Ll_transcript_327513

• Id Trinity: TRINITY_DN48049_c0_g3_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_327513
• Sequence: TGATTAGATATCTCCATTTTAATTTCAACCTACTTTTTCATTCTCTTTCTCTTCTTCAAGGTTCACATTCTTCTCTCTTTTCTTCATCTCCTCTATTCAT CTTTCATTCTGCATTTTCTCTTTTTCTTAACTTTTCTACTCTTCAATGTGCCCTGCTATTTGTTTTCAATATTCTTATTCAACTGTGGATGCTGATACTG TACATTCATTCATTCATCATCCTTAGGAGATCTGTTTCTTTTACCACCATGAGGATTTTTCTTCTCACCATGGCAATATTGAATACTTCAACTTAATTCT TGTTGTTCATTGTTTTTGGATTATCAACACTTTTTTTAGAAACATAACTATAGTAAATAATTTAACTTTTAGGGTTACATGGTTGTTTTGTTTGGTTGAG GATTTAATCTAAGGTGAAAGGGTGGCTACCCCGCCCTGGGTGCACATCTGCTGTCTCATACTTAGTACCACCACTCCATGTGTCATGGATGAGGATCACC TGTCTCCGTTCATGTCCCATTTGGTGTCCCAACCCGATAAGAAAAATACATTTAAGTAAAATGAAAAATTGTAAAAACAAAAATACATATTTTTACATCA TTCTATGTTATTCTATTGGTATGGTACATGAGGGCATGCTTATTTTGGGACAGAGGATCCTTGTCCATGTGTCATGGTCTTGTGATTGGTTGAAAAAATA TATTTAAGTTGAAATTGAACTTTTAAATAATTTTTTGACCAATTACAAAGCTATGACACGGAGTGGTACTAAGTGTGGGACAACAGATATGCACCCTTGC CCTAAGCTCAACGACTGAGATATGAGCATTACAAATTACAATGAACATTAGATTGTGTCCTTAGGCATCACAATGCAATCATCATATCACAGATTCACAT CATCTGGGTAGGTATGTTTAGTCTTTCATAGTTTTGGTTGGTATACTCGTAATGATACCATGAGCGCTTTACGGCGCCCAAAGATATGATTTCAAATATT GCCATCAGTTACAACTCGTCTTTGCTCCATGGACACAAAATACCCACATGTTAGCACCAAATGCAATGGCCCTGGTGCAACAAGCACCGGATTTTTATCG GATTCGAACCTTAAAAACTTGGTTGTTTTTACCTCTTTCATTTCTCATGCAGCTCATGACTCTTTTACATAGCATAGGTTGGATAGTGGATAATGCAGGG CAATGGATGATCTTTAACCTTTTCTTGATGGCATGAAATGTTTAATGAATTTCATCATTCATGGTGGGTTGGAGTGGGAGATTTTGCAGATGTAGCTGAT TTTTGACCCATTTTTTAATCTTTTTGTCCTCAATGCTAATTTGTGTAGGAACTAATGGCTTCTGAGAGGGAAAGTTTTGACCTCTCAGGACCCCTACATC TAACCTATATCGACTGGTAAGATCTATTGAACAAATATTCAATTTCTTTATTAATTTGTGTACTTGGATAAATATCACTTTTTCAAAATGCCTTGTGTTC TGATATTAAGTGTTTCTTCACCATGTCTGGTGTCTCAGTTTGATTATAATTGCAAATGTTCGGTGTAGCATAGTCCATAATCGTGTGTTCACATAAGATA TCAGAAAATATAGTCTTTCTCATTATTTTTTTCTTTTGGTTATTCTTTTTTAGACATAGAGCTTCAGTATTGAAAATACTTGCTGTCTTGGTTAAGATAA TTTTAAATCCTAAAAGTTGCGTCTGAGGAATGTTTTTTTTGGCTATCGAGATTTCACTAATGAAGACTCTATGAACAACAAAATGCCAACACTGTATCTG ACACCATAACTTCAGAACTTGGATTTGGTTGTACCTGTTGATTTTTAATTTTAGATGTGCAATTAACATTACTCTTTCACTAATACAAAATATGGTTCCA TCTTATAATTCAGGGATAATATGTATCATCGAAAGTCAGTGGCTGCTAGTTTGGTCCAAGGTGTCTACATTCTAGAAAAGGACCGGCAAGAACAACGTCA