Ll_transcript_532547

• Id Trinity: TRINITY_DN50016_c6_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_532547
• Sequence: CTAACGTGGCACTTCATAATTGGAACTCCACCTTCCTTTACCATGAACTCCAGCCCACCTGAATATATTCAACACGGTTTTGTTTACTTTATTCCAATTT CGACAACTTCATTCCATTTATACTTATTACTCCTCATCCTTTTATTGATTCCCTCAAATTTCATTTTCCTTCATCTTTCTCTATCTGTAACAGTGAGACT CTCATAATGGCTTCTTCAAGATTAGCTTTGGTGTTGTTTATGTGTGCCCTTCCGGCGATGATTGCTGCCATCCGCCCTGAGAAGAACCCTTTCTCCGTCA CGGGTCGTGTCTTCTGTGACCCTTGCCGTGCTACTTTTGAAACCTCAGCCACCACTTACATTGCTGGTATTTCATAAACACAATTTTTACCTTACCCTTT TATCTATTTTTCTCATATATTTTTTGTTTATGTCTAAATGTTTTACTGTTATTTGACTCCTTGTCTTAGATCTGTTTACTAACGTAGATCTCTATTTAGC TTTTCCCATGTCAAAGTTTTAAACTTTTTATCTATTTGCTACTCTGCTTATATAAATCTAATTACTTTACTCTTTAAAATTGCAATTTCAGTTCAAATTT TATTTACATATGAGATGTCCCTTTATAATAATAATAATAATTTTGGCCTATTGCATAACCATGTTACAGATCTGATTGTTAAATGTTCAAGTAGCTTTAA ATTGGTCGAGGCTATGCTAGAGTGTAGCCTTAGTATCTGAGTTTTGATACAAATTTAATACACTTTATTAGATCGGTATAAAATCCTAACTATTGTTTGA TCCATTCATTGTGTGTACTATGCATCTAGTGTCGATATATGATCCACCATTTCTTTATAATATTTTTTTGTGAAGAATCAGTGAAGATTGAATATGATTA ATGGATTATTTTAATGTATAAAACTCTTATACTGTGGCATATATATTTTCTATCTTATCAAAAATGTTTTTGTCACGTTCATGACTGAACATCTAGAACC TGAAATTAAGGGGAGGATAATTATAATCTGTATGAATTGTTCGTTATGTATTCAAGTCTAATTCTTTGACATTGTGATGTTGTTGGTATTTAATGATTGT TGGTGCTAGGCTTCTCATTTTTCTTTACCACCCATTATGAATTGTGTTTCAAGTATTGTTGGCAAAACTGTGGCATATTAATTAATCACTAAGTGATTTG TGGCTAGGTGCGGAGGTTGAATTGCAATGCACTGACAGGGCAACCAATGAAGTTGTGTACACCCAGAAGGGTATTACTGACTCAACTGGAACATATGCAA TCACAGTGAATGAGGATCACAAAGACCAGGTCTGTAATGCCAAGCTTGTGAAGAGTAACCACCCAACTTGTAATGAAGCCACCCCGGGCCGTGACGCATC ACGAGTTATTCTTACCGGCTACAATGGCATTGCTACCAACAAAAGGTTTGCTAATGCTATGGGTTACATGACTAAGGAGGTTGCATCTGGTTGTGCTGAT GTTCTCAAGCTATACCAGCAGCTTGATGAAGATAATTAGTTTGTTTCAGTTAATCAAACATTTGGATTTGGTTTTATTGATTATGTTTATTTAATTAAAC ATTGAGATGTGTGTTATCTCAAAGGTTTCAGTTTGTGGTTATATATGACATATATATGTTAATGGGCATTTTTAAATTATTTGTTGTTTCAACACTACTC TGTGATTACAGAATGTAGTCTATTAGTGTTGTTTCTCTACAATAGACTATATTAGTTGGAATTTTTTTTATGCACTTTTTATATTGTTATTATATCATCT ATATTTGAAGGGGAGAGGATCAACTTATTCCAAGAGTAAGCCTTTTTAGACTTACTCCTCATTTTAGCCATCAATTTATTGGAAATCTAATAGTTTAAAT TTACCATTAATTCAAACCATTGGATTTCTCTAAAATTGATG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_174000;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_532547

FPKM

• PAB: 5.4
• PNAB: 11
• PS1: 9.9
• PS2: 1.2
• PS3: 2.7
• PW1: 10
• PW2: 7
• PW3: 6.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_532547

• Blastp: -
• Blastx: Olee1-like protein from Betula with 37.27% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019417291.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;