Ll_transcript_405124

• Id Trinity: TRINITY_DN49559_c4_g3_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_405124
• Sequence: CAAAAACATAAATTACCCCCCACCCCATCACAAATTTCAAAAAGCATCAAAAAAAAAAAAGCAAAGCCAAATTAACAAAAAAGAAAAAAATTTATGGGGA TAATTGAAGAAGCTCATAACGTGAGAGTAATTGGAAAAGGGAATCAAATTGTTGTTTTGGCTCATGGTTTTGGAACAGACCAATCTGTGTGGAAACACTT GGTGCCACATCTAGTTGATGAATATCGTGTTATTCTATATGATAACATGGGAGCTGGTACTACAAATCCAGAGTACTATGATTTTGAAAGGTACTCTACA CTTGAAGGTTTTGTCTATGATTTACTTGCTATCTTGGAAGAGTTTCAAGTTCAATCATGCATTTTTGTTGGTCACTCTCTTTCTTCTATGGTGGGTGTCA TTGCTTCCATATCCCATCCTCAACTCTTTTCTAAGCTTATCTTGCTTTCTGCCTCTCCAAGGTAACCAACTAAAATCATTGTTGTCTAGTATTTTAAATT GTGGTTGTGATCGGGATTCTGGTTGTGGTTGCAGCTGTAATTGTGGTTATTACGGTCTTTGCGATGTGAATTATTTTGAGTAAAAAAATATTTTTTACAT CAATGCGGCCTGATGTGACACAGTGTGATTGTGTTATGGCTTGATGCAGTCCAAATCTGGTTTCATACGGTTGCGTTGCGGGCACATCATTGTGATTCGA TATCACACTGTAATTGTAGTATGATGTGGTTGCGACGGTCACTGCAACCGCAACATTTCGGCCGTATCATGTGACGCGGTCCACAATTTGAAATATTGTT GTTACCTAGATTTTTTCTTCTAAATGATAAAATTATTAAACTAAGGCTCTACTAGATCCCATGATGATTAAGAGTCATAAATTCGATTTCCGGAAGCAAC ACTTATAGTGAAGAACAACTAGATATCCTAAAGGAGATTAGTTTCTTACTCATAGGTTATATCGGTTAAATAGATATAGGTGATAGTACCCAAAAAATTA AGTACATAAAATTTGTATTTATCAAGACAATTTTTTTATAAAAAAGTGAAGCTTTTTTTAAATGTTAAACGACATTAAAAATTCTAACAAGATGAGGACA TTTATTAGAAGAAAAATGAATTAGGATGATAATTACATAATCTTATTAGAAGAAATTTCTTTAGGTAGTTAGCATTTTTTAAGTTGCAATAACCCACTTG AATAAAACCGACCATTTTAGTTTGACTTCAATGAAAATGGGAGGGATCAAGTTACTTCAAGAGTAAGTTTAAAAGACTTACACATCATCTTATATCATCA ATTCTAGTTATAGTGTGATTCCAAGTTGCTTGCATGATTAGATTCCAACATTGCTTGCATCCCCATTGTGTTGCCATTGTTAACTTTGATTAAAATCATA CTATAATTGTAAGGTGACTTAGTTGTGACATTGAATACAACCTTAATATTATTGGTAGGAAAATATGTATAGAGACATGTAACTAACTCTATTTGTAAAC AAATGATTTTTTATTTATTTATTAGTGTTATCTAAAATAAATTTTTAATATATTGTCAATATTATATCATTTATTTCTATATAGATATGTCTTCCCATAA TTTTTGCAGGCATATTAAATGATGCCCCAGACCAAAATAAAATGACATGTAATACTTTTCCTATTTTTTTATATCAAAATATAATAGCAGTATTATTTTC CAAGTGCTTATTAAATCATGTCTCCTAATTCTTACCCTCCAGTTGAATAAGAACAATTTAATAAAAAAAGATATTATTATTGGCTGGACATGGATATCAG TGATTTAAATTGTAATTATAGTAACATTTATATTTATTGTAATTGTGGAAAATTAATAAAAATTATAACCACAATTTTAATGAGACTATGACCTTACTTT TGCACCCAAATTGTGGACATTTAGTATAGGAGTGAATCAAGTTACTCCAAGAATAAGTTTAAAAGAATTACTCCTCATCTTATACCATCAATTCATTGGA AATCTAATAGTTTAGATTTACCACTAATTCAAACCATTGGATTTATCTAGAATTGATGGTGTAAGATGAAGAGTAAGTCTTTTAAACTTACTCTTGGATT AACTTGATCTGTATAATCTTTTTGGTATTAACAAGTGTATTATAACCATTTTCGGAGTGTATGATTGTCCTTTTCAAGAATGGTAGCCTCTAGGAATCAA ACTTTTGACCTTTCGGTCATAGACGGATCTGACAAGGACTTATATCACTAAAACAATACTATTAAAACACCAATTAGATGTCTTCTATTTAATTTGATTT ATTTATTTGTTTATTTCCTTTACATTGAATCGTTCTAGGTTTCTGAATGACGAAAACTATTATGGGGGTTTCGAGCAAGAAGATCTGAGCCAATTATTCG AAGCAATCCAATCCAATTACAAAGCATGGTGTTCAGGTTTTGCTCCTTTAGTAGTTAGTGGAGACATGGACTCAGTGGCAGTTCAAGAATTCAGCAGAAC CTTATTCAACATGAGACCTGACATAGCACTAAGCATGGCCCAAACCATATTCCAATTTGATATGAGGCAAATCCTAAACTTTGTAACTGTCCCATGCCAC ATTATTCAGAGCACAAAGGACTTGGCTGTGCCACTTGTTGTTGCTGAATATTTACAACAAAATGTTGGTGGAAAGTCTATTGTGGAGGTTATGCCAACTG AGGGTCATTTGCCACAGTTAAGTTCTCCTGATATTGTAATTCCTGTGCTCATCAATCATATCAGAAATGATATAGCAGAACCAAAATGATTTGGGTAAAA TGTAATAGTATTGGTACGAGGAATAGTAATAGCATGTCTATATCTATAATAGTTAATAAACGGAAAACATAAAATAATTACTTTATCATGTTGTAATTT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_170359;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_405124

FPKM

• PAB: 0.1
• PNAB: 0.3
• PS1: 0
• PS2: 0.1
• PS3: 0
• PW1: 0.2
• PW2: 0.4
• PW3: 0.6

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_405124

• Blastp: Probable esterase KAI2 from Arabidopsis with 70.73% of identity
• Blastx: Probable esterase D14L from Oryza sativa with 78.91% of identity
• Eggnog: Alpha beta hydrolase(COG0596)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G37470)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019431008.1)
• Pfam: Serine aminopeptidase, S33 (PF12146.7)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;