Ll_transcript_336516

Id TrinityTRINITY_DN48541_c6_g2_i3
Name TranscriptLl_transcript_336516
SequenceTTGACAGAAAAGGTGAGACCTATAATTAAACATAATTCCTCTACTTTTTGTGATTGTGCTCCACCTGGTAATATTGTTATGCACAAAAATTCCTCTATCT GTATGCAGGGAGATTTGATTTCAGGTGTAGAGATCTTGCCTCCAACAAATAATGGAGTTTGTATCCAACTTGATGATAATGCTACTAATTTTTCTACACC GGTTGAACCTATAGAAGCAGAAACAAGGTCTAAATTTTCTCTGAAGGAGAGGGAGACTATCATTCAAAAAAAGGGAGACAACAAAAATGTATTAAAAAGG TAAAACAAAAATAAGCTAGGACTGATTGGGATAATTTTTGTGTTGATCTTACAAATGTTCCTTTAATCTCTAATATGGATCAGACTTCATTGTCCTATGT GCATGAGGCTGTTGGCCAACCGGTGTCAAAGTTTTCCAATCCGGCTCTTTCTGCTGTTGTCCCCTTGGTCGTGCAACATGGTCCTTTAGTTGCTGCTCCG AGTGCTGCGAGTGTCAGTTGTGTGGCAGCCTTAGAGGTGTGGAAGTTAGGCGAAAAAATTGGTTTGTTAGGGAATGATAATGAAGATGAAATTATTCAGA AATTGATTGCTGTGGAGGATAGAGACAATGCGAAATTCGAAGATGCTAGAAGGAGGTCAAATGGTTTTGATGATATTAATCTCCATTAATATTCGTGGTC TTGGAGGGCGGTTGAAGAAGAAGGAGATTCGCGACCTTATTCGTAAACATAAGCCTGATATGATTTGTATTCATGAAACTAAAATCCCTGATGTAGACTA CTCTTTATGTTTGTCTCTGTGGGGCAGCGATAATTTTGGGTGGGCGTGCTTACCTGTAGTGGGTGCCTCGAGTGGTATTTTGACTCTCTGGAATAAATCC CTTTTTGTTTCCTACACAGTGAGGTGCAGAACTAATTTTGTGACGGTCAACAGGAAATGGACTCTTCATGATGAGCCTGCTAATGTTATGAAAGTTTATT GTCCTTATGACCTGGCTGGTAAGCGATTTTTCTGGGTGGAGGCTATTTTAGATTATCGTGGTCATGCTGATGAGATGTGGTGTGTGGTAGGAGATTTCAA CTCTGTACTTAATCAGGAAGAAAGGGTTGGCACTAGTTCTCGGGCGAATAATTCAGAGAGTGGTGAATTTGCTCAATGTGTGGATGATATGGAATTATTC GATCTTCCTCTTGCAGGTTCGAAATTCACTTGGTTCTTATCAAATGGTTTGGCTATGAGAAGGTTAGATCGTTTTCTTGTGAATAATAACTGGTTAATTA ATTGGGGACAGATGGTTCAACAATGTCTTAATAGAACTTTTTCTGATCATTGCCTTATCCTGCTTAAAAGTGACGTGCCTGATTGGGGTCCGACTCCTTT TAGAACAAATAACTGCTGGTTTTCTGATGATGTCTTTTATCAGTTTGTGGAAGATGAGTGGAAGTCTTTGAGTGTGGTTGGAAGGGGTTCTTTTGTTGTT AAAGAGAAGTTGAAGATTCTTAAGGGGTTTTTGAAGCGGTGGAATAGGGAGCATTTTGGTGTGCTGGATAGAAAAATTTATGATCAAGTGGCTATTATCA ACCTCATTGATGGTAAAGGCAGTTCTGGTGCTCTTTCTAATGAATATATCTCTACTAGGAATATGGCCACTGCTTATCTTTGGAGGTTCGCGAGTCAAAA TGGTAATTTATTACTTCAGAAATCGAGACAGAGATGGCTTCAGGATGGGGATTCAGATTCTAAATTCTTCCATGCAACAATTAACAGGAGGAGAAAGTCT AATGCTTTACTTGGATCTTTTCTCTGAGTCTAACTGGAATAGACCGACTCTTGATGGTATTGATTTCAAGAGTATCTCTAATGCTGATAATAGTTTCCTC