Ll_transcript_490114

Id TrinityTRINITY_DN50326_c3_g1_i6
Name TranscriptLl_transcript_490114
SequenceTATTTTGCTTTGCACAATGAACTTTAAGAACACACCATGTTATAGTGAAATTCAAAATTCAAAACCCATTAATGTCTCTCTCTTGGGTTTCCATTCTGTG TGAAGAAAAGTGAAAATGTTACGCTTTCTCTTCTTCATCTCCATCCAAAGCTTTTCTCTCCGCAACATTCCCATCAAATTCCACTTCACTTCATCGTCTC TCTCTAGGGTTTCTTTGGCTTTAAAAAGTGAGAATTTCTTGTAACGCTTTCTCACTTCTTCAACTCTATTGAAGATTGCTTTACAAGGCGCTGCTCTCCG CGGTATTCCCATCAAAATCCACTGCACCAGACCGAGCGTACCATTGCCTGAGTTGAATTCTTCGATAGGAAGCCTATAGCATCAATGGAGGGGAATATTC AGCCCAGCAAGACTTTATGGATAGGTTTCCCCCCTTCTTTTCGGATGGATGAACAGATGCTCCATAATGCATTGATACTGTTCGGCGAGATCAATAGAAT CAGGAGTTTTCCATCAAAAAATTGTTCGTTTGTTGAATTCAGAAGCATTGATGAAGCTCGGTGTGCCAAAGAGGGTCTTCAAGGACGGCTATTTAATGAT CCTCAAATATTGATCAAGTATTCTAGCAGTGAGTTGCCACCTGGAAAAGATTACTCGGGCTTTTATCCTGGAATTAAAGGGCCAAGACCTGATGTGCTAC TTAATGAGCATCCATTTCGGCCACCACAGATGGATATGTTTGGCCATAATCGTCCTACGGTTCCAAATAATTTTCCTGAACAGCTGCCACCTAGTGGTAA TTTTCCACCAATTGCATCAATTCGATCTTTCGGTCCTCAAGGCTTTGAACCTCCTATCTCTGGACCTGCGTTTAATGAGATGGGCACAATCCACAATTTT CAGGATGGTAGCTCCAAAAGTCAGATAGTTCCAAACTGGAAAAGACCATTCCCTCATGCACCAGAAATGCTTTCTTCTCCGGTGCCAGGTACTAGGCCTC CTACCAGGTCCGCCTCTGGTGCAAGTGATGTACATGGCATAAACCAGTTTCCGAGAGATTCTAAACGCTCAAGGATAGATGGTGGTTTGCTCGTTCATGA TGCTCCATTTCCTTTAAGGAATATAAATGGAGGTGTTATTGATCCAAAGAGTCAGCATGGTCCAGTGGGCATATATGGCGTACCTGGTTCAACCCTATCT GATACAGATCATATATGGCGTGGAATGATTGCAAAAGCAGGAACACTTGTTTGTCGTGCTAGATGTGTGCCTATCGGGACAGGGATAGGGACTGAGCTTC CTCATGTTGTTGACTGCACAGCTAGGACGACGTTGGATATGCTCACAAAATACTATGCTGATGCAATTGGTTTTGGTACCATCTTCTTTCTCCCCGATAG TGAGGAGGATTTTGCTTCGTACACTGAATTTCTTTGCTACCTCAAATCCCAAAACCGGGCTGGTGTTGCAAAGTGTATTGATAATACCACTTTATTCTTG GTACCTCCTTCTGATTTCCTAACCAAAGTTTTGAAAGTCACAGGGCCTGAACGTCTGTACGGCGTGATTCTTAAATTTCCAAGTGATGTGTCAATGCAAC AAGCAACACATTTGCCTGCACCCTCAACTCAGTACATGCAGCAGATACCTCCTTCGCAAACTGAGTATGGTTTGATCTCTGCAAAGGGACAGCAGGTTTT GACAATGGATTATAACAGAATGTCGCATGTGGATTCCAAACTTCCTCCAAAACCATTTCATCCAGTCACAACTGGCCCTCCTTCAGTCCATTCTGTTCCT CCTGATTATCCGCCTCATGCTGTTTCTGCGTTGCAAGCTGGAGTTACATTGACACCGGAGCTTATTGCAACATTAACTTCCTTGCTCCCTGCAGGTACAC AATCATCTACAATTGATTGGGCAAAGACAGCAGCAGGCTCCTCGACTGTGCAACCACCATTTCCTTCAGTTGCACCTAATGATGGAAACCTATCTTATTT