Ll_transcript_499350

• Id Trinity: TRINITY_DN50258_c0_g2_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_499350
• Sequence: TTATATAAAAAACTACTCTTCAAAACCATCCACTTTTCATTTCTCTCAGATCACTTCTTCTTCCACTATTCTCTCTTTCTATCTCACCGGATTTTCTTCG CCACCACCGTTAGTCTCTCATCTCTTCTTCATTTATTTATTATTTATTATTTATAGCGCCGTTAATTACTAATTTCTTTTCCCCCGATCCTTCATCACTC TCCAAGTTTTTCAATGTTGTCTCCACTTTCTATTTTCATTTTACTTCTCTCTCTCTATTTTGTTTTTTTATTCAAAATGTTTCTTCATCTTCATCTGTTT AAACTTCAAACCATTTTATCCTTTTCAACTTATTTATTGTTTTTGTCTCTGAAACTGTAATATACAAATCAAGTTAAGGAATTTTATGATAATTTCAAGG AATAATATAATATGATAATTTCCTAAATTTCATATTAATATAGTTAATGAATTTTAGTTTTTGGGGTTTGTTAATCTCTTCAGAAAGGGATCAAGTTGGA GTGAGTTTTTTTGTTGCGTTGATGAGATTTTTATTTGTTAGAATTTTAAGATTTAAGATATTATTTATTGTTTTTGTTTGACCCCTGCAACATTGAGATT CAACTTAAGGTCCTTTTATATTTCACGCAACTATTAAACAATTCGTAGTTGTATAGTATGATTCAACTTGTAGTGGAGTCTATGCCACTAACTAAGACGA GTGCGTATGCAACAGTGTCACCATAACATGTTTCTGTATTAACTATTAAGGCATGCTTATAGATAAAATAATTTAACATCATTTTATCATTTTCTAACTC AATTAACCCACTCTTAGAACTGTTTTGATCTGTGATTTGTGATTTTTGATTTTTGATGTACAATTAGAAAGCATAAATATTATGTCATCAACCGGATCTG AATTTCTTGTTACAAACACTTTACTAATGTATTTTATCAGGTTCTTTAATCTTTATCTGCCTTTACCAAATTCCTTGATTATATTGCCAAAATTTGTTCC TTCTGTCAATATGGGAGGTTCTAGGTTTACTTGATACCCAGTTGGTTCAGGGAGGGATGAAGAACACATAAAACGAGTATATAAAAATGTATATGTAGTA AATATCTTTGAAGATGTGTTATATATATATAAAGTTAGATATGTACGACTATTTTTGAAAATATGTTCCCAGAGGGGATCACCCACTGTTGCCTCCCTCT AGTTCCGTCTGCGTTGGTTCATCATTTGACTCTCATGCCAAAGATGTTTTACCCGTGAGTTGGCTTTTGGAGTGAAGGAAGGGAAGGGGAATGGTTAAAG CCATATCATAAGTCTGTTTCATGGCTCCCAAGAAGTTCCCTTCGCCAACAGACCCTTAGACATGGAAAGTAAAGATTTGTCTCCATATAGTGGAAAATTT ATATCATATATGTAATAATAATACAGTTAGTTATTTGTTCTTTTGCTTTTATTTTTATATTTGGGAAGCCTACAGGAAATTAATGATAGCAAGATGTAGC TAATTGCTTACGCAACAATCATGTCTTATTTACATCAATGATAATGACCTTTTTTCATCTTCTTTTGTAAAAGATAATTACCCTTTTAATACTAGGCAAA CATATTCTTCAAATAATCCATTTGTCATAGCTTTGGAATTTGTAGCTGAATTATTGTTAATCACTGGCATACTTTGTTTTTCATTTATTGTGAATTCATT TCCTTTTGGTGCTTAATGTTCAGAAGCCCACAAACTGAACTACCTTTCTTTTCATAGGTTGTGGTGAATATGTTTTTGATCTGATATGTATGAATACTTG AAGCCAGGAAATCTAAGTTTCAAGTTTCAAATTAATAGTGTTGCATTAGTGAATGGTTTGCTTATCGTTTTGTTTCACTAATTGCAATTGCTAAATTAAC