Ll_transcript_498721

• Id Trinity: TRINITY_DN50294_c0_g2_i15
• Name Transcript: Ll_transcript_498721
• Sequence: ATTCTTACTCCTCTGTTCTCCGTCTACTTTTCTCCTATTCGATTCTCTTTCTACAATACGCCACCATGAATCCTGAATAGTAAGTTCAATTTCCCTTCCG TGATACTGAATACCTTGTTTCGAATCGTTTCCCGTGTTTTTCATAAGTCAATTTCATTTAGATCTGCTTTAATTATCATTATGTGGTGTTGAATTTTGTA TTCGGTTTTGTCTAACCTCTTTTCTGAAATTTGTGTCGGTGGTCATAGCAGATCGTGATTATGAAATTTCGTTGATGATTTTGATCGGTTTTTATGGAAG ATAGATAAATTATTTTAGAATTGTTTGTTTTTTCTGGTCCAGTTTGGGATTTTGTTTGTTTTTAAATTTTACGAAGGATTTTGTTTGTTTGAAAAAGTGA TATAACTGCAGAAATTGAGCTAGTATGCAGAAAAATATTTGAAATTGTCTATTAGCCAAACACAGTAAGGTGTCGGCTATTGCTGTGACTTGTGAATTTC TTAAGATGGTTATAGTTATGTGGCGAGGAACCGCATGATTACTGATATTGTATTCTAGTTAGAAATTGTTACTGTCTGACTCTAACGCAATTACTGGTAG TTTTTTTAAGGATGAAAAATAAACTGTTTTGAATGAAGGGGTTGTTGAAGTTCTATAGATAGATCTGTGAACTTGATGGTTAACCACCAAATGGTCAATT GATTTATAAATTTATAGGCATTCTTAGCATTTCAGTCCTCTTAATGGCAATGGTTAAGGAATCAATAAAAAGTGTAAGTTCTTACTTAGAAACTGCGCAC ACCACTTTTCAATGTATTGCAATTAAAACTTACTCATATTGATTCGATAAGCAGTGCCTAGCTTAACATTCTCCAATGCTAAATGAGAAAAAGTTATATT AAACAAAAGAGCACAACATTTGTGCATAGCCATTGAATTTCATCTGGATTTGTGTAGACAATTATTGCAAAAATCTGTGCAGAAATTTAACAGTGCCTAA TGTATTAGCTGTGTGGCTAATCATACTATAATGATTTTCCTATATATTTAGGAACCCATGTGCTACCTTTTAGAATTGTCATGTTTTCCGTGTGCTGTGG CACATGCTTTTAGATTGTCCTTCATATTTTTCTCTGTTTGATTGGACGGACCATCACTATTTTTTTGTAGTGACTATTTGTTCAAGCTTTTGCTTATTGG AGATTCTGGTGTAGGCAAGTCATGTCTCCTTCTGAGGTTTGCTGATGATTCATACCTTGACAGCTATATCAGTACCATTGGAGTGGACTTTAAAATTCGC ACTGTGGAGCAGGATGGGAAAACTATTAAACTTCAAATTTGGGACACCGCTGGTCAAGAACGTTTTCGTACAATCACTAGCAGCTACTATCGTGGGGCTC ATGGCATTATTGTTGTTTATGATGTCACTGACCAAGAAAGCTTCAACAACGTTAAGCAGTGGCTGAGCGAAATTGACCGTTATGCAAGTGAAAATGTTAA CAAGCTTCTAGTTGGAAACAAGTCTGATCTCACGGCAAATAAAGTTGTGTCCTATGAGACAGCAAAGGTGATTTATATATTTGTTGTCATGTCCCACTCA CATCTATTGAACTAGAATCCTTCCTTTTGTCTAGTAATAATGGTTTGAAACTTGAGTTTTCTGTTTATGTTTTCAGGCATTTGCAGATGAAATTGGAATT CCTTTCATGGAAACTAGTGCTAAAAATGCCTCCAATGTGGAACAGGCTTTTATGGCCATGGCTGCAGAAATAAAAAACAGGTGCTGTATTCTTATTTGCA TTGTTATTAACTGAGGTGTGAGAGAGTTTAGAGTTTAGTCTTACTTATAAAAACATTCCTATAAACTCCTTATAGCTTATATTGGAGATGCAAGTTATTG CTTTCCCTTTTGCACTTAAGGGTAAAAGTGTCACATGATTTGGCTGAAATCGGTTTCCTCCATTTATAAAATGGAAGACATACCGTAATTTTGTGAAGAA AGGGCATCTTTGTTTTTATGACATAGTGAATTCTGATTTGTTAATGACCAAGAGGTATATATATACCTAGATGATTGACGTTTCTTGATTGTGGTTCTTT TGCACAGAATGGCAAGCCAACCCATG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_176098;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_498721

FPKM

• PAB: 0.7
• PNAB: 0.1
• PS1: 0.1
• PS2: 0.1
• PS3: 0.2
• PW1: 0.1
• PW2: 0.2
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_498721

• Blastp: -
• Blastx: GTP-binding protein YPTM2 from Zea with 95.49% of identity
• Eggnog: member RAS oncogene family(ENOG410XQN5)
• Kegg: Link to kegg annotations (542396)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019421974.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;