| Id Trinity | TRINITY_DN47665_c3_g1_i2 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_359802 |
| Sequence | TTATAGGTGTAGATACCTGCACATATCTGTATCTTTTTCTTCTTTGTCCATTTTGGTTCTCTTAAAAACTTTTTAATTTTATTTGTTTTGGTAAGATTCC ATCCACCTTTCAATTCTGCTATATGAGTACCAAAAGGACATATAATAGGTCAGTGTGGTTTTGATTCTACCAACTGCTTCCATGTATCACCATATATGTC TGTGTGTGATTTATTCCTCTATACATGCATTCTGGGATCAATCTCCATCTAACTGTACTGGAATAATGCATGTCAGACAAGTTACAAGTTTATTCAAAAA TTCAGTCTGAAAATAAATAAATAAATGAAACCAATAATGAACATGAAGAAGGAGTGTAACTGCAGAAGTGTATTATGCATATACGATATGAATTATGATG CAGCTATGGAATTTCATTAATTCCATCAATTTGAATTGAACTCATATTGGGGAGAACAAAATGCTATATAGGATTGGTAAGCGTATATTTTATGGAGAAG GTAACGTTAATTTAGACTTTGATTTGTAGATAACTATTGAGGAAAGTTGGAGGACTGAAATGATTATGGTTATACAAGAAAGGTTGGTTTCTTAGGTGAA GTTAGTATGAATTGCAATAATATTTTCTTTATATACCTGTAATTAAGACTTGTGGTAATAGAAGAGAGTTATCTGATATATGTCAAATCCACATTGGACC AAAATAAAAGCAATAATTTGGACATCCATTTCACCTACAGCTAGCTTTTAAGGTCATGTTTGGCGATAAAGATGAAGAAAAGAACATAATATCTTATCCA ATATTTAGAACATACAAATAGAGATGGTATTGGTGTGATGACATCATATCTTATCCAATGCTATTTTTACAATGCATGATTTGACAGCACTTCCACCAAT TCTTGAACTCCAAATATTTGGTTATGCTACACTTTATAATATTCAATATCTTTTTCATATTCTATTTTCTGTTTGCTAATAGAAGTTAATTAAGATTTTG GGGATTAAAATAGAAAGCCCGGGTCTCTTACAGATCAGGCCCACTGGGAAAATAATGTGCCTTGCTTTCATTTTGGTCCTAGTATATGACAACAACAAAA ATAGAATTTAATTTTTTGGTAGTAAATTAGAATGGATTAGTATAATATGCAAGTCAAAACTAAACGCATTAGTATTATACAAGGCTGGTCTTTAATTATT GAGTTTGTAGCACGGTATCCCAAGATGGTAAGTATATCATCCAAAGGGTGGTGAGCCGGGGATGGAGATCACATATCCCAAAACATGTCCCCAACCATGT ACCAAGTCAATCAGAATGAAGAAAAAATAAATGAAAATATGAATTTTAATTTTTTTGACTGATGTGACATGTTGTTATTTGTTTGGTACAGGGTTTGGGA CAGGGTTTGAACCAGCAGATCCTGGTCCCCAACAAATATGTGGTACTTATCTCATCATGGATTTCAAACATACTAATCTAGTGACTAGTGACCTATGGTG ATAGTTAATCAAAAGCTTATGTCTATTTCTCTTGCAACAAAATCATCATGTGATAATTGAAAGAGGATATATAAATACAGTGGTTTTTTGTTTGGACCAT ATTCAGTTATGAATAGTCAATACTTAAAAATGTTTTGTCCGAGTGATTGTACATTCTCTTCTGGTAATTATATATTCAGAAAATTGTTAAATTAAAAGAA CTCCTATTTTCCATAAGGTACAAGTATAATAACATAGAGATGTTGTCTCTGTTTCACTCAATGATAAGGAAACAACAAAGACAAAAAAATTTAATTAGCA TAACATATTATATTGACACGATATAATTTGAGACAACATATCTATACTATGAGTATATATAATCTTTCACCTACAATTTGTCCCTACCCGTTACCAATAT TAACCAAACCACCCAAATATGTAGTGAATTATAAATCGTCCATCTTTGAATGATTGCAGTGAAACTTCAGAGGAATACGTGACAAAGTGCAGGGAATTAA TGCGGGAGTTGCTAAAAGGGATATCAAAAGCTTGGGCCTAGAAGAAAACTTCATACATGAAAGGATGAATGTAGAGTCGGGCTCCCAATTACTGGTTATC AACTTTTACCCAGCTTGTCCAAATCCTGAACTTGTAATGGGCCTACCAGCCCACACAGATCATGGGCTTTTGACTCTCCTCACTCAAAATGAACTTGGTG GGCTTCAGATTCAACATAATGGCCACTGGATTCCTGTGAACCCATTACCCAACTCCTTCCTCATTAACACTGGGGATCACTTGGAGGTAAATGAGCTATA TAACTTAGACATCATGTTTTCCTAAAATATATGTTTTAGATCGATATAACATTACTCTTTGAATAATGCTCATGTTTTATGAGCTATGAAATAGCAAATG ACTATGCATGTGCATGTGTTGTTTTTATTGTCAGATATTGACGAATGGGAAAATCAAGAGCGTTATTCACCGTGTGTTAGTAAACAATAAAGGAGCTAGA ATTTCAGTTGCTACAGCACAAGGACCACCACTTGAGGCCGTGGTGAGCCCCGCACCGGAGTTGGTTGACGATGATAATCCGGCTGCATATGGCGCCATTA CATATAGAGATTACTTGAAGATTCAAAAAAGCAATGAACTAGATGGGAAGTCATGCTTGGATCGCATTCGTATTTGAATAAAAATTGCAATCCTCCTTTC ATTAGTATCGTTACATTGTTTATTCCTTGGAGCTAGAGGTGCTTTCTTCATTGCTTTCCCTCCTCATTAATATGTTTATCACTAAATTTGCTTTCCCTCC TCATTAATAAAAATTGTAACCCTCTCACTAATATGTTTATCACCACCACCCCATTACTCAACTCAATTTGCTTATGTATTTATTTGGTGAAACCGTTTTA CGTGTCATGTAAGAAACCAAACCTTTAGTCTGTATTGTATTGTCTTCATTATATGTCTGAATTTCTTTTGTAGTTTGGTGAATGTGTCTTTCTCAAATAT ACAACATTGTCACTTACAGCGACAAAATTGGGGGTATTAGAAATCGCCACACCTCAACGTTGCTTTTTAACTGTGCTTAAACTGGATTTTTGAGTAGTTT AGTTTAGATTCAAACGAGTTCAAAC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_154495; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_359802
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Protein DMR6-LIKE OXYGENASE 2 from Arabidopsis with 45.26% of identity |
| Eggnog | 2OGFe(II) oxygenase(COG3491) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT4G10490) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019459248.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |