Ll_transcript_437129

Id TrinityTRINITY_DN48906_c0_g1_i10
Name TranscriptLl_transcript_437129
SequenceCTCGTGGGTATATGGCTAATCCCAATAAATTACGAAGCTGATTACTTGAACGATATAGAATCGAATTATATAGCAACAGAACATTGTTTGTTGCTTTAAC AATAAACAAATAGTAATGTTATATCCTCCTACTAAATCCTCATACTATAAGAGAGAGTAGGAAAGAAATGAGAATGAATAAAGCTAAAAGATGATTACTC GTAGAGATTAGATTGAAGTTGAAGTAGAGAAGAAAGGGATTTGAAGCAATGACTATGAAGATTGCTCCTCGCAGATGATAACATTGATTAGTTGATCTTT GTTTTGTTTGAATCAGAGTTTGCAGCTATAGAAGAAGAAAGGCTTTAGGTTTTTGTCTTCAAGAGTGAATTGAGACAACATTGCCAAGTTTTAAGCTTTT CACTGTGACACACAATTTTTGAGCACTTTTGACTAGATTAAGTGAAGATTATAGAATGGGTAGACATGGAGTGTTGAAAAAAGTGGTAGGTGACCTTTCA TTTCTTGATTCATCACCTTTTGCCAAGCTCTTAGACTCTTGTGTTCGGTCAAGGTCTGTTCTTGAAGCGCGTAACGTTCATGCTCGAATCATTAAGACCC AGTTTAACTCTGAAATCTTCATTCAGAACAGGCTCATTGATGCTTATGGAAAATGTGGTTGTTTGGGTGATGCACGCAAAGTGTTTGATCATATGCCCCA TAAGAACACTTTTAGTTATAATGCGATTTTAAGCTCGTTGGCGAAGGCTGGTGCTGTGGACGAGGCTTTGAATGTGTTTAATTCGATGCCGGAACGTGAT CAGTGCTCATGGAATGCTATGGTTTCCGGTTTTGAACAACATGATCATTTTGAAGAAGCTTTGAGATTTTTCGCTGATATGCACCGTGAGGATTTTGTAC TTAATGAATACTCTTTTGGAAGTGCTCTTAGTGCTTGCTCAGGTTTGAATGATTTGAATATGGGTGTTCAAATTCATGGTTTGATTTTGAAGTCGCGCTA TTCGTTAGATGTTTACATGGGTTCTGCTCTTGTTGACATGTACTCTAAGTGTGGTTTGGTGGGATATGCTCAAAGATCTTTTGATGACATGTTTGTGAGG AATATAGTTTCTTGGAACAGTTTGATTACGTGCTACGAGCAAAATGGTCCCGCTGAGAAAGCTCTAGAGGTGTTTGTAAGGATGATGAATAGTGGGATTG AACCTGATGAGGTTACTTTAGCCAGTGTGGTCAGTGCTTGTGCAAGCTTGTCGGCAATTAGGGAAGGATTGCAAATTCATGCTCGTGTTATGAAATCTGA TAAATTCCGGTATGACCTTGTGTTAGGCAATGCATTGGTTGATATGTATGCAAAATGCAGTAGAGTAAACGAAGCTAGGTTGGTTTTTGATAGTATGCCG CATAGGGATGTGGTATCTGAAACCTCCATGGTTAGTGGATATGCAAGGGCAGCTAGTGTGAAAGATGCGAGAGTAATGTTTACAAACATGACAGAGAGGA ATGTGGTGTCTTGGAATGCACTCATTGCAGGTTATACTCAAAATGGAGAGAATGAAGAGGCTGTTAGTCTTTTCCTCCTCCTGAAGAGGGAATCCATTTG GCCAACCCATTATACCTTTGGGAATCTACTTAATGCATGCGCAAATCTTGCTGATCTGAAGCTTGGTAGACAGGCCCATACTCACATTTTGAAGCATGGG TTGAGGTTTCAGTCTGGAGAAGAATCTGATATTTTTGTGGGGAATTCCCTCATTGACATGTACATGAAATGTGGACTGGTCGAAGATGGATGCCTTGTTT TTGAAAAGATGGTAGGGAGGGATAATGTCTCATGGAATGCCATGATAGTGGGATATGCACAAAATGGTTATGGTACAGAGGCCCTTGAAATTTTCAGGAA AATGATGCTATCTGGAGAAAAACCAGATCATGTTACTATGATAGGAGTTCTATCTGCATGTAGCCATGCAGGACTTGTTGAAGAAGGACGCCATCACTTC CAATCAATGTCCGAACATAATTTAGCACCATTGAAGGACCATTTTTCATGCATGGTTGATTTACTCGGTCGGGCGGGTTGCCTTGATGAAGCAAAAAAAT TGATAGAGACAATGCCAATGCAACCTGATGCTGTTGTTTGGGGATCTTTACTTGCTGCTTGTAAAGTTCATAGAAACATTACATTAGGGAAGTATGTTGC