Ll_transcript_497940

Id TrinityTRINITY_DN50275_c2_g2_i9
Name TranscriptLl_transcript_497940
SequenceCATCACACCAAACACAACACAGCTACTCCGATACAAGGTGATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAAGAAAGAAGAAGAAAAAGGAACTCAGATATTCC ATTCCCGAATACAACAATCACTCCACTGATCCACTCCCGATCTGCGCTGCTGCTCATTAATTCCTTTATTATCTCATTCCAAACCCTAATTACTCGATAG CCATACCATAGCCCCTTGCCTTTTCAATCATGCGCTTCCAACTACTATGAGGAACACTCTTTCCCGTAATTCTACTATTCCTACTACCACTACTCTTAAT ACTAATACTAATACTAATACTGACAATCACAATAATAATAATAATAGAACATTAAGGCTGTCCTCACCTCAACCATCTCTTAAACGATTCGGATTGTGTT CCCCTATCGTCTTCCCGGAAAGGCGAGGTGCCAAACTCAAGGCTTCTTCCACTGATGATCACGCCATAGATACATCCAAGGATTTTGAGCATAGGATTCA CATAGGAGGAAGAGGAATTCCAGCACCTGGAGATGAGAAGTCTGATTTATTAGGATATGTCGTGTTCTCTGGAAAACTTGCTTTGGATAAGAGAAAGCTT ACTACCGTCAACAACAACAAAAACAACAGTGCTGCTTCTCAACAAACCTCTTCTGATACTACCATCAACCAACAAGCTGTTGATGCCAAACTAACAAGCA AGGCTCTAGTTTGGGGATCCCATCTGCTCAACCTTGATGATGTCATCTCGGTTTCTTATAATGTGGGTCTCAGACATTTTACAGTGCACTCGTATCCATT CAAAAAGCCTTCTTGTGGTTTTTCTTGTTTTATAAAATCACAAAGAACTCGTAAGGACTTTCGCTTTGTGGCCTCTAATTTCCAAGAGGCCGTTCAATGG GTTGCTGGATTTGCAGATCAACAGTGTTTCGTCAACTGTCTTCCTCACCCTTTAGTGTCTTCCAAGAAGCAAGCATCCTCCGAATTGCTTCCTACCGATA CCCCTCCTGAGTTGCTCTTCAGATGTAAAACTCCTCCCAAGATGCTTGTCATTTTAAATCCACGATCAGGTCGAGGTCGTTCAAGTAAAGTTTTCCATGG CATTGTTGAACCAATATTTAAGCTTGCTGGGTTCAGATTAGAGGTAGTCAAAACAACATCTGCTGGTCATGCTAAAACTATTGCATCAACGGTTGACATC AGCACTTGCCCTGATGGAATTATATGTGTTGGTGGTGATGGGATAATCAATGAGGTCAGCGCACTACTGTAATGATTCAGTGACTTGTTATCTATGCTGT TTTGTTTTATGAAAATACTGCCCTCTTTGATGTATTGTTTGTTTTCCTCATCAAAAGCCTTTCTAATGTTTTTTGACTGAATCATAACCTATCTGGGACT GATTGAAGGATCTTGGTTGATCTTTGTTGTTCATTCCAGCGGCTCACAGTTAATTTTTTTTATCACATTTAATGTAGGTAGTCAATAGCGTGCATAGCAG AATGTAGCAGGTTTTTGGCCATTCCCCGCAACGCCACGGTGGATAGTGGTGCAAATGGCCGTAGTGCCTGTGGCTGGTCAAATAGTGGCAGAATTGTGGT TCAAATGAAAATTGCGGGTCATGACCCGCTACATGTTTTGCTGCGAGTGGAACCCTAATTTTAGAGGGAAAAATATTTTTTGCCCCTTTTTAATATGTGA CAAGTTTTTTCCCTTGGGTTTTAGGTAATTTAACCTCCCCCTTTTTTCCCTTCCACATAACACGTTGATTTTTCTAGGCCACATGATTTTTAATCGGCTC TACCTTTCTTCTTTCTTCTTCCTAACTCTAGTATACATGTTTGGTTGCTTACTCATTCTTCACCAACATAGAACAAAACTACAAAGCTTTCTAATTTGCA AACATGCCTTGTCTTAACTCTGCAGGATTTGTCCTTGGCCCCTAATTGTTTGCTCCATCATCTCTATTGATTCTCTTATCAAACTAATTGAATCCGTTTT TGACATCATCTTCGCATGGTTCAATTTCATGAGATACAACACTGTTATGACCTCTAACTTCGATCACATCTAGAATTTGTAATACTCATAATATTTTATC TTGATTATTAATTAGGAATCTGTCTTTAATATGATATATTTTAGTATTTTTGTATATTTGTATGTTAGACTATAAATTACTTATATATATTTTTCTTAGC TGTAGCGATTGTCCTGCTACCCACTATCCTGCTTTAGTGTTTTTGGGGTCGGCTATGCTTCGCTATCCGTAATTGACTACCTTGTATAGTTATTGTAGGA GCTGGTTCATAATCACACACCAAGTATTGAAACTGATATATTTATCCCCTCTCTTGAACCAATAGCAGGCCAATATTGGATCAGTGGGGTTTACTATGAG GCAATGGAAACAAAAAAATGAAGATAATCCTTCTTCCCTAATTCCCTCAATGATCTCATTTTTGCCTTTATTTTCTCTCTTCTCTCCTATCTACAAAGAC