Id Trinity | TRINITY_DN49812_c1_g1_i8 |
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Name Transcript | Ll_transcript_342952 |
Sequence | ATTCAGGTGATTCCTCTTCATCTTCCCCCTGGTGACCCATCCACAGAGAGAACACTAAAAATTGAAGGGACCCCGGAACAAATTGAGTCTGCAAAACAAT TGGTTAATCAAGTCATCAGTGGTGAGGTATGTTCTGCTGGATTTTGGCCTTGGTTAGCATGTTTTGCTTGCCATGTGCGTAGTCTAATTTGATTTAGAAG TTTTTAATGTGCACCTTATATTTTCTGTCATGGTTTAGTTTTGATTAAACCAGATGGATTTATGTCTGGATTTATGTCTTTGTTTGCTGAATGATAGTTG GATACCATGCTCCTAAATCCTATGAGTTCCAGATGAATCTTTATTAATTTCTTGCAATATTAACACATATGACCAGGCCTCATGATCCATTCCTTTTGAT TGCTACTGAAGTTTAGGCCTTATTTCTTTTTTCTGTGATGATTCATTGATTTCAGGGGTAAAAATTGCATTTCCTACTTTCTTAAACTACAATATGTTTA GACATGCTTTTCACGTGATTTGTTGCCTTGTTTCATATAGTGTCTGTTATCTGTTATCGTAATGTTATATTATTTTCTGTGTTTGTTAAAACTCAGACCT CTTGCAATGGTTAAGCTGCAAATTTAGATGTCATGAAATGGTAATATCTTCTTGGCTAATATATTGTTATCAGATTCAGATCTCTGCAAGTTTCTACATC CTTTAATAGTTTTCTTGCCCTATCTTTGTTACTGTGCTTGTGCTGCAAGCTTTCAAGCCTGTGTTATAGATAACCGCACAAAAATAAAAGATACTGTAAA TTGATGATGTCCAGTATCTACTGCTAATCTCTACAGTGCAGTTGAATTTTGATTCTCTTCCCTAGTTGAAAACTGATTAGGGAGATGAGCCACTGAAATA GTTTTTCGTATAATCTGTACTTAGTATGTGTTAAAATCTATGCTGTTTCTTGTTCAATTATGACCTGGTTTTCATGGTAACATGCTCTGGTTGGTAGTTT GGTATAGTCACTTTATGAGAATTGGCTTGAACTTCCAGGGCATTTCTAGTTCGTACTTGCCAGGTTTCTTTTGTGAGAGAGTAGGTGCACACAGTTTTTG TTTATCTGTAGTCTTATTTGAAGTAAATGAATACATTTGTAGTTGGCATTTATGTTCACATATCAATAAAACTGGACCATTTGTGATATTGAACCATATT AATATTTTAGTTTCTTCTTGTGATGTATTGTGATATACTGAGTGAGATGTTTTATTCTCATTTTGTACATCTTAAGTTACTTTTATGTTATGTTATGTTA TGTGGGGATCTGTATTTTTATTTTTCCTGCAATTTGTTATCATGTAATTATTTATATCTATCAAGTAAATTTCATATCCACGTACCCTGTACCCGGTGTA ACACAGACCACTAGTGGCACCCACATGGAATCCCTTCGTCCTTGTTGGTTTTCCTTCAACATGCCATGGTATGGTTCTAAATCTCAGTTTCAATATTAAT TCAGGGGCAGTAAGTCTCTTATTTATGTCTCTGCATCTTCACTGTTGGACTTGATGTATATTATCATGTTGACATCCTTTTATCCTGTAATTTGTGCTTT TCACCTCAAAATTGTTATATACTTGAACAGATTCTTTGCCTTAAGCTGGGCTTACAATTATTTCTGCCCACTCTAAGTCTTTTAGTTATGCAATGTAATA ACTAATAATTTCACTGAATACTAAATTCACATATGATGTCATTTTAAACAATGTTATTTGTGCCTTTCAATTCATACCTTGAAATCACTATTATGTACTT