| Id Trinity | TRINITY_DN49587_c0_g1_i14 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_407757 |
| Sequence | CTAGTGTCGAAAACCCAACGACAATGTTTCTATTTATAATCCCCTTTTCCTTCACTACAAGTTGTGTAAAATCGAGTTAGGGTTTCATTTCTTCTTCACC GCACTGCGTTAACCCATTTCTCTCTCACCTTAACCACTCTTCTCGTCTTTACTCGTTTCCCGCCATCTAACCACTGCTATTTTGAATATTAGCCGTTAGA TCTGCCATTTTTGTAGTATCAGTGAAAATGTCTTCTTCTTCTTCTTCAGCGCTTAAGGAAGAGAAGGAAGATGAAGCGGTTAAAGGGGGAGAGCTAGTGT TCTGTGGTGCCACGTGTTGGGATATGATTGGTCGTAAAAAAGGCATCGAAGGTAACTTGGTCTCCCCCACGCGCCTCCGTCCTCTCATCGGCGTCGATAT TCGCTATGTCGTCTCCGGTTGCGGTCAGTTACAGTTGCAATTTCAGTTTCATTTTCTTCTTATTTAGTATAATGTGTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGTGAA TGATGCAGCATCTTGTCATTGCGTTGCATTGGATGTTGAAGGGCGTTGCTATACATGGGGTGGTAATGATGTATGATTATTATCAGATAACTTTCTTTTG ACTTTATAAAATTTAGTTCAGTACTTGAGAAATTAAAAAATTTCAAATTTATGCATATGAATCTCAAATGACAGTCAAGCTTGGGACTAATGCTCCTGAA GGTGTCCTCGAAAGGACTTGTTTGACCCGCCTTTGAGCTTCTCAAGTGTCGAATTAAGATTCTTAGTGACTTTTCATTTCTAAGAACCAAATTGGTTGCA CATTTTTTTCAAGGAGATGAATTTGGGCATTTAATCAGTTTAATTTATGGTTTGACTCTAACTTATAAAATTTGGTGTACAGAAGGGGCAGCTGGGTCAT GGAGATACCACTCAGCGCGATAGGCCAACTGTGGTGTCTGGACTTTCTAAGTGAGTGAGGGAATGCTCTGTTAAAATTAGATTTTTTATTACTCTTTTAA TATTATATAAAATGTGCACTTTACCAATGTGTGTTGACTCTAGTGTAAAAGGGGGCTCGAGTACCTTAAACAGGTAGTCCTGGGTTTGATCCTGGGATCA TATGTTTGGGAAACTAAAAAATGTGAAGTATTGTGTTTGTTTTACCCATTTCTATTTAAAGGTTGAATTTTTGTTCACATTTGTTTATTCTTTCTGTTAT TATTTCTTGTGCTAAATTTCATTGACATTTGAGTTTTGCAAATACAAGATTCTCAAAGCTGGATCAGGGAGGAGTCATACAGTAGTTGTTACAGATGATG GAAATTCCCTAGCCTTTGGATGGAACAAGCATGGACAGCTCGGTGTAGGCTCTGTGCGAAATGAAATTGAATCATCTCCTGTTCGCTGTCTTGTGTCTGA AGTAACATATACTACTTGTGGTGGTGACTTCACCGTGTGGTTATCTTCTGTTGAAGGATCTTCTATACTGACTGCTGGGCTTCCACAGTATGGACAGCTT GGACATGGAACAGATAATGAGTATAATTCTAAAGACGGTTCTGTAAAGTTGGTTTATGAAGCCCAGCCACGTCCTCGGGCAATTGCATCTCTTGCTGCTG AAACTATTGTCAAAGTGGCATGTGGAACAAATCACACAGGTGGCTGTTATTACATGCTTAATTTTTGTTATCTGACTTTCTTTCTTATATGTTCTCATTA TTTGTTTTGGATATTTAGTGGCGGTGGATAAGAATGGCTGTGTCTACACGTGGGGTTTCGGTGGTTATGGAAGGTTGGTGCTTAGTTTTCGGATTATGCT ACATGCAAATATCAGATATTTCTTATTCAAAATTGGATTTCCTTGTATTGTCCTTCCTCATTTTCTGTTGAAGTTTTCACCCAAGTTCATGGATTCTGTA GACTAGGGCATAGGGAGCAGAAGGACGAGTGGGCCCCTCGCCGTGTTGATGTCTTCCAGAATAGAAATGTTTTGCCTCCTGATGCAATTATTTCAGCTGG TTCTGTGAATTCTGCATGTACTGCTGGTATACCTCACATCTGGTCTTTTGTTCAATGACTACTTTTTGTTGATACAATTAATCTCGTTCATGGTTGTTGT TTCTGTTACTTTCTGGTAATGTATCTGTTATGAACTGATGCTATTGGTAGAATTATGGTTTCTTATCTAAGTTTCTAGCCTCTAAGCCTCTTGAAGAATT TGATGCTCGATCGACCTTGAAGATTCGAACAATTTGAGTACAGTAAGATGATTTGTGAAAGTTCTTTTTTTTGGATAAATAAAGAATTTCTTTAGATGAG