AGAAAAGCTCTTGGAGATTGATCCGTTCAACTCTGGACCTTATGTTCTTCTTTCAAATATGTATGCTGATCTTGGTAGATGGAAAGATGTGACGAGAGTC AGGAAATTGATGAAGCATCGAGGAGTAATTAAGCAACCCGGTTGCAGTTGGATTGAAATAGAAAGTCGTGTGCATGTTTTCATGGTGAAAGATAAAAGGC ACCCTCGTAAGAGGGATATCTATTCATTTTTGAAAATTCTCACACAACAGATGAAGCGATCTGGCTATGTTCCACAAGTTGAAGATGATGAGATTTATGA GGAGGAAAGTGACTCTGAACAAATTTTACATTATGAAATGGAAATGGCTGTAGACGCTGCAGTTGGATAAAATACTTCAACCTTTTTGCTAAGCATTATT TTTAGTGGTGATTCATTTATTGTTGCTAGTACGGATGGTGTGGGAACGAAAGTAATGCTGGCCTTTGAAACTAGAATTCATGATACTATCGAGATTGATC TGGTCGCAATTAGTGTCAATGATATTGTTACTCAAGGAGCAAAGCCACTATTTTTCCTAGATTAATTCGCCACTGGTCACCTTGTTGTTGACATTCCTGA AAAGGTTATAAAAGGCATTGTTAATGGCTGTCAGCAATCTGATTGTGTTCTTTTGGGAGAAGAGACTGCAGAGATGCCTGGTCTATATAAAGATGGTGAG TATGATCTTAGTGGTTGTGCGGTTGGCATTGTGAAGAAAGATTCTGTAATCAATGGGAAGAACATTGTTCCTGGTGATGTTCTTATTGGTCTTCCATCTA GTGGAGTTCACTCTAATGGTTTCTCACTTGTGAGAAGAGTGCTTGCTCAAAGTGGTCTCTCATTGAAAGATAAACTTCCTGGTGGTGATGTTACAATTGC GGAAGCTTTGATGGCCCCAACAGTTATTTATGTCAAACAGGTGCTTGACTTAGTTAGCAAGGGAGGTGTTAAGGGAATGGCCCACATCACAGGTGGTGGT TTTACAGAAAACATACCCAGAGTGTTTCCAGAAGGTCTTGGTGCTCTTATATACAAGGACTCATGGGAAATACCTACTTTGTTCAAGTGGCTTCAGGAGG CCGGGAAAATCGAAGATGCCGAGATGAGGCGGACTTTTAACATGGGCATAGGGATGGTGCTGGTAGTCAGTCCAGAGACATCAAATAAAATACTTGAAGA TAAAGACAATACAGAGAAATTCTACCGCATTGGTGAAGTTACAAGCAACAAAGGAATGATCTTTAGTTAATTTTGGTATTGAGTTTACTCATCTTGTATC TTTCTAATAATAACTTCATGACAAGTTTCACTGAGTGTTGGATCATAATGGGGGCCTATTAGGTTTCCTGACATAGATTTTAGGACAAATGCACTTTAGC ACTCTGATGTTGGGTCACTTGCTATTTAATATTTAATGCTTAAAAATGTGCATTTTCAGTTCTACATTTTTGAAGTGTGTAAAACAAACCCTCAGGCCTA AGTCAAGTTTTCTGTGAGAAATAACTGTAGCGGAAATGCAATTTTATTGCAAAAATCTCA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_164956; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_437129

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_437129

BlastpPentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600 from Arabidopsis with 69.48% of identity
BlastxPentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600 from Arabidopsis with 70.39% of identity
EggnogPentatricopeptide repeat-containing protein(ENOG410Z7Z7)
KeggLink to kegg annotations (AT2G13600)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019414287.1)
PfamPPR repeat (PF01535.19)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;