GAGGAAACAGGATCATCAAATTGGAAATCCATCTAGTCATCCTTCTCAACAGTTTGGGAGTATGTATAACGTTCCCAGTGCTCAATATCAGCATTATCCA TCAGCACCTACTCCTGGCCACCCTGCTCAAGTGGTCCCTGGCAATTATTATTTCCAAGATACTGCTGCCAGCCTGCAGCAGCAAGGTACTGTTTCATCTG GACCAGTGAATAATTTCATTGTTCCTTCTCAAAGTGGACAGGTAGTTGTACCTCCTCAACTCAATCAGCAGTATCCCATTGAAGTCTCCTCCAGCACCCA GAATGGCTATGGAATGGTTCAGGGAACAGATGCCTCTGCATTATATAGTTCTCAGGCTTTTCAGCAACCTTATAATCCAGTTGCCTCATTTAATCAAGTT CCGGATGCTAATCCTTCACAACAACAAACTGTGTTGCCCTACACAGCAGACAACGTGAACTCAGAGCCTCCCAGTCAGCAACTGCATTCTGCTAATTTTG GAGTTGGTCAGGGTGCATCAGAAGTGGAGGCTGATAGGAACCAGAGGTATCAGGCAGCGCTACAGCTTGCTTCCAGCCTCCTCCAGCAGATACAGCAAAA GCAAACTGATGGAGGGCATGGCCCAGGAAATCAACAATGAGAATTGTTCTCTGTAAGTAATCATCCAATGACTAATTCTTTTAAATAGATAAAATCTTTT ATATGTAAACTAACCTAGGTTGAATATTTCTTTACATTTAGGGATTGCGATCATATTTTTATTATTTTTCCCAAATCATCTTATGCCATAGGGATTTTAT GCCATATTCTTATTATTTCCCCCAAATCATTCGTGGGTTCTGAACCCAAAATCCTGGAAAACTATCTTGTCCCTGAGAAATATGGAAGTCGAGTCTCTGA ACTTGAAATGATAAGTTAAGCACTCAAAGGCCAATGTTTGTGTGAGGAACTCTTGTGATACAGTTTTGTGCAGAGGATGTTTTGGAACATGAAACTTATT TTCTTTCCTGGGTGGGGGCATTCGAAGAGAGGATTCAACGTGTTAATTGGTTGATTGTGTAGGCAATTTGTTGTGAGGCTGGGTTTTTCCTTTGGTAGGT TTGGCAGCCAACTTGTTATTAGGATTGTTTTCTTGGTAATTTTAGGATCACTTATTACACTAGTTTTATGCATAGTTATTAATAGTAGCACACTATTCAT TGCAGTTAAGTCAATATTGATGAGGAGGGTTGGCTTTAGAGCTTTAAGTAGCAGTTACTGTTAGTGTTTAGGAACCCAATTGATAGGGAGGATTAAGTAT TTGGTCCTTCTGGGAAAATAAGTTGCTTTTGTCTTTCTAATATCTATACACTATCAGTGTAAAGATTTATACACAGACAACATATCATCCACCATTCATT AGTATTATTACTTTTTTTGAAGAGTCAATGATGATTGGAAATCAATGGTGGATGATGGTCTAACAATGTGTAAAACTCTTACACGGTTACTGCATACATC TTTTTCTCTATTTATAAAGTACTTTCCTTAGTAAAATTGTTTCATCAAGTGGCTTAAACATGAACCATGTAGCACAATCCCTATGGTACCTGTATAAGAA TGCTTGTGCCATGTTTCAGATTGAGTCTAACAAATAGCAAATACCCCATTTGAGTAGACCTTACTTTTACTTACTGTGTGCAATATCATTAACTTTATTT ATGATTGTTTTTAATTTATTTGACTTTTAATTCCATCATATCCTGTTCCATTCTGTCTCTGCAACATGTCATAATTTTATTTCTGATTATTACTATAGCG TACTTTTTGATTGGTTGAACTTGTTCTTAGATACCCATAAAATATGGCATATTGAATCTTAAATTTGCTCTACTGCAGTGTAAGTGTAATACTTTTAGGG CTGGGAATCCAATCCTTCTAACTTACTACACAGTGACCTATAATTTTCACTATGTAAGGATCTTTAATGTGCTTTCAAAGATTATGTGAGGACACTTGCT GACAAATTTGCAAATTTAGAGTTACCACTATTAACTAAATTTTCAGTTAACCATCCTCAAGAAATTTGGGACCAAATGTCAATTCTTTCTTCCCCCTTGT