Ll_transcript_302348

• Id Trinity: TRINITY_DN48227_c0_g2_i9
• Name Transcript: Ll_transcript_302348
• Sequence: AATGGATTCTCCTTACTTCTCTCTCTTCTTCATCTTTTTTCTTATCTGTTGAATGTTCTGGTGAAACCTTGTATTCTTCTTCAGCTCCTAATTTTCCTCT TGTTTTTGTTGTTGTTAGTTAAACCAAGTAACTGAACTCTGTTTTCCAACTTGTGTGTTAATCTTTTATTTTTAAAAAGATACAAACTTTCAATCCTTAT ATTTGGAGGGTACTGATTAGTTTTTGTTATTTTTCTTAGTCTTTCAACTTTTTTCAGCTTTAGCATTTTTCTTAAATTTGTTTTTACAATTTACTGTTTG TTTTTACTTTCAAGCCACTCCACTTCAAAAATTTCACTTGCCCTCTGTATTTTTTTTATCCCTACTTGATGTACTATGGTTTATTCCCTTTCAGTTATTT TTAGGAACTTTGTCTCTTAACTTTTCCACCGAAAAGTAATTATTACTTAATATAATGTATTCATACTCTGTGCAATGAATTATGAATGATTAATGTCTTG TCTCTTATGTTATATCATTGATTCTAACTCTCAAACCCTTGTTCCTCACATTGTTTTGTCACAATTTAAAAATCTATACTTGTTGCCCATTGTTGCTAAT TTCATGCATCTTTCTTTTCTTTTCTTTCCTTTAGGAACAAAGGGTATACCAAAACTGGGAGCTTTTTTGTTTTGAATTCTGACTCTGATGTCTTTGCCGA GGCTCGGCGTAGGGGAGGAGGGGGAGAGTAATGTGATTTTGTTGGTTTCATCACCAGCCAAAGAAAGTGTGTGTCTCAAGAGCTTAGAACTAAAAGAACA CAACTACATGGGGTTATCTGATTGTTCTTCTGTGGATAGCTCAGTTCCTTCATTCTCAGATGAGAGTAAAAGTAATCTGAACCTGAAAGCCACAGAACTC AGGCTTGGCCTTCCCGGATCTCAGTCACCCGAAAGAGATTATGATCTTTGCTTAAGAAGCTCAACTCAATTTGATGAAAAGCCTCTTTTTCCTTTGCACC CTTCATCCGATGATCATCATTCCCCAGCAAAAATTGCTGTTTTGGGTAACAAAAGAGGGTTTTCAGATGCCATGAATGGTTTCTCAGAGGGGAAATTTGC TGTTAATTCTGACACTGCTACGATACTTTCACCGAGGCCTTCTCCTAACATGGGATTAAAACCTGGTCCTGTGCTTGAGAGTGTTGCGGCTCATCAAGCC AAATTAAAAGAACTAGCAACAGCGAAGGTGGGACTCGAGAGGCCTCTTGCTCTTAATGAAACCAAACCAAGTCTTAATGGTTCTGCAAATAATAATAGCA GCACACCGGCTACCAAGGCTCAGGTTGTAGGGTGGCCTCCTATAAGATCATTTCGGAAAAATTCATTGACAACTAATTCCAAGAACACTGAAGAAGTAGA TGGTAAACCGGGGTCTGTTGCACTGTTCATCAAAGTCAGCATGGATGGTGCTCCCTATTTAAGGAAAGTAGACTTGAAGAATTACTCTGCATATCCAGAA TTATCTTCTGCTCTAGAGAAAATGTTCAGCTGTTTTACTATAAGTAAGAAAGAATTAGTTTTTATATGAGAAAATTTATGCCTTTGTATTATTTACGGAA AGTTTGCCTGGATCCAATTACTGCTTTTTTCGGTGTGGTTTCAGGTCAATGTGGATCTCATGGAACTCTGGGAAGAGATTTGATGAATGAAACCAAACTG AAGGATCTTCTTCATGGATCAGAGTATGTTCTTACTTATGAGGACAAAGATGGAGACTGGATGCTTGTTGGTGATGTTCCCTGGGAGTAAGTTCTAATTT TTTTACGTACTTGCTTTTTTATCCGCACTTCTTTAAAAAGAATAAATTCCTCGGAGACAGCAAATTTATTTTTAGTGAAGTTTTTTCGTCAACATTTTGT TTTTGGTTCATATTAGCTTGTCCTGAGAAGGAATGTTGATGGATGGTAGAAAAATGGTTTTGCATAAAGAATTGTACAAATCCAAGCAAGGTTTGAATAG TGAGTGTAAAGAATAATGCATATTTAGGCTCATAAGTAGGGATGGCAATGAGCTTCATAGTTGGTGTCTTGTCGGTCACTCCTATCACCAAAGCACTAGG TCTTAAAACTAATTTTTGTGACACCAATCCACGGACCTTGACAGCCATGGTTGAATAGTTGGTGATTGTCTTCTTTATGTTATGAACTGACTGGCTCAAT GAGCTTGAGCTGAGTTTGACCGAGTATCAAAATGAGTTCGTTTTATCCTTGAGCTAGGAAATTTTCAATTGAATAGATCACAACAAAGTGACTTCGTGGA CTTTAGGTTTACCTTTTCATTTCACCTTAAAAGGTCTTACAATTTTCTCCATACTTGATGAATGTGTAAAACAGGCCTAGCGTGCCTGGGAAGTGTGAAA TGAACAATAACAATGTATATGTTACCCATAAATTATCTATGCATATTAAATGCAGCCTTCTAGAGAGTATCATTACTATCATAAGAATGGCTTATGACCT GTTTATCAGATAGAATCAGTTTCAAGCCTAAAGAGTACATAGTAATATGATTGATGCATGTGTATGATAACTGAAAACCTTAAGCGTCTTGTATCACGTT