AAAAAGAGAATTTATGAAAGTAGAATTACCAAGTTCCTCTGATTTACGTTTATCATGGTCCATGGATGTACTGCATCCTTAATTGTACATGTTATGTTCC CAATGTCCCGCAGATACATGAGCAAAACAGCATGGAGAAAAATATGAAAACACAACATTTTTCTTGAGTTGATACATATTGGTTATAATTTGTTGAGTGG TTATTTGTACATTGAAAAAGAATCCAAGCTGGAGAAAGTTTGAAGCCTGTTGCCAAACCTCCCTACCTTGTGTTACCCATATATCTGGACATCAGCAAGT CACGTTTTAACTTTGCCAATGGCCTAACGAATTTTCACTACTGATTACTTTTATCAGGTCTAAAAAAATTAATCGGTTTACCGAACCGTAATTTGCCATT TTATCAGTTGAAGTAGCACAACACCCTTATTAATGTCACTGGAGCTAAGATATTATAATTTGTCTGAGTTAGGAAATCCCTATCTGGTGTATTTTAATTT GTTTGGATATTGTCCAAAGAATAGCAATTGGTTTCAGTGCTAGTTTATTTGCATTTCAGCTGGAGGGCAGTTGTATATGTGGGGCAAATTAAAGAACAAT GGTGATGACTGGATGTATCCTAAGCCCCTAATGGATTTAAGTGGCTGGAACTTACGATGCATGGATTCAGGCGGTATGCACCATTTTGTTGGGGCTGATT CCTCATGCATAAGCTGGGGCCAAGCTCAGAATGGAGAGCTGGGATATGGACCTATGGGACAAAAGTCATCAGCTCTACCTAAAAAAGTGGATATACTTGA GGGCATGCATGTTATGAGGTAGGTATTAAGAACCGGTTCCTCACCTCTTCTTTTTATCTATCTTGCTTCCTTCTGTGGATGTTAGGTTTTGTATATTCCA CTTAAATAAACATTTTTCTCCAGTCATAATCTGTTGGGTAAATTACAGTGACCTCCCCTAGGTTTAACTTATTTATGCATGACACCCTTCTTGTTTTAGA AATTACACTAACTTCCGTTAAAGTTTATGTTATCATTACACTAATGGGTGATATGATTAAAGTTGCATGGATGGGGATGTGGATTAGTGGATATAGTTTT TGAAACATGAGTACATTATGTAATTAAATCAAACTCTAAGGGAAGTCTGTAATGTCCCCTAATTTGTTTGTGGTAATAGCCAGAATGGTCATAGCAGCAC TAACTGATTATGGTTTGATTCAATAAATTTTATATAAAACAGAAACTACTTTTAAGTGATGTGGTAGCTTATGCAGAATTAGATTTTTATCTATTTACAA AGCAAAATGAGAAGTGATCTAAATATCTTTTCTTATTTGGAAGTGTTGCTTGTGGTATGGCCCACTCCATGGTTATTGTGGACAGAACAAATGTTGCTGA ACGACTTGACCAGCTTGATGTATATGATGGAAAAGCTTTTGGTGAAGGGAATGCACCTGCAACCGAAACTCCAGTGCCTAAACAGACTGCAAAAAAGGGT GCAAAAGAAGCCAACAATTCAAAGAAGAGGAGAAAGGCAAAAGATTCATCGGAAGAGGATGAGGAAGAGGATGAAGATGTCGAAGAGAGTGACAATAGTG ATGAGGATCAAGCCAATGGCGAGGCTAAGGTAAAAAGGGCAGGTAGAGGCCGAGGTAAGGCATCAACATCCAAAAAGTCAGGTACCGACGGAAAAGGTTC TGGCCGTGGGCGTGGTCGCCCTCCAGTAAGAAATAAGAGCAGTTCTAAGTCATCTCCAGTGAAATCAACTGGCAAGAGAGGAAGACCTCGCAAGTCGTCA TGACATGGTTTGTTGTTGGAAACTTTGTTCTCTATACCTATAGAGATTGTAACATTTTTAATCCATTGGCCGGTGATGTTAACTAGTATTTTAGTGTTAT TAAAAATCTTCTCCCTCAATTTAATGCATTTTTTTGGATAACATGTTTTGTGTAACTGTGTAAGGGAAAACTTCCATTGCCTCACTCTTTGGATATGCCT CTAAAAGATCTTACTAATGTACTGAACTGTTGACTCAATATTTGTTGAAGCTGGAGGATGATTAAATTTATTATTTTAATCTAAAAA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_170605; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_407757
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Protein RCC2 from Mus with 33.33% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019415445.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |