| Id Trinity | TRINITY_DN49439_c1_g1_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_353998 |
| Sequence | TTAAATTCCCTCAATTCACTTCTCTCTCTCCCACTACGCTTCCTTCTTCTTCATCATCGTCACTTTCTGCTTATTCTCTTCCTACAACATGAACGCTCAC ATTATTGATCCATTGCAGGGTGATTTCCCAGAAGTGATTGAAGAGTATTTGGAATATAGCTCTAGTATGAAATGCATTTCCTTTAATCGTCGTGGTACCC TTCTTGCTGCTCTCTCACTTTTGGTTCTTGATTTTCTCAATTGAGCCAGCTGGGTGCAATGATGGAAGTTGTGTTATTTGGGATTTTGGAACCAGAGGCA TTGCTAAAGTGCTCGGTGACGAGGAATGTTCTTCTCCCGTAACCAGTATCTGTTGGTCAAAGTATGGCCATCAAATTCTTGTATCTGCTGTTGACAAGTC ATTAACATTGTGGGATGTTATGACTGGTAAAAAAATTACAAGAATAGTTTTGCAACAAACCCCTCTACAAGCTCGTCTTCATCCAGGTTCTTCTACCCCA TCTCTTTGCTTAGTATGCCCAATCTCATGCGCTCCAATGGTTGTTGACCTGAATACGGGAAATACGACCTTGCTTAAAATTTATGTCTCGGAAACATGCG ATGGACCAAACCCTTCTTCACACAGTAAGTGTTTCGATGGAATTACTTCCTTCACATCAAGTGCTGCTTGTTTTAATAAGTGCGGGAATTTGGTTTATGT GGGAAACTCAAAAGGAGAAATTCTTATCATTGACTATAAAGATGGTGAAGTGTGTGCCATGGTTCCTATCTCTGGTGGCTCTGTTGTAAAGAGCATACTG TTCAGCAGAAATGGGCAGTATCTGCTCATAAATTCAAATGATCGAACAATAAGGATCTATGAAAACATTCTGCCTCTGAAGGATGAAGTCAGTGCCCTTA 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TGATGAGACTGGTTTTCACATTTTTATTTTCCTAACACTTCACATCTCTAAGTGCCTTTTTATGCTTAATTGAGTGACTTTCATGTTTAGGATTTTATAC AGAGGTTTTTCATGTTTAGGATTTTTTATACTCTTTCTAGTTTGGAAAATTAGTTTCAATTGGTTCATGTAGGGAAAAGTTGCAGAACTTAGTAAAATTT AAGATTTTAGACAGAGGTACATTATCTTAAGCATAAATTGAATTATACATAGGTTATTGATGTTATCCTTGTCTAGTAGGAAAGCTAAGAGATACCGTAA CATCTTTTTGAAGATTCGAAGTCTTGAATCCAATATCTGGACAATTATAGTTGCTTGAAAAAGTTGCAATATTCTTAATACTAGACAGCATGATTTATGC CACTTAATTGACATATATCTGGAGTTGTATGAGTTATTTTTAAGAGATATAATTATAAAATGAGGGTAAGCATATAATTTCTAAACAGGAGGCCTTTACA TTGAGAAAAAGGCTGATGACAAAAATGGACATGATATGTTCTCCTGTCTTATCCACCCAATCTATTATTTTCTCTATCTTTTATGGTTTGAGGCTTTCAC CATGGAAGGCTAATTTTCTTTAATCAATATAAGGATTTCAAACTTTTGTTGGTTTGATCTTTGAAACCATATGCTTCCACATTTAATTTAATCAAATTTC TCATTCCTTTCATTTCTTGATCTAATTGCATGAGTGATATCAATCTGGTCAACTGACTTTAATTAGTCTAAGTCATATTTGAATTGTCAATTTGATTGAC TTGTTTAATAATTTAAGTTGGTTCACTATCATTATCCTTAGTAAACGACAGAGTTTAGGTAATACATTGCTGAGATTTCATCTCAAAGCCGATTGGAAAT 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| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_169362; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_353998
| Blastp | Protein RBL from Arabidopsis with 62.95% of identity |
|---|---|
| Blastx | Protein RBL from Arabidopsis with 65.49% of identity |
| Eggnog | Retinoblastoma binding protein 5(ENOG410XTA2) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT3G21060) |
| CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0001676) |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019419132.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |