Ll_transcript_327456

• Id Trinity: TRINITY_DN48037_c2_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_327456
• Sequence: TTTGGCTTCCTTGGAGCCGCAGCTGCACTTGTTTTCTCTTGTAATTCATTCTCTCTTTTCTCAATTAGATCTATATTCATATTTTCACGATTTTTCTGCT TTCTTTCTAATTTCATTTTATAAGCAAATTTTTGATGTTCCAGGCTCATAGTCGTATAAGGTTTCCGATTTTATCAGTAGTTTTGCTTGCATTCCGATCC CTTTGAAAATCAATAAACTTACTGAATGATTTTTAATTTTATAAATATATGTTGTGTTTGTTCATTTATCTGTTATTTCTAAAACCTAAATTCAAATCAA AGCTTATTTTATTTATTTATAAACTATAATTTAATTTAATTTAAGTAATGTCATGGTCAAGCAGTTATTTCTCTTTGGTAGTTGGCATTAATTGTTTTGA AAGTGATTAGTATAGGAACCATTTAGTTGTATAAAAGATTGTGATATTCTCTATTAGCCCTTTGATCTAAGGGATTTATCTCATTACGACATTTGTTTGT ATTGATGGAAGGTATGGGAGCTGCCTATGGGACCGCAAAGAGTGGTGTCGGCGTAGCGTCTATGGGTGTGATGAGACCTGAACTGGTGATGAAATCTATC GTCCCTGTTGTTATGGCTGGAGTGTTGGGTATCTATGGTCTTATTATTGCTGTTATTATCAGTACTGGCATTAATCCTAAGGCTAAATCTTATTATCTCT TTGATGGTTATGCGCATCTCTCGTCCGGTCTTGCCTGCGGGCTTGCTGGTCTCTCTGCTGGTATGGCTATCGGTATTGTTGGTGATGCTGGTGTTAGGTA TAATTTTCTGCCTTGCTATCTGAATTATTGACGTGAAATAATTTTTTCAAACCGGTTCTTAGAGAACAACTTATGTTTCTCTTGACTATGCTGATTCTAG AGCCTATAGTAAATAAACTTCTTATACACCCTAGCAATCATTTACTCATAGTTAATAGTTCACAAGCAGAAAAAAGAAATCTGAAATGGACCTGCATGAA GTGGTGAAAGCTAACAATATAGAGATCTTAAGTAAGATTGTTAGGGGTAGGTAAACATGTAAAAGGTGTAATCGGAAGATCCTACATAACATTAAAATAT AAACATATAGATATAAAAAAATAAACCCGTTGAAGAGTTATTTCTCTCTATTGCTATAAATCACAAAATTAACAGCCAAGTAACATTTCATTAAATTTAT ACCCTTCAAACATAATCACTGGCTCAACAGCAACTCAACTTGATAAAAAAAAATCCAATCTCCCCTACCGTCACGTCATGTTGGGTTTGAACAAAGTGAG AAAATGAGGGAGATAATGGCGGACAGAACAATGGTTTGAAAGGCAAAAATGACAGTTGCATGTGCTAGTTCTGATGAATAAGAAGGAAAATGAGTGGGGT TTCATGGGAGCTCCAAGGAAGAGGGGGAATTGAGTGGGGTTTGATGGTCATGTGGGGTTTCACGAGATTTTTTTATCTCTTTGAATATTTTAACCCAAGA TGGGCCCATGTCAAACGAGTTGTGGTCCTGATATTGTTGCCCCATTACTGATCAATAGGATCAGACAACTCTTTCCGCTTTTACAATCTCATGAGGTAGC TCGGTGATACCACCTGCAAGGCTGCAACTGCAAGATCACGTTTCAATCGAACGCGTGCATCACCAAGATCCGTGGAAGTGTTGAATCAAACGATCTTATG TGATTTTGTCAACAGTGGTGAAATAATTGTGGCATGGGATGCTTGGAGTTTGCCGGAACAAAAACTAAAAGTCCATAGAAAAAGAGAGGTATCGGCTAAG AATAGGTGCAAATGTGCAAAATAAGATTTCACCTTATATCAAGGTAGCAGTCGCAGCTGGCTGTGATTGAAAAATTGTCTGACACACAAGTACACAACGC ATCACGGCCTAGCTCTATGTGCTCCATCGACTGCAGAGCACTCAACATGAAAGCTATTCTTTTCTATCATTGAGCTTATAGGTCCATGAGTACTTATTCA CACTGCATAAATGCTTTATAAGGAAGTACATGTTAATACGTTCCTGGGCTTTTTAACCATCAAATAGGCTATGATGATTGATGGAACCTGCATTTTTCCT TTACTAGACTGCATTTGTTGTGAATTTTATACATGATTTATGATATAACATTATTGTGTCGTTCGATATATATAGGCGACCCTACCTTATGGGATAAAAG CTTGGTTGTTGTTGTTGGAAATTGCATTAACTCCTATTATATTTCCTCCCTTGAGTAATTTTTATTCTCCTTCTGCAGAGCCAATGCACAGCAGCCAAAA CTATTCGTGGGAATGATTCTGATCCTCATCTTTGCTGAAGCTCTTGCCCTGTATGGTCTCATTGTTGGTATTATCCTGTCTTCTCGTGCTGGTCAGTCTA GAGCTGACTAAGAAAGGAGCACATTGAAAAATTCTGTGTACCCCATCTGTTTTATCCTTCTGATTAAAAAGGGTTGGGGAGGGGGCAAATTCTTAGTTGT GAGGTTAGTAATGGTCGGACAGCACTTGCGGGCTTCAACAATTACTTATTTTAAAGCGATTGCTTCACCAGCCATTTGGTGGTGTTTATTTGTACAAGTA GTCCTTCTTTGCTGAATAATGCTTCTTAAACTTATTTTTTCCTTATGAAATGTATTATGCGATATAATGGTTTACATTTTATCTTTTAGCTGCTGAAACT GGTGCATGTAATGATTTGGTTGCAATGTAATTATATGCATTAATGGGTCTTTCTTATTGGATATTTGTAGGCGCCTGAATTATACGTGCGTAAGTATGGT AAATATTTAAAATAAAAAAAGTAAAGTAAGATATGTATGGCACTGTTGTTTGCTTTAGTATTTGAGCCTAGTTACTTGCGCAACATGGGAAGCTAATCAA CGCTGTATTTGGCATTATTAAATTCTATCCATCTTGTTTTGATGGTTATATTCACTTTCTGCAATTTTTTTTGGTGTACACTTCTCTGATATTTAGTTGT CATTGTACTTATCTTTCCTTGAGCTGTAATTAGTAATTACACTCATCTACTTCAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_157658;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_327456

FPKM

• PAB: 0.1
• PNAB: 1.1
• PS1: 0.4
• PS2: 0.2
• PS3: 0.3
• PW1: 0.2
• PW2: 0
• PW3: 0.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_327456

• Blastp: V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit from Gossypium with 98.97% of identity
• Blastx: V-type proton ATPase subunit c4 from Arabidopsis with 98.97% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (107898580)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_020978713.1)
• Pfam: ATP synthase subunit C (PF00137.20)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;