TTGTCTAAATGCCTTTATAGCTATAAGATCCAAGCTAGCATGTGTTGGAATAAATCACAGGTGAGAGTAAGTGGTACATAATATCTGCTCAATTATCTGT TTATAGCTTATATAATGTGTGATGGCTTTGTCTTGTTTTAGTTGGAGATCAATGATATATCATTTCTAGCATTGTGGTGATTGTTTCGTGCACTGGACCA CTATTTATTTATTTTCTATTTTTTTATATAATTGATAGAAAGAAGTAAGACATTGTAGAGAAGGTCTGCCCATCAGCCATGGCATCGAGATCATTTGCTA ATCTCCTAGACTTACTTGGAGATTTGCCAGATATTCCTCACACCCCAAGAACACTTCCAAGGGTTATGACAGCTCCTGGAATTATTTCTGACCTAGATGT TTATGGTAGAAATGATGTGGGTTCAGATGTTAGCTCTTCTGGTTCCGGGTGTCGAGAACGGAAAATCATAGTAGCGAACATGTTGCCGTTGAAGGCTAAA AGAGATATAGACACTGGTAAATGGTGCTTCAGTTTGGATGAGGATTCAATTTTATTGCAATTAAAAGATGGGTTTTCTTTTGACAGTGAGGTGATCTATG TGGGGTCCCTCAAAGTTGAAATAGATGCCAGTGAGCAGGAAGAAGTTGCTAAGAAGTTACTGGAGGACTTCAATTGTGTGCCTACCTTTCTACCCCATGA CCTCCAGAAAAAATTCTATCTTGGATTTTGTAAGCAGCAGCTCTGGCCTCTCTTTCATTACATGCTACCTATGTGCCCTGATCATGGTGACCGGTTTGAT CGCTCGCTCTGGCAGGCTTATGTTTCTGCAAACAAAATATTTGCAGACATGGTTATGGAAATAATCAATCCCGATGATGATTTTGTTTGGGTTCATGACT ATCACTTGATGGTGTTGCCTACATTCTTGAGGAAGCGATTTAATCGAGTTAAACTTGGATTCTTTCTTCACAGTCCTTTCCCTTCATCTGAAATTTACCG AACTTTGCCAGTAAGGGATGAAATTCTGAAGGGTTTATTGAATTCTGACTTAATAGGGTTTCATACATTTGATTATGCTCGCCACTTCCTCTCTTGCTGC AGCAGAATGCTAGGTCTGGACTATGAATCTAAACGAGGACATATAGGACTCGATTACTTCGGCCGTACTGTATTTATCAAAATTTTGCCTGTAGGCATTC ACATGGGTAGGCTTGAATCTGTGTTAAATCTTCCTTCTACATCTGCTAAAGTTAAAGAGATTCAGGAAGAGTTTAAGGGTAGGAAGGTGATTCTCGGTGT TGATGACATGGATATTTTTAAAGGCATCAGTCTAAAGCTTCTAGCTGTGGAGCATTTGCTGCAGCAGAATCCAAATTTGCAGGGCAAAGTTGTCCTAATT CAAATTGTGAACCCTGCAAGGGGTTCAGGGAAGGATGTTCAGGAAGCAAAGAGGGAGACATATTTAATTGCCCAGAGGATCAACGATATTTATGGTACAA ACCATTACAGGCCAGTTATTCTCATTGATCGTCCCGTTCCTCGTTTTGAGAAGAGTGCCTATTATGCTGTAGCAGAATGTTGCATTGTTAATGCAGTAAG GGATGGTATGAACTTAGTCCCATACAAATATATTGTTTGTAGGCAAGGAACTGCACAAATGGATAAAGCACTAGGAAGAACAAGTGATTCTCCTCGTACG GGCATGCTTGTTGTCTCAGAGTTCATTGGTTGTTCTCCTTCTCTAAGTGGGGCAATCAGGGTCAATCCCTGGGATGTAGATGCTGTGGCTGATGCACTGT ATTCAGCCATCACAATGTGTGATTCAGAGAAGCAATTGAGGCATGAAAAACACTTCCGGTATGTCAGTTCTCATGATGTGGCGTATTGGGCTCGCAGCTT TATGCAAGATTTGGAGAGAGCATGCAAAGATCATTACACCAAAAGGTGCTGGGGAATTGGTTTGGGCCTAGGGTTTAGAGTTGTTTCACTTTCTCCTGGT TTTAGGAAGTTGTCCATGGACCACATTGTTTCAGCATACAAAAGAACCAATAGAAGGGCCATATTTCTTGATTATGATGGTACTGTTGTACCACAATCTT CTATAAATAATATCCCCAGCCCTGAAGTGATATCTGTGCTAAATGCTCTGTGTAATGATACCAAAAACACTGTGTTTCTTGTTAGTGGAAGGGGAAGAGA TTCTCTTAGTGATTGGTTTTCTTCATGCAAGAGGATGGGACTTGTGGCTGAACATGGGTACTTTTTAAGGTGTGTATGTTAGTGTTAGGAAGACTGAGCA TCACATATTTTGTCTCCACCCCTGAAAAAACTGAGTATTATTTTATTTTTTGCGAGTGCAGGTGGAGTGAAGATTCTGTATGGGAAACGACTAACGTGTT TGCGGACCTTGATTGGAAAAACATCGTGGAACCTATCATGCAATTGTACACAGAAACAACTGATGGTTCCAATATGGAAATTAAGGAAAGTGCGTTGGTG TGGCGTCATCAAGATGCAGACCCTGATTTTGGCAAGAGCCAAGCCAAAGAGTTGTTGAATCACTTGGAAAGCGTGCTTGCCAATGAACCCGCGGTTGCTA AGAAGGGCCAGCATGTTGTTGAAGTTAATCCTCAGGGAATAAGCAAGGGTTTGGTTGCTGAAAAAGTTCTTTCGACTATGGTTAATGGTGGCAATCTACC AGATTTTGTAATGTGCATTGGAGATGATATTTCTGATGAAGACATGTTTGAGAGCATATTAAGGACTGTCTCATGTCCATCATTACCAGTAGCCCCTGAA ATCTTTGCCTGCACTGTTGGCCAGAAGCCTAGCAAAGCCAAATATTATCTTGATGATCCTTCTGATGTCTTAAAGTTGCTTCAATGTCTTGGTGCTTCTT CTAATCCAAAGCCCAGACATCTAGCGCAATTCCAGGTTTCTTTTGAGAGCAGAGTTTGAGTTAAGACATGGCAACACATCATTATTGGTCTTGTTTGAAT CAGGGAATGTTTGGTTATTATCACTTAACATTACACATGGTGGGACCTTGCTGTTGCAGATCTGGTTCTTTGCATGTGAACCGTTTTGCATTGCCTCTGG AAACTTTCCTTTTTGGGTTAGACAGTGTAGTTCATGGATGACATGTCAAATCTTCTCATGTACATGGTAACATTAATTGTTTGTATTTGCTGGTGTCTCA TGTAGTTTTAGGTTAGGTGTGTTTAGTATTTTAGACCTTATAGCTGTTTACCTTGAATGTAGGACACCAATAACTTGTACAGTTACACTATCCTTGTTAA CAATACAAAAATGTCAATCTGTTTTGACATCTCTTGCTTTAGCCTAATGAGTAATCCGTGACCAAATAAAAACAAAATTCTTAGAAGGGTAACTTTAAGT CCCAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_175849;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_499350

FPKM

• PAB: 2
• PNAB: 0.4
• PS1: 0.5
• PS2: 0.2
• PS3: 0.3
• PW1: 0.6
• PW2: 0.7
• PW3: 0.7

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_499350

• Blastp: Probable alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 10 from Arabidopsis with 75.19% of identity
• Blastx: Probable alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 9 from Arabidopsis with 75.79% of identity
• Eggnog: synthase(COG0380)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G60140)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019421262.1)
• Pfam: Glycosyltransferase family 20 (PF00982.20)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;