACTGAAACGAGCGAAGATGTTT GCAGCCATGATAAAAAGCAGAGCTGAGCCACTCAAGAGTGAAGTCCCACGTGGTTTATCAGTTGAGCCACCAGGCTATGGACTTTCAAGTTCAGATGCTG AGACTGGGAATCTTATGGGTGAAGAAAGAAAAGGAAGTTCTGTTCCACTAGATGTTGATAATTCAGATAAAAGTCAGAAGTCTGAGGAGAAACTTTCTGT TGATAAATCAAACGAAAGTCACAAATCTAAGGAGAAACTTGCTGTTGATAACGATGAACGGCGGTCGAAAAGAAAGTACCGTTCAAGATCCAGTAGACAT GAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGATGGTGGCGGCGAAGATGGAGGGAGAAAGAAGGAGGCGATATTGGTATTGGCAGAGGCAGGGAGGTCAGTGGA GAGTTTGCCAGGTGACTTGGCGGCGGCCGTAAAAGAAGGGAGGATCGGAGGTGCGGTGGTGAGTCGGTTACTGGAAATGGAGAAATCAGCGTTGTTGAGA TGGTTACTTCAGTTTGGTGGATTCAAGGAACGTCTTCTCGCTGATGATCTCTTTCTTGCTAAACTTGCTATGGAGTGCGGTGTTGGCGTCTTCACCAAGA CTGCTGCTGAGTACGACCGCAGGAGAGACAAGTTTTTTGATGAGCTGGAAATTGTTTTCGCTGATGTGGTCATGGCCATACTTGCAGATTTCATGCTGGT TTATCTTCCGGCACCGACTGTATCTCTTAGACCACCACTTGCAATCAATGCAGGCCATATAGCCAAGTTTTTCCACAACTGCCCAGATAATGCATTCCAG GTTGCTCTCTCAGGAACACCATATTCCTTATTACAGAGAATTGGTGCTATTGTGCGTAATGGATCTAAGCTTTTTGCTGTTGGAACTGCTTCATCCTTGG TTAGTTTCTTATCCTCCTCTGCCCCTTATGCTCCTTTTTCTGGTTTAAAATTTTGACTATGAAGTTTTTTTGTCGAGTTTTTTCCATTTCTTGAACTTTT GTTCTCCCTAACTTTACGGCCAATTTTGGACGTTTATTCATTTGACATCACAGAAAAGTTGAGTAGGCTCATTATTTGGTAATTGAGTTGACTGACTTGT ACCGTACCTCTTGTATCGAACCCCTTTTCACTGGATGGGGTGTGCAGAGTGGGAGTGATTTGGCATAACATATATCTACTATGATGTATGATCAAGTACT TTAGTACATGTTCTTCAAACAAAAATTTGAAATCATTAATCTACTTGTTTTAAATAGATAGTGATAGTCCTAAAATGTTTTAATTTTTTATCTTCACTGC ATTTGTGTATTGATTCAGGTTGGGACAGCTGTGACAAATGCCTTAATTAATGCAAAGAAAGCTGTTGATAAGTCTTCTGCTGGGGAAATTGAAAATGTTC CCATATTGTCTACCAGTGCTGCCTATGGTGTCTATATGGCAGTTTCTAGCAACCTCAGGTATCAAGTTCTTGCTGGAATTATTGAACAGAGGATTTTGGA ACCTCTGCTGCACCAGCACAAGCTTATACTCAGTGCAATGTGCTTTGCTGTT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_153472; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_525254
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Protein RETICULATA-RELATED 4, chloroplastic from Arabidopsis with 76.4% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019456009.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |