Ll_transcript_442807

Id TrinityTRINITY_DN47879_c1_g1_i6
Name TranscriptLl_transcript_442807
SequenceCCTAAACACATGCATTTGAAAAAAAGTTGAAAATGGAAGAGAGGAAAAAATAACAGTACAACATGTCCCCATAAAATTATATACAGACCACAGCAAGAAC ATAAAGGACACTCTTTTCTCCTTTTTGCTTCACTTTTTTCTTCACATTCCTTCCATTTTTTTCTTTGCTGATTCCCCGTGTCAAAAATCAACACCCTTTT CACTCTTTTCCGTGTCTTACTTTTCTTTTTCTATAAAAACCATTTCCCCATTACTAGGGTTTGAAATGTGGAGGGAGAATGGAACCCTCTGAATCCGATT CTGCTCTTGTTTCCATTGGTTCTTCTGTCACTGACCCTCAATTGGGTTCTCAATCAGCACCGTCTTCTATTCATTCCCATCATGATCGCGGTCCTGAACC CTCAGATCTCAGTCATGTGACCCAGGATGAAGAAGAAGAAGCACTTGGTGCAGAGCTTGAGACCAAGTTGGATTTGAAGGGTGAGGGTGAAGTGGGTGGT GAAACTGTGGATAAAGTTTCGAACTTTGATGATGGGGAACAAGTATGTGATGAGGGTAGTGGTGGTGGTGTTATTGAAGTTGAAGAATCTGTTAAGGTTA ATGTGAATGATGGGTTTGGTGGAAATATTAGGGGTTGGGATTGTAATAGTTGGGATGAGGATGTGAATGATGGTGTGAATGTGAATGAGGGTTTTAATGA GTATGAGGTTGGTGGAGATGATTATGCTGTGAATGATGGTGATTGGGCACAGGTAGAAGACAAAATCAGGGGTAGAACTCAACATTACCCTTTAAGGCCT GGTGCTGAGGATTGTGCATATTTTATGAAGACTGGGAATTGTAAATTTGGTTTCAATTGCAAGTTTAACCATCCGATCCGAACGAGAAACCAGGTATTTA TGCCTTTCTTCCTTTGTGTATTATTGAGATTAGTATCATAGTTACTCATATTCTGTACCTAAATGAACGATATCACGTATTGCGTATCAGGACATCAATA GTGGTGCATTCATTTAGATAGTACATTGTTGAGACTTGAGATTTAAGCATATAATACACTTCTGTGAAGGTTATCAATCTTTCGATCAAAGATTTCTTTT ATGTGTATGGTAACATTGTATTATTATTGGAAGAAATAGAAGAATGACATTTTGCCTCTGCTGAAGGTAGTACTTCTGATTGGTACTCGGATGACTCATA ATAACTGTTTAACTCTTGTTAGTGCATTGTCCGATGTGACATTTATTTAATAACTCCAATAGGGTAAAAATAAAATAATAAGTAAAGGTAGTACTTTCTA AGGGATAAATGCATATTTGATTGAGCATCTATTAGTTTATTTTTTGGAATTGTGTTAATAGAAGCATGTTATACATGTTCAGTTCTTGAAAGTTTTTTTG TTTTGATGTTTTAACATTAAATGAAGTCTTTAAAGGATAAGGCAGCAGAACGAGAAGACTCAACAGAAAGATTGAGCCAGACAGAGTGCAAGGTATGGTC TAAACAAATTTGTTCCAAGCTTTTGTTTTCATGTTGTGTTATTGCAACATATTATCCTTTGCCTTCTATGTTCATGCTTATAGTACATATTCCGCTAGTT ATTTTATGTCCTTCCGTGATAGTGAGATAATTTATATGTTATGTGCTCAGTTTTAGCTATGGTTATATTAGCTGTCGTGATAATACTAGTGAGTAGTGAC TTAAGGGCCCCCAGGATTTGACTACCCGATGCAGGACTGACAAAGTAATATAAATACAATGTATTATGCATTTGAATTACTTCATCACTAAATCGTTAGT AGTGCCTGAGAATTAAGAAATATCACTTTTGGTTAGTCATGTATGTATTGTTGTTAGTATACTTCTGCATTAGCCATTGACAGGGAAAACAAAGAAGTAA CTGTCATGGTTTGGTTTTGACATAGCATAGTAGTTGGCGAAGACGCGAAGTTCTTGGAAACAGTTTCTTCACTTTTGAGGGTAAGATTGCTTACATCTAC CCTCCCAGTCTCAACTAGGTGGGAGTCCTGTAGACTGGGTCACCCTTTTTATATTAGTTGGCAGATTTCTTTCAGCCTTCTTGACACTACCCTCACTAGG ATAATGTTGACAATGATAATAATTTTCATATAAAGATATATAATAGCAATAGTATAGCAGCAAGTATATAAACATGGATGGATGAAAAATTTATAAATAA ATGTTTTTTAAACTACATTAGTGCTAAGTTGAAAAATGATTGGACCTCTGAAACAACTCATAGCAAAAAGCATGATTGTCTATGATATTTGCATTTATTG TCTTCCCGAAACTTTATCTTCAAAGTATGGAATTATTCGTGATATGTTGATAACAATTTTTTTCCTGACTTTATTGCAGTATTATCTAAGGTCTGGAGGT TGCAAGTTTGGAAAGGCTTGTAAATATAACCACACAAGAGGAAAATATTCAGCCGCCCCAGTTTCAGAACTTAACTTTCTCGGCCTACCTATTCGTCTTG GAGAGAGAGAGTGCCCCTATTACATGCGAACTGGCTCTTGTAAGTATGGAGCAACCTGCAAGTTTAATCATCCTGATCCTACAACTATCGGGGGACCAGA TTCTCCTTCTGGGTATGGTAATGAAGGGTCTATTTCATTACAAGGTGTATCAAAACCATCTGTATCCTCTTGGTCTCCTCCAAGAACATTAAATGAAACA CCTTTTGTGCCAATGCTTTCACCTTCTCAAGGGGTTTCTCCCCGAAGTTCTGATTGGAATGGATATCAGGTAAATCCATAGATTCATTTATATTAACCAT GTAGGAAGAGGTGTTTTATCATATAGTACTAGACAAAGCTTTGTCTACCAGTTTTCTGTGATCCAATGTTATGCTCTCTGCTGCTACATATGATACTTTT TAAGTGCCCTGTCCATTTCTTTTTATGAGTGTATATTGCCATGCCATTTGTTCCCTGATTTCTTTTGGAATGATTTTTAGTCTGAGATTCTGTGACCTGT TTGTTGTTGCATGCATGTCAAGAATCCTGTGTTTTTTAATTTTTTTGTTTGTATAGTGAATACTGAACAGTGACGCGGGTATGAAGCTATTTGACGTTCG AGATTTATATACTTAACATCAAATACTTAAAAGTTAGAAGTCAGATTGTTTTTCTTTAGGCCCTATTTTGTAGCTCTGGTGTGTAATACATTCTGTTACA TATGCACGCATATTGCAGATTAGGTATGGACCTTTGGCTTTGTTTGTTTTGATTCTTATGGTGTAATATTTGATTGGTATCCAACACAGGACAGGATATT CTTTTATTTATTTTCTATGCATTCACTATCTGCCCGTTGAATTCTAACAAGATATATTTTCCCATCAATTTGACCTGTTTGTTTTTTTAAAGGCACCTAT GTACCTATCTGATTGGAGTATGCATCCACCTTCTGCATATGTCATGAGCAATCCAGCAATTGAAACAAATGTTTATATGCAACGTCAAAACCAGATGCCG GTTGATGACTTCCCAGAGAGGCCTGGTGAACCTGAATGCAGCTACTTCTTAAAAACTGGGGATTGCAAGTTTAAATCTAATTGCAAATTTCACCATCCAA AGAATCGGACTGCAAGATTACCTCCATGCATCCTCAGTGACAAGGGTCTGCCTTTGAGGCCTGACCAAAATATCTGTTCACATTACAGTCGCTATGGAAT TTGCAAATTTGGACCAGCTTGCAGGTTTGACCACCCGATAGACTTGCCTTCCCCGGTGATTCCAGCATTTGATGAGCAGTCTTTTACAAACTCACCTAAT GTTGAGGTGGCTGGGATTGGTGGAAGTGCAGATGCAAGTGATGTGACAATTCAGCAATATGTATAAAGATCTTTGTCAAGTATCTTCTAGCTTTTTGAGG ACTCATCACCCAGAATTTTAGCTTTCTTCTTAAACTTGATAAATCTATTTAACTTTCTCTGGCTCTGCCTTATGCAACAGAAGCTTTGCAGATAATAGCA ATATATATGTCAAACAGAAGTTTTATGTATTTATTACAAGTAACAACAGCACCTGTAGGCTAATGTGTGTGAATGTGAATTTTCTTGATTTACTAGTGCC AATGGAGTTATGAACCTTGGCTATGGCTAAAAGGATGACTGTTACAGGTAAGCAGAGGCCCCCATAAAACAAAGCACTAACGAGCCACGGGTTGGCTTAT ATAGTCTCTTGATTCTCCTCATGGTGGTTATTTTGATTCTCTGACATGATTTTTGATGTTTCTTTTCCCCATACCCCACTAAGTAGGAGCTTTGTGCAAT GGGTTGTCCTTTTTCTTATATTGTCTATTGTAGTTGTGCCTCTTAGCCTCCTATAGATAAAAGACCATTGAGCTACAACGCGAATAAAAGAGACTCCAAT AAGATCATGGAACGGAAGTTCACCACGAGTCCACGACGACCCTCTGGCAGGTTGTTCAATCTAATGATTGTGCAAAGTTAGCTAGAAAATCTAAGTTGCC TGCCTTCCTTCATAGCGTGACTGTGTGGAGCTCCTAAGGTTGAGATTTTAACTCAGCAATGACAATGATAAAGTGTATGGTTGGGTGTGAGATCACCCTT TCATCAGAAGGCCAACCACAACTGTAGAAACACTCTTAAGCCAAGGTGAGAGATGTAGGAATCCCCCATTCTTAGTCATTAACACACTTTAGAAGCTAGA ATTCTGAACAAACCTTGCACCTTCACAAGTTGCTCGTCTTCCTCCCTCTCTAGAACCCATCATACTTCACTTTCACTCACTGGCCACTGGTCTGGCAAAA AACATGTGACAAGCTGAACTTGCCCGGAGGACCCATCGTCATTGCCCGATTGCACCCGGTCTAAATCATGGAGTAACACATGAATTGAGATGATAGATTT GATCACTTTTCATGTTAGCACACTATAGCCAAAAATAAGTTTATCTGATAATGTGTGTGGTTATGTAGTGCTTGCTACATTTTATTGGAACGGTACATGT GTTACATACACTTTAATAGAGTGGTACAATTCCTTTGAAGTACACAAGGACATGTACAAAGAGGAATCTAGATCCTCACCAACACGGGATAAAAATTGTA TAGATCCTCTCCAGCACCGGATAAAAATTGTAACATCTTTGGGGGAAAATGTTTGCAGTTATGGGTTTACTGTAGGTCAACATCTTACTTGCAATGTCAA GAAATACTATTGTTCTTATTATTACTATTTTAAATGTGATGATCTGCTTTCAAATTGAGTAGTTTGTTATGTACACTTGTATTGTTTCAAGTACATATAA ATTTATCAACGGACGTTGGTTCAAGTGGTACATGCTTGATTCCCCTTAAACAAGGTCTCGGGTTCGATCC BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_156286; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_442807

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_442807

BlastpZinc finger CCCH domain-containing protein 43 from Arabidopsis with 44.3% of identity
BlastxZinc finger CCCH domain-containing protein 43 from Arabidopsis with 62.3% of identity
Eggnogzinc finger(COG5063)
KeggLink to kegg annotations (AT3G48440)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019457493.1)
PfamZinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar) (PF00642.23)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;