CATAACAAAATTTCTCCCCTGTCCACAACTCTGCAAAGGTGGAAGCTGTGGTCACAATGCGTCCTTTGCCCAATTGGGCCTTTGATTCATCATGGATCAT ATTCCCTTTTCACACATATGCATTAGTGCTAGGAGACTTGCTAACATTTTTTAGGGGGACAAAAGTGGAGTTAATAATCTAAGTGGGTTAACAGAATAAG TTACTCAAACTGTTGAAGAGTTGTCTCAAGGTTTCATATTTATTTTTTATTGGATTGTTGTTTGTTCTTTTATTATTTTCCTCCAGCATTTCCTTTTATA GAAAAAAAATAATTAATAATGGCCTAGTTATATGGTATGGTTGATTTGCAGGTCCTTAATGGTCTTCTTAGTAGAGAAAACCAAAAGGAAGGAATATCTA TACCTATTGGAATTATACCAGCTGGTTCTGATAACTCATTGGTATGGACTGTTCTTGGAGTTAGAGATCCAGTTTCTGCAGCAATGGCAATTGTAAAGGG GGGCCTTACTGCTACAGATGTTTTTGCTGTTGAATGGATTCAGACTAATAAAATTCACTTTGGATTAACAGTCTCATATTATGGTTTTGTTAGCGATGTG TTGGAGCTTTCTGAAAAATATCAGAAGAGGTATGGCCCACTGCGCTATTTTGTTGCTGGATTCCTGAAGTTCTTATGCTTACCGCGGTACAGCTATGAAG TTGAATATCTTCCAGCATCAAAAACTGAGAGAGAAGGAAATGTCTTAGTTGAAAGTGAAGTACTTGACATGTCAGATCTGTATACCAACATCATGAGTAG ATCGAATAAGGATGGGTTGCCCAGAGCATCTAGTCTTTCCAGTATTGACTCGATAATGACTCCAAGTCATATGTCTGGTGGAGACCTGGATACCTGCAGT AGTACTCATGCTAGCACCGAGCCTTCCGAATTGGTGCGCGGCTTAGATCCAAAGTCAAAACGCCTGTCATCTGGAAGGGGCAATGTAACATCAGAACCCG AAGTCATCCATCCACAGCTCCCTCTGTCAACAACTCCAAACTGGCCAAGAACCAGATCCAAGTCAAGGAATGATAAAGGATGGAGTGGATTGACCACCAC ACATGATACCTCTAGATGGGGCAATTCTGCGACAAATGACAGAGAGGATATCTCATCAACACTTTCTGATCCAGGTCCTATCTGGGATGCTGAACCAAAG TGGGATGGTGAGCCTAATTGGGACGTGGAAAACCCAATTGAGTTGCAAGGTCCTCTGGATGATGCAGACATAGGATCCACCAAGGAGATCGTGCCTCGTT TTGGAGACAAATGGGTTGTTTCAAAGGGACAGTTTGTCGGCATTCTGGTTTGCAACCATGCATGCCGAACAGTTCAGAGCTCTCAGGTGGTCGCACCCAA AGCTGAGTACGACGATAATACTCTAGATTTGCTCTTGGTTCGTGGAAGTGGTAGGCTGAGGCTATTGAGATTTTTCTTACTTCTACAGATGGGTCGACAT CTTTCTCTTCCATATGTCGAATATGTCAAGGTAAAGTCTGTGAGGATAAAGCCTGGGAAGCATACTCACAACGGATGTGGTATCGATGGTGAGCTTTTCC CACTCACGGGACAAGTAATTTCGTCTCTGCTTCCAGAACAGTGCAGGCTTATCGGTCGTTCTCGTGTATGATGATAATTGGGAGTGAAGTGTTTTGATTC TTTGTGATGGGTTCCGGGAAGATCATGTACCTTCTCATTCTCATATATATGAATTCAGATACCAAATTTGTGTTGTCAACTATTTTGTTGCTTGTAACAG CTGAGCTTTGTAAATCTTTTGTTCCGGTTATATGTATCCGTTGTTGCTTGCTTATCTGTTTTCGTTAAAAGGGAGAAAAACTGCACGTTTTGTGCATTTC AAGCTGCAAGCTGCTGAATGTACTGCACCATCTAATTATTCTAGATATCATCCAAAAAAATCTAATTATTCTGAAGCTTAAAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_175959; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_497940

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_497940

BlastpSphingoid long-chain bases kinase 1 from Arabidopsis with 74.94% of identity
BlastxSphingoid long-chain bases kinase 1 from Arabidopsis with 74.94% of identity
Eggnogdiacylglycerol kinase(COG1597)
KeggLink to kegg annotations (AT5G23450)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019452861.1)
PfamDiacylglycerol kinase catalytic domain (PF00781.23)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;