TTCTCTCATGTTCCCTTGTTAATTACCAAAGTGAGAATATAAAAAGTACACATTTTTCTTTGGGATATGAAATGGATAATCATATAAAGATCACTACCTC AATTTTTTTTGTACTAGTAAGATCTATGCACTGCGAGTGTACAAATTTAATAACTATGTAAAAAACTCTTACACCAGCGGTGCCCGAAAAAGTGATCTTA CTGGAAACGTATGCAAACCCAAATGTTAAATCCTGGGAACTACACTTTTGAATGTTGTGTTCTCATGGCAACATGATCATGTTGCCCACGTGGTTGGTCT CTATGCCGTGTCCTGTAGTGAACATTTTGATTTTTGAGTGTGTTTGATTCTCTAAATGAAGGGATATAACAGAATTTTTCTTATTTTCCTGCTAATCCAT GATACAAAATTTGTCAATAGTACTAAAATGTAACCACCTTCACAAATTCACAATCATCATCTTGGCCTTCACCATCATCTTTTCATCAATATTACCACCA CCATCAATAAAGGGCGTTTTTGTACTTTCCACATCATTTTACGTGTGTTGTCTACTAAGGGTCTGTTGGTGAGTTGACTTCAGTGTTATCTCGTCAATCT TCACTTACGGACTCAAGGCATTAATTACCGAATGACATGAAATAAAATTTGTGTTGAAACTCAACTAATTTTGTATTAATCTATTTGTGTTGTAACAATA AGTTGTTGGTCCAGTGATGGAAGATCATCCTTGATCCCAAGGATATCCAAAAGGTCAAAATTTCAATTCTTGTAAGTGACATTAATTAGGAGGGATAATC GTATACCTCAAAAATGATTAATTTATTACCCATAATAAGATGAGAAGATACTTAGATCTTAGTAGTACTAACATAATCTACTTGTTTTGTCTTTTGGTGT GTATTGAAGAAACCCTTTTATTTATATCTTATAGGTGACAATTTGGGCTGGGTAGGTTCATGTTTGGGCCATGATCAGGTTAAGCCGAAAAGTTTTTTAT AATAATTAGAAAAAAATCACCTTAAGCCCGAGGTTGGGCCATTTATTAAACTATATTATGGGCTTTTATGTTATATGAGTGGGCCAATCCAGAGCCCATG GGTTTATTTGAGAGGATTTTAAAAACTTTATTCTGGTCAAAATAAGATATGAGCTCTACTTTACTTTAATATAATCTAAGCTATAAATAACACCTGTTTT TTTAGAACATGTAGATTGTTATAGCTTTGGGGCATTGGTTTAGAAATCAAAGTTAAATTTTTTACCTTGGTATATTCAAAGTAGCAAGCACTTAATGCTT AGATATATTTAGCTATGAATGTTTTTCAAAGATTTCAATATTATTATCTATCTATTTGCAAAATGGTTGATTAATGATATGATTTCCCATACCCCAACAA ATAAAATAAGTGAACAAGGTATAAGGTATTGCTAGAGTATGAAGTTACCAACAATTATTTACTTTGTTTGCAAAGTTACCAACATGCATACTAATGTTGT ATTATTTTTTTGTTTCCTATTTTTCATGGAAGTGTAGGTGATGGTTGCATGGAGC BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_176408; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_490114

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_490114

BlastpFlowering time control protein FPA from Arabidopsis with 39.3% of identity
BlastxFlowering time control protein FPA from Arabidopsis with 39.03% of identity
EggnogRna-binding protein(COG0724)
KeggLink to kegg annotations (AT2G43410)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019448259.1)
PfamRNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) (PF00076.21)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;