Ll_transcript_454807

Id TrinityTRINITY_DN49772_c0_g4_i4
Name TranscriptLl_transcript_454807
SequenceCAGCAATTTTGTTGTTACCAACTGAGTTTGACATTCCCAAACAGAGCATAACAAATTAACAATCGAACTGTAGGGCCCACTTCCTAACCATGAGTTTAGT AACGCTCCTTCATTCCGTTAACCACTTCCTTCTCTAGATCTCAACATTAGGGTTTTAAATTTGGGGCAAATTCCCAATTCACTACTAATCCGAGTTTTAT CACCGATGTTTGAATAATTTGAATTCAATCGAAGAATTCACACGTATCGTGACGAAGTTTATATGCAGATATAAATGGAGATGCAGAGAATTATCGAGTT TCACGATAGGATTATGGACAAGAGACCAAGGAAGAAGCCTCGTTTAACATGGGATATGCATCCACAACCACAACCACATCCTCCAATTCCTCCTACTAAG GTTCTTCCCACAATATATCACAACCAGGAGGTTGGGAATGGAGTGGCTCCAAATCATGCCTATCCTTCCATGTTTTTTCGAGGAATGACTCGTAATGGAT CACCCCCTTGGAGGCCTGATGATAAAGATGGTCACTATGTTTTTGCTGTCGGTGACAGTTTAACACCTCGATGTATGTCATTCGTCCTCATTTACTATAT AAAGTCTCTCAGGTGCACGCGATGTTAGTGAACTCGTAGCACAAAATTTCCATAACCCCTCTTTTTTAATCATCGAAAATATGAGTATGAATGATTATTT CCAACAATTAAATACATGACCATTTTCATTCATTTGTGTGGTGTTTTTGTATTAGTTATCAGCGCTTATGTCACACATGGCCTTGTCTAAATTGTTTCCC CTTATGTTTGCAGACAGAATTATCAGTAAAATGGGTGAAGGTGGGTAGTGCTTCAGTTTCGAAGAATGTTATTTCAAGTTCAATCCCCCTCCCTTTCTAC ATCTTCTATGTTAAAATACTTTTTAAGCTTATTAAGATTTAACATCACATTTTGCATGTTTATCTGTATTCTTGGTATATTGGTCATTTGTCCTAACGTT GATGTCCAAAATTTATCAAAATTTATGCAGGAACGTTTGGCCAAGTCTTGGAATGTTTTGACAATGAAAAGAAAGAAGCTGTGGCAATCAAAGTTGTTCG GTCCATAAGCAAGTATCGTGAGGCTGCAATGATTGAAATTGATGTCTTGATGAGGCTAGCCAGACACGACATCAATGGTGCACGGTAAGAGTTATTTTTG GTTGTCTTTCATTGTTGATTGCACATGTTAAAAGCGACTCTGGTATAAATGGTTTCATTCTTTGCAGTTGTGTGCAAATTCGGAATTGGTTTGACTATCG TAATCATATTTGTATTGTAAGTATTTGTTGATATTTGTAATTTGATTAAGATGATAGGAATGTCTATTCGGTCATGCTTAAATATTCTGGGAGTTAAAAA ACTTGCGGATGGATTTAAATGGTTTCAACAGGTGTTTGAGAAGCTTGGACCAAGCTTATATGATTTTCTCCGCAAAAACAGCTACCGTTCCTTTCCCATT GATCTTGTTCGGGAGTTTGGCAGACAACTTTTGGAGTCTGTAGCATGTGTGTGGACATATCCTGTACCCACTACCAAATTATATATTTTTTATACATATT TATGCTCCTTCTCTGTTGGGAGTTTAAGACATGTGCATATGTAATAACTCATTTGAATCTGGATAATATAATCTTTTGGTATTTGAAACAACCTAAACTA TTATTGAGTCGATTTCAAATAAATTTTATTATAATTGATTATGCGTTTAGGTTACTTATTATGCTACTCATATATGCAGTTATGCATGACTTGTGCTTGA TTCACACTGATTTGAAGCCAGAGAATATTCTTCTAGTCTCATCAGAATTTATTAAAGTGCCTGATTACAAGGTATCATCTTCCTAACTATTCTCCTAGAA TCCTTATTCAACTTGTAATTCACTTGTCAGTTAATGGAATTAACCTGTTGGTACTAGCAGTGGGTGTTAATATACTTTTGGACCGTGCAGTTGCATTTTT TCTTTTGTAAAAAATAGATAGTGAGATTAATTCATATTCTAAATTTTAATAAGACAGATTCGGCAACCATGTAAGTTTTCATGCACTTATTCCTCACAAT TCTCAAATATCAAAACTTTACATTTGTTCCTTTTTTGTTGGAAATTCTTTATTTGTGGCAATTCAGTTTCTATCACGGACCATGAGAGATGGCTCCTATT TCAAGAACCTACCCAAGTCTAGTGCCATTAAGCTCATTGATTTTGGGAGTACAACGTTTCAACATCAGGATCACAGTTATGTGGTATCAACAAGACACTA TCGTGCACCAGAAGTTATCTTAGGTATTGGGTGGAACTACCCTTGTGATCTTTGGAGTATAGGCTGCATACTAGTTGAGCTTTGCTCTGTAAGTAATCAT CAGTCTAAACCTTCTTTACTTTCCTTTACTTGTTATGCATGAAGGTTAGAATCACGGTTCCTTAGTAATATCATGCTGTAGCAAGCTCTATAGGATTAAG TGGTGACCCATGAATTCTTGCGCTACTCTGCGTTTCTAGCTTGGCAATTTTGATAAGGCGCTTGGACAATGCTACTATTTGTGTAATAGATATATTGCAA CAGCATTTGCTAAGTCTGCCAACTGGAAAATTATGAAAATTTGCTATTTTTTTATTTGAAGTCTTTCCTAAATCACTTCATCAATCCCCATCCTCCCTCA ACGTCATCCATTGGAACTGTCAGAGTTCACTAAGGTCTTTGTTGCCAACAGTGTTTGGTTTTGCTGGTGGAGTCTCTTCTTCCTCTCTTCATGTTGAAGA CTTCACTCACTCGCTACCTTCCCAGCTTTTCTGTTGCTCAGTTGCTCTCCTCTACCCTCAACGTCATCCATTGGAACTGTCAGAGTTCACTAAGGTCTTT GTTGCCACAGTGTTTGGTTTTGCTGGTAGAGTCTCTTCTTCCTCTCTTCATGTTGAAGACTTCACTCACTCGCTACCTTCCCAGCTTTTCTGTTGCTCAG TTGCTCTCCTCTACCCTCAACGTCATCCATTGGAACTGTCAGAGTTCACTAAGGTCTTTGTTGCCAACAGTGTTTGGTTTTGCTGGTAGAGTCTCTTCTT CCTCTCTTCATGTTGAAGACTTCACTCACTCGCTACCTTCCCAGCTTTTCTGTTGCTCAGTTGCTCTCCTCTACCCTCTTATCTGTTCTGATTTCTGAGT CCCTATGTTCTGAGCTAGAATTATTGGGTTCTCAGTTTTCTATGCAGCTGCAAAACTTGACCAAGAAACAGAGGATGTGTCTTTCATTGAGTTTTCAGTT TCTAATATTTTGTTTTTATCTAGAGTGCATGCGAAGAAACTTAGTTGAGGTTGTTTTATTTCAATACTTTTAGAATTCATGACATATACAGATTCGACAA AGTTTAACGTTGACTATCGACTTCCTAACATAACATTAATCTTTTATCTGGGCTTAGGATCGGCTATGTATAACATCAAGCATGCATTGGCAGGTCTGAC TGTTGCTATAATAAGAGTTCATGGCTTATGTTTGTTTAAAATAGATTAAATAATGCTTTCAAAATGTTGCTACACTCGGGAGGGCTCACTGTTTCCATCA CCAGAATTGCCCTATCATACCACACAATTGGGATTGGATTGGGCTGGAGTTGTCAGTTTTGTTTTTCTTTGGGGTTGGCAAGATTATCTTATTTTCCCAT CCTTGTTATTACTTCGACCAGCAAAACTTTAAGATTTCCTGAGTGACTTGAGAAATTTTACTTCAGATCCCCTCCCCTCCCGCTTTTTTTTCCTAATGTT CCTCTTATGTGTATATGATCAGGGTGAGGCACTTTTCCAGACACATGAGAACTTGGAACATCTTGCCATGATGGAAAGAGTTTTAGGGCCACTACCTCCC CATATGGTTGTCCGGGCCGATCGACGAGCTGATAAGTATTTTAGAAGGGGCACACGGTTAGGTTGGCCGGATAGTTCAACTTCAAGAGAAAGCATGAGGG CAGTTTGGAAATTGCCTCGTTTGCCGAACCTTATAATGCAGCACGTTGATCATTCTGCTGGTGATTTGATTGACCTCTTGCAAAGGCTCTTAAGGTATGA CCCTACAGAAAGGATAAAAGCAAGGGAAGCATTAAGACACCCCTTCTTCTCAAGAGATACTAAAAGACATGGTTACCCTTTTTAAGTACCACAGACATTA TAATCGCTTGGTGGAGAAAACACTGTTGAGAATGAATGTTGTAGCAACACAAATGCTTGAAATCCTTTGATTGTTTGCTCCACTGTATAGTGAAATGTAT TTTGTTTTGTAATTGTGTTTGTTTTTTTTCACTCCCTTTTTCTTCTCATATTATTGGTGTTTGAGCAAGTAAATAAACCTCAGTTTTAACCACCTATCTG GTTGAAGTGGATTCATATCTTGTCCTCTTAGTATGATGATTGTTATGGTGCGGTTGTTTTATACTTCTATGGTGTCAAATTAAGTTCAAAAGAATCATAT TTGTAAAAGTATTATGATCATAATTGATATTTCTAGTTACTAGGTGTTTCAGAAAACTTGTT BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_172068; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_454807

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_454807

BlastpSerine/threonine-protein kinase AFC1 from Arabidopsis with 82.91% of identity
BlastxSerine/threonine-protein kinase AFC1 from Arabidopsis with 76.38% of identity
EggnogCDC-like kinase(ENOG410XQF2)
KeggLink to kegg annotations (AT3G53570)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019444388.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;