Ll_transcript_355376

• Id Trinity: TRINITY_DN49448_c0_g1_i8
• Name Transcript: Ll_transcript_355376
• Sequence: GTAATGAGTAACACTGGCATGGGACCATGCAAGCGAATTCAAGCTAATAGGGGCGGCATAAAATTATATTAATCATGCCATTGTCACTATACACAAAACA AAAAACACCCCTTTAATTATTTGATTTATTTGCACCCTCTCATTGCTTAAATACCCATCATTTTCTACACATAACACACGTAACTATAGAGCACTAGTTC TCTTGCATACACAAGAGTTATAGTATAGCAACAAAGATGACTAAGGATGTTGAGGTTCATCAAGAGCAAGGTGAATACTCTGCTAAGGATTACCAGGACC CACCACCATCACCATTGTTTGATTTAGATGAGCTGAAAAAGTGGTCCTTGTATAGAGCCATTATAGCTGAGTTCATAGCAACACTACTGTTTCTTTACAT TACCATCTTGACCATTATTGGGTATAATAGCCAGACTGATACCAACAAGGGTGGTACTGAATGTGATGGAGTTGGTCTTTTGGGTATTGCTTGGGCCTTT GGTGGCATGATCTTCATCCTTGTTTACTGCACTGCTGGAATTTCTGGTACACTACTCCCCTTCCCATCTTTCTCTCTCACTTACTTGTTTTGTAATTTGT ACCTTTTTAGTAGCTAACACACTATGTATATGTAGTTTATTTTTGTAGAAAACAATTAAGTGGTTATATTCAAGTTAAGTCTGGTGTATAGTTATGCTTT ATGTACGTTTTATTAGATTGTTTTTTTAAGTTATGTATAAGTAGGTTTTGATCTCAAAACTATGATTTAAGAAGCAAATTTTTTAGTATACTTCTGTTCA CCCAAAATTAACTTCACAACTAAAATCAAACATGGTCTAATGTTCAAACATAATCTAAAATGACCACTATCTAGCAAGGGTCAAAATTTAAAATTTACGA AAAACAATTGTTAATCGTTATTTTATAGCTTCAAATCTTTGAAACAGTCTTCTTTGCTTCTTCTGAGAGAAAGGCTGCATACCCTCTCCACAAAAAGTCT TTTTTTTTACTCTATAGCAATTCCCAACATGGTTTTCATGTATATGCAACATATATATATAACAACAAAATTGTGGTTTGTTATGCTGCAGGAGGACACA TCAACCCAGCAGTAACATTTGGGCTATTCGTGGGACGCAAGGTGTCACTGATAAGGGCGTTATTGTACATAGTAGCACAGAGTGCTGGTGCTATTGCCGG AGCTGGACTAGTGAAGGGGTTCCAAAAATCATACTTTGATAGGTATGGTGCTGGTGCTAACTTTGTTCAACCTGGCTACAGCAAAGGCACCGCTCTGGGT GCTGAGATTATTGGTACCTTTGTTCTTGTCTACACTGTCTTATCTGCCACTGATCCTAAGAGAAATGCAAGAGATTCTCATGTTCCTGTATGTTTCATAC CCTTTTCTTTTTTTATCCAAAGTTTTAACCTTTTGGTTGATTTGTATATAAATCTTGTGTGAATTGGATCTGAAATTTGAAAAAAGCAAAGAAATGTTTA GTGGTATATATATTTCTTACTATGTTATTATAATATTAGTTGTTTCATGAAGATGTCACTATTTTTTTTGGGTGGGTTCCTATATGATACGGGAGAGTTT AGTATTGGACCCAAATTATGATATGTGATACCCATAAAAATTTAAGGGTCCAAATTTTTGTAATTAAATAAATAACATGTGAAGATATTTTCTCTTCATA TTCTAGTATTGGGCAATCTAATACGGGAGAGAATTTTATTTCCTATTTTTTTGTTATCTTTTATTAATGGTTAATGGCCTTAAATAATCAATAATTAAGA ATGAGAATTGATGTCACTAAGTTAATTAGAATGGATGGCATAAATTGTGACACTTAGAATCAAGATATTCCTCTAGAATCCAATGTTCTCATTTTTAGTC TATGGTCCTATTCTATTATGTTTACATAAATTACTAAATACAAATAATTAGTTCAATCATATGTTTAACAAATATTCACTAAAAACATTTCAATTTCTTC ATAGTTTTTCATTATTTTTTTACAGGTTTTGGCACCACTTCCAATTGGGTTTGCTGTGTTCTTGGTTCACCTTGCCACCATCCCTATTACAGGAACTGGC ATAAACCCAGCTAGAAGCTTAGGAGCTGCTGTGATATACAACAATGAGAAAGCATGGGATGACCAGTGGATCTTCTGGGTTGGACCCTTCATTGGTGCTG CTATTGCTGCAATCTATCACCAGTACGTATTGAGAGCACATGCAGCAAAGGCTCTTGGTTCTTTCAAGAGCTCCCAAAATCTGTAACTCATTCAACTTTG TGCACCCTTGCTTCTATGCAAAATCTTTGGGATTCTTCATTGTTTGTAATTGTATCAATATATGCATGGTTTATTGGAACTTGTATTTAATGATTTTCTA TTTTCAGTAACAACTCAAAAGACGTGTGAATGTTAATTTATGTATTTTAAGTGTAACCTATTCTTAAATGTGTGCTAATGTCCTTTGCTAGTGTTCCATT TTTTTGTCATTACATTGTTCTTCTTTCTTGTATTTATTATTTTTTGGACAATTTGAGAATATGCATAAGATGAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_169461;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_355376

FPKM

• PAB: 6.1
• PNAB: 3.3
• PS1: 0
• PS2: 0.9
• PS3: 1.4
• PW1: 1.6
• PW2: 4.1
• PW3: 5

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_355376

• Blastp: Aquaporin PIP2-7 from Zea with 81.9% of identity
• Blastx: Aquaporin PIP2-7 from Zea with 78.9% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019448737.1)
• Pfam: Major intrinsic protein (PF00230.19)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;