| Id Trinity | TRINITY_DN50338_c1_g1_i6 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_490367 |
| Sequence | GATTTTTCAGTAATGTGCCGTCGAGGGAACTGATATGTAATCTCCTCAGTATTTCTGAATTGATTTCATATGATTATTTGTCTTGCCTGACCCCACGATT TTCTGCATGATCTTTGCTTTATTTTTCATTCATAATTGCAGTAACATATATGGGTTTTTTTTAGCATGACATCTGATTGTATCTACACATATTATTGAAC CCATTGCATAGACATCACCTTAATTCTAGATCTCCAGCAAAAAATGCAGCTTTGGGGTGAGTTAGGTCACAGAATCAAGATTGAAGTAGGAACACAAGTG CTTTTAGAACCTCTCAGATATGAATTTTTTTCTACTGAAAAATGCTCATGAAATTATTGTATGACCGGTGATTATATTAATGCTTGAAGTTCCACTTATT CTAAGAAAATGCCTCGCTAATGAAAGCATGAAAACACTATAAAGTCGCAATAAAACTTGATTGCTAGAAAGAAATCTTTTTGAATTTTCCTAACCCTCGT AAATTTGTAACATCCTACTTGAAGTTCTAGCATAATTAGTGTAGAACTACTATATATCAATAAATTGCTTATAAGTGACAGGTACACCCTTTATCTTACA TCACTTTAAATAATATTATTTAGTTTTTAACACAGTTAAAGAATTCTGTACACAGAATATTATTGTGATATATGTCTATCATTTCATGCCTGATTTCATT GGTAATGCTGGGTTTTAAATCCTTTGCTGTGATTGATATTTATGGCCATTTTCCTTCTTGTAATGTGGCGTGTATCAACATCATGTTAACCTTAGAAATT CTTTTTAGGTAAAACATATTAGAAATTCAGAATTAGTAAAGTCAGACACAAATAAACCCGTATGTTAGAGGAATTCTGAAGGGAGGGAACAAGGGAGCAC ATTTGTTAAAATCAATTAAAAGTTATTCTCAATTAAAAAGTGCAAGTCAAAATGAAACCCACCTTTTGTCATTGATAGACATATTGCCATTGCTCTGATT GCTTGAGTCTGTTAAGCTATTGGTAGTTTGACATTCTAGGTGTTTATACTATATTGGTTTGCTGGGTATTGGTTTAATTTGACTGATATGCATATGGTGT TGCTTCATGTTGCCCTGAATTACACTACTGTAACATCGCCGTGGTTTAAGCTGTTGAATTTAGTGAAATCTTCCTTTCTTGTTAGCAAAAATTGTGATGG GCTGTACACTGTACAATAATTATAGTGTTGGTTGTACTGGCCCAATTATTTTGTGGAAAAAAATTATGAGTGTGTGCTATTTAATTCCCACTGTCCCATT TTCTGCCTTTTTGTTCCTTTGCACATCTTGCATGGGGATGCTGATCTATATTGTGGAATAAACTTCCTGGTGGGAATGCCTTCTATAGCAGATGCCATCT GTTCACTGTTCATCTTTGTGTTGTAGTAATTAACATCCACTCCTGCCTGAATTTGGCATTCATGTGTTCCTAGCCTGATGGATACTCTCGACATTCTTTT GTTGTCACATATATCTGAATGTTGGAGGGTGTGCTTTCTATCTGTTGTATTTTATTTTCTAAAAAGGAAAGCTTTCCACTGTGACTAATATTGTTAGTTG TGTATAACAGGATATGGGCAAATAGACAGTCTGCCGCAAGGTCAAAAGAAAGGAAGATGCGGTACATTTCTGAGCTTGAAAGGAAGGTGCAGACACTGCA AACAGAAGCTATATCCTCGTCTGCACAATTAACTCTCTTGCAGGTTTTGTTTTATCTTATCATCTGCATCTTATGTTGTATAGCTTTCTGTTTTAGTCTA ATCCTACAACTGGTTACTGTTGTTTAGATCATTAGATGTGTTACTGTCTTAGTCCTTCTGTTCTTTTTCATTGGTGTAGTTTTATTACCATGTCACCTTC TGATTGAAAAACTAATTGGAGGAATTATAATCATTGCATTGTGGCCTCTTATGATCAGAGAGATACAACTGGAGTTTCCACTGAGAACAGTGAGTTGAAA TTGAGGTTGCAAACCATGGAGCAACAAGTTCACTTGCAAGATGGTAAACTCCTGTTATAGATGCTTGAGGCTAGTGCTCTACTATTATTTTCTCTTCTCT TTCTAATTCTACAGTCTACACACACACATATATATATTTAAAAAGTATTTTGTTGGGCTGTTGGCAGACAATTCTAAGCCATATGTCATTTCTTGATGTA TCGTTTTACTTTGGTTTGTGTTGAAGCCAATTTAAAATAGATAAACTTTCAACTTATTTCAAAATTTTGAAGTTGATGAACTGATATGCAGACTGCAGTA TCTTACTTTCACCTTGCGTTTGAGGTTTATGCTTTTCTTTTATGACATTAGTAAGTAATTCCCTTGGATTAATACATCTGTCATAGATAAAAGTGCATGT CCAGTGTAAAGTTGGCTTCAGTCATACTGGTTGTTTTCTTGTGTGCATTTGGAATGTGCTCTCTTAAGTGGAAGATGAGATATCTTGATTTTGTTTTATA TGTGTTCGAGTATTAAAAAAATGTGATCCAATGCACCGAAGCTCACCCTCTCTGTGTTTTAGGATTCAGTCCATGAATTCAAATTTGCTTGTGCAAGGAG AGTTCATCCTGATTAGCAGCTCTGTTAGAAGCATTAATTCTTTTTTTT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_176504; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_490367
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Transcription factor RF2a from Oryza sativa with 88.89% of identity |
| Eggnog | Transcription factor(ENOG4111FX9) |
| Kegg | Link to kegg annotations (4347578) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019454142.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |