Ll_transcript_454818

• Id Trinity: TRINITY_DN49772_c0_g4_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_454818
• Sequence: CAGCAATTTTGTTGTTACCAACTGAGTTTGACATTCCCAAACAGAGCATAACAAATTAACAATCGAACTGTAGGGCCCACTTCCTAACCATGAGTTTAGT AACGCTCCTTCATTCCGTTAACCACTTCCTTCTCTAGATCTCAACATTAGGGTTTTAAATTTGGGGCAAATTCCCAATTCACTACTAATCCGAGTTTTAT CACCGATGTTTGAATAATTTGAATTCAATCGAAGAATTCACACGTATCGTGACGAAGTTTATATGCAGATATAAATGGAGATGCAGAGAATTATCGAGTT TCACGATAGGATTATGGACAAGAGACCAAGGAAGAAGCCTCGTTTAACATGGGATATGCATCCACAACCACAACCACATCCTCCAATTCCTCCTACTAAG GTTCTTCCCACAATATATCACAACCAGGAGGTTGGGAATGGAGTGGCTCCAAATCATGCCTATCCTTCCATGTTTTTTCGAGGAATGACTCGTAATGGAT CACCCCCTTGGAGGCCTGATGATAAAGATGGTCACTATGTTTTTGCTGTCGGTGACAGTTTAACACCTCGATGTATGTCATTCGTCCTCATTTACTATAT AAAGTCTCTCAGGTGCACGCGATGTTAGTGAACTCGTAGCACAAAATTTCCATAACCCCTCTTTTTTAATCATCGAAAATATGAGTATGAATGATTATTT CCAACAATTAAATACATGACCATTTTCATTCATTTGTGTGGTGTTTTTGTATTAGTTATCAGCGCTTATGTCACACATGGCCTTGTCTAAATTGTTTCCC CTTATGTTTGCAGACAGAATTATCAGTAAAATGGGTGAAGGTGGGTAGTGCTTCAGTTTCGAAGAATGTTATTTCAAGTTCAATCCCCCTCCCTTTCTAC ATCTTCTATGTTAAAATACTTTTTAAGCTTATTAAGATTTAACATCACATTTTGCATGTTTATCTGTATTCTTGGTATATTGGTCATTTGTCCTAACGTT GATGTCCAAAATTTATCAAAATTTATGCAGGAACGTTTGGCCAAGTCTTGGAATGTTTTGACAATGAAAAGAAAGAAGCTGTGGCAATCAAAGTTGTTCG GTCCATAAGCAAGTATCGTGAGGCTGCAATGATTGAAATTGATGTCTTGATGAGGCTAGCCAGACACGACATCAATGGTGCACGGTAAGAGTTATTTTTG GTTGTCTTTCATTGTTGATTGCACATGTTAAAAGCGACTCTGGTATAAATGGTTTCATTCTTTGCAGTTGTGTGCAAATTCGGAATTGGTTTGACTATCG TAATCATATTTGTATTGTAAGTATTTGTTGATATTTGTAATTTGATTAAGATGATAGGAATGTCTATTCGGTCATGCTTAAATATTCTGGGAGTTAAAAA ACTTGCGGATGGATTTAAATGGTTTCAACAGGTGTTTGAGAAGCTTGGACCAAGCTTATATGATTTTCTCCGCAAAAACAGCTACCGTTCCTTTCCCATT GATCTTGTTCGGGAGTTTGGCAGACAACTTTTGGAGTCTGTAGCATGTGTGTGGACATATCCTGTACCCACTACCAAATTATATATTTTTTATACATATT TATGCTCCTTCTCTGTTGGGAGTTTAAGACATGTGCATATGTAATAACTCATTTGAATCTGGATAATATAATCTTTTGGTATTTGAAACAACCTAAACTA TTATTGAGTCGATTTCAAATAAATTTTATTATAATTGATTATGCGTTTAGGTTACTTATTATGCTACTCATATATGCAGTTATGCATGACTTGTGCTTGA TTCACACTGATTTGAAGCCAGAGAATATTCTTCTAGTCTCATCAGAATTTATTAAAGTGCCTGATTACAAGGTATCATCTTCCTAACTATTCTCCTAGAA TCCTTATTCAACTTGTAATTCACTTGTCAGTTAATGGAATTAACCTGTTGGTACTAGCAGTGGGTGTTAATATACTTTTGGACCGTGCAGTTGCATTTTT TCTTTTGTAAAAAATAGATAGTGAGATTAATTCATATTCTAAATTTTAATAAGACAGATTCGGCAACCATGTAAGTTTTCATGCACTTATTCCTCACAAT TCTCAAATATCAAAACTTTACATTTGTTCCTTTTTTGTTGGAAATTCTTTATTTGTGGCAATTCAGTTTCTATCACGGACCATGAGAGATGGCTCCTATT TCAAGAACCTACCCAAGTCTAGTGCCATTAAGCTCATTGATTTTGGGAGTACAACGTTTCAACATCAGGATCACAGTTATGTGGTATCAACAAGACACTA TCGTGCACCAGAAGTTATCTTAGGTATTGGGTGGAACTACCCTTGTGATCTTTGGAGTATAGGCTGCATACTAGTTGAGCTTTGCTCTGTAAGTAATCAT CAGTCTAAACCTTCTTTACTTTCCTTTACTTGTTATGCATGAAGGTTAGAATCACGGTTCCTTAGTAATATCATGCTGTAGCAAGCTCTATAGGATTAAG TGGTGACCCATGAATTCTTGCGCTACTCTGCGTTTCTAGCTTGGCAATTTTGATAAGGCGCTTGGACAATGCTACTATTTGTGTAATAGATATATTGCAA CAGCATTTGCTAAGTCTGCCAACTGGAAAATTATGAAAATTTGCTATTTTTTTATTTGAAGTCTTTCCTAAATCACTTCATCAATCCCCATCCTCCCTCA ACGTCATCCATTGGAACTGTCAGAGTTCACTAAGGTCTTTGTTGCCAACAGTGTTTGGTTTTGCTGGTGGAGTCTCTTCTTCCTCTCTTCATGTTGAAGA CTTCACTCACTCGCTACCTTCCCAGCTTTTCTGTTGCTCAGTTGCTCTCCTCTACCCTCAACGTCATCCATTGGAACTGTCAGAGTTCACTAAGGTCTTT GTTGCCACAGTGTTTGGTTTTGCTGGTAGAGTCTCTTCTTCCTCTCTTCATGTTGAAGACTTCACTCACTCGCTACCTTCCCAGCTTTTCTGTTGCTCAG TTGCTCTCCTCTACCCTCTTATCTGTTCTGATTTCTGAGTCCCTATGTTCTGAGCTAGAATTATTGGGTTCTCAGTTTTCTATGCAGCTGCAAAACTTGA CCAAGAAACAGAGGATGTGTCTTTCATTGAGTTTTCAGTTTCTAATATTTTGTTTTTATCTAGAGTGCATGCGAAGAAACTTAGTTGAGGTTGTTTTATT TCAATACTTTTAGAATTCATGACATATACAGATTCGACAAAGTTTAACGTTGACTATCGACTTCCTAACATAACATTAATCTTTTATCTGGGCTTAGGAT CGGCTATGTATAACATCAAGCATGCATTGGCAGGTCTGACTGTTGCTATAATAAGAGTTCATGGCTTATGTTTGTTTAAAATAGATTAAATAATGCTTTC AAAATGTTGCTACACTCGGGAGGGCTCACTGTTTCCATCACCAGAATTGCCCTATCATACCACACAATTGGGATTGGATTGGGCTGGAGTTGTCAGTTTT GTTTTTCTTTGGGGTTGGCAAGATTATCTTATTTTCCCATCCTTGTTATTACTTCGACCAGCAAAACTTTAAGATTTCCTGAGTGACTTGAGAAATTTTA CTTCAGATCCCCTCCCCTCCCGCTTTTTTTTCCTAATGTTCCTCTTATGTGTATATGATCAGGGTGAGGCACTTTTCCAGACACATGAGAACTTGGAACA TCTTGCCATGATGGAAAGAGTTTTAGGGCCACTACCTCCCCATATGGTTGTCCGGGCCGATCGACGAGCTGATAAGTATTTTAGAAGGGGCACACGGTTA GGTTGGCCGGATAGTTCAACTTCAAGAGAAAGCATGAGGGCAGTTTGGAAATTGCCTCGTTTGCCGAACCTTATAATGCAGCACGTTGATCATTCTGCTG GTGATTTGATTGACCTCTTGCAAAGGCTCTTAAGGTATGACCCTACAGAAAGGATAAAAGCAAGGGAAGCATTAAGACACCCCTTCTTCTCAAGAGATAC TAAAAGACATGGTTACCCTTTTTAAGTACCACAGACATTATAATCGCTTGGTGGAGAAAACACTGTTGAGAATGAATGTTGTAGCAACACAAATGCTTGA AATCCTTTGATTGTTTGCTCCACTGTATAGTGAAATGTATTTTGTTTTGTAATTGTGTTTGTTTTTTTTCACTCCCTTTTTCTTCTCATATTATTGGTGT TTGAGCAAGTAAATAAACCTCAGTTTTAACCACCTATCTGGTTGAAGTGGATTCATATCTTGTCCTCTTAGTATGATGATTGTTATGGTGCGGTTGTTTT ATACTTCTATGGTGTCAAATTAAGTTCAAAAGAATCATATTTGTAAAAGTATTATGATCATAATTGATATTTCTAGTTACTAGGTGTTTCAGAAAACTTG TT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_172068;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_454818

FPKM

• PAB: 0.1
• PNAB: 0.1
• PS1: 0.3
• PS2: 0
• PS3: 0.2
• PW1: 0
• PW2: 0.1
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_454818

• Blastp: Serine/threonine-protein kinase AFC1 from Arabidopsis with 82.91% of identity
• Blastx: Serine/threonine-protein kinase AFC1 from Arabidopsis with 76.38% of identity
• Eggnog: CDC-like kinase(ENOG410XQF2)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G53570)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019444388.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;