ACGTTGAAGTTTGAGGAGGAGGATATCAGAGAAGCTGTTTGGAGTTGCGATGGCGATAAAAGTCCATGGCATGATGGGTATAATTTCTGTTTTATTAAAA AGTTATGGAATTGCGTGAAATCAAATATTCTTGCTTTGGTGGATGATTTCTACACTTATGGTAATCTTGTTAGAGGTTGCAATGCATCTTTTATTGTGCT GATTCCGAAGAACGACTGTCCACAAGGCCTTGATGAGTATAGGCCGATATCTCTTATTGGTTGTCTTCGGAAAATTATTTCTAAACTTCTTGCTGGCAGA ATAAAGAAGGTTATCCACACGGTCATTTCTGATTGTCAGATTGCCTTCATTAAGGGTCGTTACATTATGGATGGAATTGTAATTGCTAACGAGATCATTG ATCAGGCAAGGAAAAAGAAGGATCAGAACTGTTTTATTTTTAAGGTGGATTTTGAAAAGGCGTACGATTCGATGGACTGGAGTTTTCTGCTCTACATGAT GGAAAGAATGGGTTTCAGGGCCACTTGGAGAAATTGGATAAAGAACTGCCTTCAATCAAACTCTATTTCGGTTTTGATTAATGGGAGTCCTTTTATGGAA TTTAATATGTCTCGTGGTTTGAGGCAAGGTGACCCAGTGGCTCCTTTTCTTTTCCTTATAGTTGGTGAGGGCCTTGATGGTATTATGAGATCTGTTGTGT CTAAACAGATTTTCAAGGGTTATTCAGTTGGTAAAGATAAAGTTGTTATCTCTCATCTCCAGTATGCAGATGATACTCTCCTTATTGGGGAGGAATCGGT TGATAATGTTTTGGCTCTTAAATATATTCTTAAGTGCTTTGAGTTGGCTTCTGGTTTGCGCATTAACTTTCACAAGAGTAGCTTCATTGATGTTAAACGA AGAGGTGGGTTTGTTCAGATGGCGGTGAATAAGTTGTTTTGTTATGTTGGTGCAATTCCGTTTAAGTTCTTGGGTATCCCAGTTGGTGCTAATCCAAGGA GGATTTCTACTTGATCCCCCTGTTATTGAGTCTTTCAAAAAAAAGCTTTCCTTGTGGCAACAAAAGTTGCTTTCCTTTGGTGGTCAAGTAACCCTCATTA AGTCAGTTTTGTGCTCTCTCCCTATCTACTTTTTCTCCTTTTTCAAGGCTCCTTCTTCAGTTATCCATGCTCTTAATAAAATTCAAAGAAGGTTTCTCTG GGGTAGGGGTGAGGTAAGTAGAGGTATTAGTTGGGTTAATTCGAAGAGGGTGTGTCAGTCAAAGGAGGTTGGGGGTCTTGTGATTAAAAACTTGAGGGTT TTTAATTTATCTTTATTGGGTAAGTGGCGTTGACAGTTGCTTTTGGAGAGTGAGTCTTTATGGGTGAGGGTGTTTCGTTCTAAGTATGGTGCAGGAAGGG TTGGGGTAGAGGGTGGTTTGTTGGGTTTGGAGGGTTTCCGGAAGGGGTCTGTGTGGTGGCGAGATTTAGGTGGTCTTAGTGATAGTGA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_161925; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_336516

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_336516

BlastpLINE-1 reverse transcriptase homolog from Nycticebus with 24.54% of identity
BlastxLINE-1 retrotransposable element ORF2 protein from Mus with 26.7% of identity
Eggnog-
Kegg-
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019429814.1)
PfamEndonuclease/Exonuclease/phosphatase family (PF03372.22)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;