GAAATAAGCTGTCTGTGTCTTAAGCTAGATTTAATCTGGCATAATAAGCTGAAATTTTTTCATGGTGAAGCTCAACTCTTGATTTGTTTTCTATATTACT ACTGTCCTTGTTTAGTCTTCTAGGTTTTTCACCTATGATTCTTCACTAATGCCATATGTAATTTTTTAATTGCTTAAATGAACTATTTTATATTTGAAAT AGTATTTTTTTTCTGCCTTATGCTGGAGTTACAATTGGCATAATACCTTGAAACTTTTCCATTCTGAAGCTCTTCACTCTTTATCCTATTTTGTTATTTC AGTTTTCTAGTTGTCGCAACTAGGAATTATTGTATGCTCTTCAAGATAATCTATTCTCTTAATTTGTCTGTCATTATTTCTCTAACCTTTTTTAGTTCTT GAACCTGAACTCTCTAAATTTTTAGGACATGTTACCCTTGTTTAGATTACCTTGGTGGTTACGTTACATGTGGTTTTATTTGATGGTTCATTGAGGTTGA CCACTTTAGATCGGGTGGATAGATGGTTAAGAGGCTGATTTTCTTCTGTACTTGGAGTGAAGAGAAGTTGTCTTGAGGGACAGCTGTAGATTTTGGATTT ATGATTGTGCTCCTTCATCTCTTATACCTCTCTTATGCTGTTGATTTGTGTTAGTTTAGGAACTTAACTTGTAGAATTGCTGTTAATATTTTATATTGTA AAAGTTGGAATATCCCATATTTTGAGATACCATATATAGGATTGCCCTATGAGGAAATAAATATAGTATGCTTGCCGATTTCTTTGGTTTTGCTTTTCTT CTGTACGGTATGTAGGCCTTTATACCCCTTTCTGGTTCTGAGTGGAATCTGTCAAACATATTATAACCATTATCTTGTGTTATTTTTAGGTTGTATAACT GTTATCTTGTGTTATTTTTATGTTCATTTTTAGTGTGGTATGTTTTACTTGTCTATTTGTTTGTGCTTCTGATGCTGTACGTATTCCCACATCTTGTGTT TGTTAACTTTTTATTTGGCTTTTTCTTTCTGCAGAATCGTTTTAGAAATCCAGCAATGTCTGGTGGCTATCCTCAGCAAGGTTACCAAGCCCGACCACCA ACTAGCTGGGCTCCCCCTGATGCTCTTGCACGACAACCTAGTTATGGCTATGTACAGCCTGGATCATACTCCGGTCCATCATCCCAGTACAACAATCCTC AGCAACAATATGCTGGCTACCCTCCTCAACCAGCTGGTGGATATTCTAGTGGTTGGGAACAGTCTACTGCACCACCTTTACAGCAGTCTACTCAGGGTGC TGGGTATGATTACTATAGTCAACAGCCTCCTCAGCAACCACAAAATCCTGGCGGTGCTGTAGCTCCAGGTGACGGGTCTGCTTCATATTACAGTCAACCA CCTGCCTCTGGCTATAGCCAGTCCGGGCAGGGCTATGCTCAGGACAGCTATGGTGGGTATCAAGCACCACCACAATCAGGATATGGCACCATCATATGAT CAGCAGCAAGGTTATGGTTCTGCCCCCAGCTATGGTAATGGGAACAACTCAGCACAAGAAGGGCATGCCCCCAACTATGGATCACCGGCAGACTCAACTC AGGTTCCACCCGTCCAACCGTCAGCGACCCAGCAAGGTTATGCTACTGGTCAACAGCCTAGCCCACAGGGTACTGCTCAGCCAAATTACGGGGTGCCCCC AACCTCCCAAGCATCTTATGGCAGTCAACCTCAGATACCCTCTGGTTATGGACCCCCCCCCCCCAGTCTCAAAACCCTGGTGCTACTC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_172419; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_342952
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019429868.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |