Ll_transcript_352795

• Id Trinity: TRINITY_DN49461_c4_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_352795
• Sequence: CCGCGAGGCTGATGTTGATGGTGATGGGCAGATCAACTATGACGAGTTTGTCAAAGTCATGATGGCCAAGTAAGGACCAATCGAACCATAAACCGAAATT CGAAAAGCATATAAAGAGAAAAGGGGCATAGCAGATAAGTTTTGATGAGAATTCTGTTACAATTAGGATAGCTTTTGTCTCATCATGCATTGTTACTTCT CTGTTAATATCTGCTGTATGATTGGTTCTATGATCATTTTGAATTTAATGCCATCATCAAATGAGTTTGAAATGTAGAATAAGCTATTTTCTACGGTCGA AATTTTGCTTTGATTGGTTGCGGATCGATCTAAAGTTAAACGTCACATCGTCTTAATTGCCTTTCTCCTTTTATCCGACTTTAAACTTGTGAATGTGGGC ATGTGCCTCCCTACCTCCTAGGAAATGGTAGTTCTGTAAATGTAAGGTCTAAGGACATAGTGAAATGTCGAAGTTTGATTCTGTTATACGTTGCGCCGCG TCCGTTTAATGTGGGGTCAACGCCCTGACTGCGGTTATGTTTATTCACTGCAATTGTCGATAATTATGGAAGAATGCACTCGCGTTGCAGTTATAGGGAG TTACGGACTACCAAGCCGACAATATTGTGGTTGCTGCCGTAATTTCAAACCTTGTGGATTAAATAAATTCCTTGTCTCCATTCTTGTCAATGTTAGATGC TGTTCTTTCTTTGTATGCATGGATTCAATAAGTTTTGATTAAAACACAGTAACTTATGTTTTTCATGAAATGCTTTTTTAAACACTGTTCTAGCTTATGT AGTTATGTTGTGTGAAGTTATGGCTGCAAAGAAGCCTAGCCATTAAAAGTTGTTTTTTCTTTATGTTAACTTAATAGGTGCACTCTAAGAACTTGTTTGC ACCACATTGCAGTTCCTATTTTGAACCCATATATAGCTTTTGATTTCACTTTTTTTTGCAAGTTAATGATCTAGTAAAAGTTGCAAGACAATGTTTTCAA TATACTATTATGTTCTTGAATGCCTTAATTATTGTTTCTTGATTGAACCCTGGCTGATTTTTATTATAGCAAGTAGAATATTTTGTTTCTGTATTCAAAT TCTCTATCGCAATCAACAAAACGTTGGTCTAGTGGTGTAAAATCCTACTGAATCCTAAGGAGCGACGCTTGTTGAGAGGGGCAACCACAAACCCAGAAAA ATATTAGTTACTTATCCAAAAAACGTGAGGAGATATCCTGGTAATACCCAAAAATTCTCTATCACAAATTGCTTCAGAGCATCAAGTACTCTAGAGGATC GGATTCGCTCATGCCCGCCATCTTTTGGCGCTTTTGTTCTGTGCTTTGAATCGACGAATGAGACGATAGATGCTTCAATGTTATGTTATAGAATGGTAAC CTTTTGTTGATCACTAACATAATAACCTGTTTTTTTTCTACAAACTGTTGTTAGAGAGGATCTGTCTCACAATATTGTGTCACTCCATATGTCATGAATC GTGATTGGTTAGAGAGGTGTTCTTGTTTTATTTTAGAAATAGAAATTTTGGTTTTGGTCAACAAAACTCTCAGAAAATGCTCAAGGGAATGTTATAAAAG TAACCACTCAGTTGTTCTCTCCAATGTTGGATTCTTAATATGCCCCACCACCATCTTCTGGCACCTTACAATTGTGCCTTCTTTGAATCACTGGATGTAA CAATTGATGCTTTAAGATATTACAAAATGGCATCATTTATTGGGATGGGGATCAGGTGTCCCAAAGCATGTCCCCGACCATGTACCAAGCCAATCAGAAA GAAGGAAAAATAAATAAAAATATGAATGTTTAATTTTTTGACTAATATGGCATGTTGTTATTGG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_169548;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_352795

FPKM

• PAB: 0.2
• PNAB: 0.2
• PS1: 0
• PS2: 0
• PS3: 0
• PW1: 0
• PW2: 0
• PW3: 0.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_352795

• Blastp: -
• Blastx: Calmodulin-2/4 from Solanum with 100% of identity
• Eggnog: Calcium-binding protein(COG5126)
• Kegg: -
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0001037)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019442849.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;