CTATGACTCATATCATCTATTCATGTAATTTTATTAACTCGTAATGACTCACTTAATTTTATTTCTAAATACCCGGGACAATTTTCAGTAGTAAATATTT TTCTGGGGGAAGCTACAATGGAGAGCCAATTTTTAGTCACGGTGGTAGAAGAATTATATAGTTGTTAGGAGTTCCGCAATTAGTGACAATGCATAGATAG TATACTCTACTGAAACAGAAAAAATAATGCGTCGACACTGTCATTGCATCGTTCAACATTCATATCTAATCATCATTGACTCTATCTTGAATAATGCAAA TGAATGATAGATGATTTACTAATTGTGTACAATGAGTGCATAGATATACACTCATACCGAAGCATCAACTTTTGCGATAATCATTTTTAACTAGTAGACG AGCTAAAGCTATAATCTATTTTTTTGTCAAATATGGAAAAATACGAAATATATTTGTAGGCGTGTATGTCAGCTGAATTTTGATTAATTTAATGTTGATA TACTACCAATATACAAATTTTTGTGTGAATGTAGTAGCATGTTTTTCATTTTTCTACAAATTAATTTCAATCCAATGTCTCAACTCTTTGCAGGATGTTT ATTGAAACATGCAGGAGGATGAGGATCATGAAGAGTTCTGATGCCATTGGTCTAGGTTAATATTATCTACTTGAATGTTACAATTCCGTACTGAGTGTTT AGGGTTTAAAGTTAATAATTTCTCCGACAAGAATACAGTTAAGCATTCTGAATGTGGATTAATTGTTTTTGTAAAAAGTGATTATTTTTTCAATTTTGGA AAAATGCTCTATGGATGTGAACTCAGATTGTGGGTTAATGTTGTTTCTAGTTTTTGTATTTCAATATTTTGCACCAAAGTTATCTGTGAAGAAGATAATG AGAGAACCATAGTTAAAGCTATTTCACTTCAATTAATTTTTAACCTGCATTCGACTTCTGTTGATTTATACTTTAAAGCGAAACCAAAGCTATGTTAGGA ATTTTGCACAAAATATCCATGACTGTTAAAGAATTTAATCTCAGCTTATCTTATTAATGTTTAATTTTGTGCCAACTTGCAGCTCCGCGAGCTGTTGAAA AGATCAAGTGCAGGAACTAGATAGTAGCACTTTTTACGCTCTATACATTAAAAGTTTTTGGATCATTCCGTGGCGCAAATCAAGGATATGGTGCAGCAGA TTAACTTGGAGGAGAGAACTGAAGGCATTTCGAGTGGATCGACTGTCACACTAAGCTGCCTTAAACTCTTCGCCTTATACTATTCCGTCTTATGTTGTCA TGTCTTTTATGTTCAGTGAACTTTTTCTCAAGCTTGCTTAAACTTATAAAACTACAAGACCTGACTGTGTGTACTAATATGATATGTAAGTGAGTTCATG AAGTGGCTAAAGGAGCTGTAGCGTGTAAATTTTGCGTCGTTCCGAGTCTTATGTTTGTGCGATAAAAAACGGATTTGTTTGTTTAGTTATATGCCAAGTG CCTCATATATATTGTTTTAATATCAGTTACCCTTTGCTGCTTATCAATGTTAGAAGTTCTAACTCATACTTGCGTTGGTTTACCCTTGAATTCTACTGTT TTGGAATATAGATATAATTGTGCTTGTTGAATCATTGAGGTTTGAGCCTTTACAATAAACTATTAGATATTGTCAAATGTGTTAGATATGGTTGCTGGGG GATCCAGGAACCAAGCATGTGAAGCTCTGACCATAGGCTAAGGCTTGCAACAGTGTATGGATCTTCATGCTCAAATAGGATAATAATGCATAGCAGCACT ATGAGTGATTCTGAGCCTTTATTGGCTCTAGTTTTGTGAAAAGAATTTGAGGTTAATGATAATGTAGGTGAAATGCCTTGCATAAACTGACAAAGGTTAC TGGGTTGTCCAGTATTACTTGTGTTTTGAATGCTTCTACAAGTTGTAATATAAGTTTA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_159215;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_302348

FPKM

• PAB: 2.2
• PNAB: 3.5
• PS1: 2
• PS2: 1.9
• PS3: 8.7
• PW1: 0
• PW2: 0.2
• PW3: 1.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_302348

• Blastp: Auxin-responsive protein IAA9 from Arabidopsis with 48.75% of identity
• Blastx: Auxin-responsive protein IAA9 from Arabidopsis with 48.75% of identity
• Eggnog: auxin-responsive protein(ENOG4111VTJ)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G65670)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019417388.1)
• Pfam: AUX/IAA family (PF02309.15)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;