Ll_transcript_437643

• Id Trinity: TRINITY_DN48955_c0_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_437643
• Sequence: CCTGTCATCACAACTACCATAATTCTCTTTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCAGGGTTTTTCTCTTCATTTTCTCTTCTCTTTCTCTTGAAT TCAACATTATTCCTTTCAAATTGTGTTCGTGAATGGCATATCAGGGACCTGCTTCGGGATCGAGTTCAACTTCTGGGTTTCAACAAATGAACTCCCCTTT CGGTGACACCACCTACACCAAACTATTCGTTGGAGGATTGGCTTGGGAGACTCAGACCGAAACCATGCGCCGCTACTTTCACCAATTCGGGCATATTCTA GAAGCTGTCGTTATCACTGATAAGAATACTGGCCGATCCAAAGGATATGGTTTTGTGACTTTCCGGGATCCCGAGGCTGCTAGGAGGGCGTGTGCTGATT CAGCTCCAACCATAGATGGTCGAAGGGCTAATTGTAATCTGGCTTCCCTTGGTCGACCACACCCTCCTCTGCCTTATGGTATTAGATACCAACTTCATCA CAATTTTTTCATCCAATTTTGTTCTTATCCAATTCTACTCTATGCTAAAATTTAACTTACATTCCTTTATCATTGCTGCTGTCATCAATTTTGTTCTTGT TATTATTATATCTATTATTATCATGGAGCTGGTTGGAACATGACATTGACATGCCTATTTTTTTAAAGATAAAGTCAAGTCATTGGCAGTGTTGGATAGA GCTAGAGTACTTATTCATTTCAGTGTATCTTTACTGATTTTTTAATTTATAAAATACTAATATACACTCCTCTCAAAGACACTTCATGTAATGGATAAAG TTCCTACATTTACAGCGTTTCCTGTCTCATTTCCTTAAATTTGCTTTTGTATGTCTGCGACTCAGTATCTGGTCATGTGACATCTGTGTTTACTCTTTAC CAATTTTATTTTGCCTCATCAAGTGACATATGTGCTTGCTCTTTCTGATTGACCGTTCTACCAGTTGTGATTTTTTGCTACATACATTTCTGTTAAGCCC ATGCAACATTTTTTCTTTCTTTCTTTGATATGGGTAGTATGTGGTAACAGAACCATTCTAGGTTGTTCTTCCTGCATAGGTTACTTCAATTTTGTTCTTA CCTCTGTTGTCTTTTATAGAACGGATAAGAGTAGCCTCCCCTTATATTGGAAGTTTGCAACCAGCTCGCGGTGCTTATGTTGGAGGTTATGGCTACCAGC AACCAGTTCCCTACAATTATCAGCAAGGATTGGTTTATCCTCCTTATGGGTATACAGCATATGGATCCGAGTACATCTACCCACAGAGCGTGTACAACCC TTACATGGGTCAGCAATACCTTCAGATATATGGAGTGCCTGGGGCAGTGAACACAACAGTTTATCCTTATGGACAGTTAAGCCGGGCTATTCCTAGCAGT CATGGTTATACAGCAATGCAGGGCTATACAGTACCTGGTCATCAGATTGTGCCCTACAGTGGCTCAAATGTTAATGCAATAACAACTTCACATGTGCCTG CGATTCAAGCACCATATACCAGTGGAATTGCTGCACCAGTTCCAGGCCAACCCCAATTTATTGTTCCTGCTCCTTCTCAGTTTATGCAAGGTAGCGGTCC TGACCAAACAGCCGGGTGAGGGAGCAAATAAGGTGGGCTGTTTATCTTACTACATATATTTATTTCCGGTGTAAGCTTGAGTTTTTTTATAAGCGTAAAC TTATATTTTGAAAGTATTGTATCACAAGTATCCTTAGTTTGCAGCAGGACTACGAGCAGTGGATCTGCTACTTGAGTGGCGGGCTTCTCCAATCTAGCCT TGCAAGTTACTTATTTTGCATTCTAGAGGTACTGAGCTTTGTTTTTATGCAATATTATTGCCCCTTAATGGTAAGGTTGTAATAAGTTTAGCCACCCATG AGTAGCTCATAACTCAACTTGTTTATGATTTGGTAAGTTGAGCTCGTGAGCAATTGAGTTGTGCGTAACTGGCTCATTTAAATGATCCAGACCTCGAGGG TGTGCTCAACTCATTTTCTCATGAGCTTTAGCATAACGGTAAGGTTCCTTGCCCCGTGACCTAGAGATCACGAGCTCAGATCTTGGAAACAACCTTTTCG TTTGCGAGGGTAATGATGGCTGCCTTGTAACATCTTCACACTATGATTATGATTATAATATATTATAAAGTGTTATTACTACTAAGCCTTTGTTAATTAC TTAATATAATTATGTATTGGATTAACTATATTAATAAATACATGTTACTACAAGATTCTGTAATCTTCTTAGAAAATGTCAAATTGATCTCTGCATTTGG GGTTTTCATTGCACAAGAATGATTTCTGTATCGCCAAATGAGGTGACTTGAGAAATTGTAGCACAAACCTAAAGCACCCAAGTTGTGTGCGTACTACAAC AATCACATAAGTAGCTACAGTAGATTATGATAACTAATAATGGTGTGATTGGCCTATTGCACTCAACTCTCAATTTGAATGCTGTGGGTTTATTCAAGAA TTTCTTGCAACTGTGAAAAGTGTTGTGTTTATTTGCAATTGAAAACTATGGCATTGGAATCTATATGTTGTTTTAGTATAGGTATAGCTCTTAACGAATC TTATTATGTGCAGGTCATATGTAGTCATGCTCACCAAGTCGTGTCTGAGTCGCTCGTGAAGAAAACTGGACTGTGTGGACTGCTTTTCCATTTGGACATT TACACTCATGTATTTATACCTAGTGCTACTAGTACTCAGGAAGAGTGGTGGTAGTATTGGATCGGATGCCGGAATAGGTCTCTGGCAGCCATGTAGAAAT AAACTTGTGTAAAAAATGAAAATCATGTCTGAATCAAAATATGATTCTTTGTACTTTGTAGTCTTGTGCAGCATTGATTTTGTAGATAATCTCATCAGTG TTGGTGCATTGTGTGAAGATGGATGGTCCGTCACATTTTTTTGGTGATTTTTGTGCATAGTAGCTGTGTAGTTGTGACAGGTTCTACCAGAAACTCGGGT GTAATTTTATGACTTGTTTTTATGCAAAAAGTAGAATCACCAGTATCTCCAATTAGAGAAGATAGCAGTGGTCCTTGGTGTGTTTTTTACTAGCGTTTAG CAGAAAGTCACATGCTCAACTTTTTCTTAAAACTAATGTTCATCTTTCATTCTTTCTTGTGAAGGACTCAATGTGTCCTTAATACATGTTCTATCTTTTC TAATTAAT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_165358;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_437643

FPKM

• PAB: 2
• PNAB: 0.8
• PS1: 1.5
• PS2: 0.7
• PS3: 1.3
• PW1: 1.1
• PW2: 1.3
• PW3: 1.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_437643

• Blastp: -
• Blastx: Probable RNA-binding protein ARP1 from Arabidopsis with 65.93% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019414871.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: -