AAGTGTCAATGCTCTTGCACCACCTTGGTGGGCGTTCTTCAACTTTCAGCTGCACAGTACACTTGTTGATGATGTTGATTCTTCTATCTTTGGTGCAATC TATGAGTTCAACCCTCCATCATCTAAGTGCAATGACAATTTACATAGAAGTCCACGTTATGTGATTGCCTTTAGAGGGACTATAACCAAGGCAGACTCAG TTTCACGTGATATTGAGTTAGACATGCACTTTGTCAGAAATGGCCTTCATCAAACTTCTCGTGCCGAGGTAGCTATCCAAGCTGTTAGAAACATGGTAGC TAGTGTTGGTGATACACATATCTGGTTGGCTGGTCACTCTTTAGGATCAGCAATGGCTATGCTTACTGGGAAAACAATGGCCAAAAGTAGCATTTTTATT GAATCTTTTCTTTTCAACCCTCCATATGTATCTGCTCCAATTGAGAGAATTAAGGATAAGAAAGTGAAACACGGTCTTAGAATTGCTAGCAGTGTCATAA CGGCTGGACTCACCATTGCTATGAAGGCTAAGCAGCAGAAGAAGGGTTTGTCCTCCTCCTTCGATTCCTTCGATTCTTTGTCTGCATGGGTACCATGCTT GTTTGTGAATCCATCTGACCCTATTTGCTCAGAGTATAAGGGATACTTTGAACACAGAAGAAAAATGGAGGAGATTGGTGCAGGAAGCATTGAAAGGCTA GCAACTCAAAACTCCATTGGTTGTTTAGTTATGAGTGCGTTTGGGAAGGAATCTGAACCCTTGCACCTTATTCCTTCAGCTTCTCTCACAGTTAATTTGT CTCCTTCAAGGGATTTTAAAGAAGCTCATGGAATTCACCAATGGTGGAAACCTGACTTGTGCCTAGAATCCAAGCTCTACAAATATTAATAGTTCTTGTA GTTACAGTCTTATGTAGTGCTGGAGTATTGCAAGATGCATGCTTTAGGGAGAAAGTTGGGTTGCACCTGCCTATTGCAGATAATGTGTTATGACAGAATA TTATAGTGTGAGTGTCATTTGACCATGTACCCAATTCCAAGCAGTGGTTGTTGTTGTTTAAACTTTAAAGTATGTGGTGCTGTGGTGATTGTGATTTTCC ATGTGAAGTTAATTTTGATACATAAATGGCTATTGCAACTTTTCAGAATGGTGAGGCCCATGAACCATGGATAGTATATGCATTTATTACCTGAGAACAA ATAGAGTAAACATTTATACATAGATACTGTATCATTCACTATTCATACGAAATGAGTTTTATTTTAATTTATTCAAAATGGTGTTGAAATGTCTTTTTAT AATTTAAGATCACCTGTTTTGTTTGTAATCCTCTTAGAGGATTTTGTTAACATTTTCCTTATTCAAAAAGGACAAGTTGGAGTTGATAATTAATCTTTAT AAAATTCATGTACAATGTTTTCAATTTTAGTGAAGAGGTGC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_157755;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_327513

FPKM

• PAB: 2.3
• PNAB: 4.5
• PS1: 2.8
• PS2: 3.4
• PS3: 5.1
• PW1: 2.1
• PW2: 2.3
• PW3: 1.9

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_327513

• Blastp: GDSL esterase/lipase At4g10955 from Arabidopsis with 59.45% of identity
• Blastx: GDSL esterase/lipase At4g10955 from Arabidopsis with 59.39% of identity
• Eggnog: GDSL esterase lipase(ENOG410YP6W)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G10955)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019423364.1)
• Pfam: Lipase (class 3) (PF01764.24)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;