Ll_transcript_345210

• Id Trinity: TRINITY_DN50411_c0_g1_i18
• Name Transcript: Ll_transcript_345210
• Sequence: GCCAGTTTAAGAAAGCTGTGAAAAAATGATATCTAAATTAATTAATAAGCTGAATAAGGAAATTAGTTAGTGAGATTCAAAAATAATAAAATCTAAGCTT TTATTATTATCATATATTGCAGGTAGATAGAGAGAGAGAGAGGGTGTAAACGCGTATAGCAGTTGAGAAACAGTGATAGATAGATCTGTTTTGGCTTTTG AGAATAAGAAATAATCACAACCGATGGGAGAGGTGGCGCGTGGAGGTGGTTGCGCTCCGATGGATCTCTTCCGTTCCGAGTCGATGCAACTCGTTCAACT CATCATTCCAATCGAATCCGCTCATCTCACCGTTTCTTATCTCGGTGACCTTGGCCTCCTTCAATTCAAAGATCTTAATACAGACAAAAGCCCTTTTCAA CGGACTTATGCTGCTCAGATAAAAAGATGTGGAGAGATGGCTCGTAAATTACGTTTTTTCAAGGAGCAAATGTTGAAGGCAGATGTTTTACCAGTACATT CTACAACAGTGGTTGATGTGAACATTGATGATCTTGAGGTAAAACTTGCTGAAATTGAGTCAGAGTTAACCGAGATGAATGCAAATGGCGAAAAGTTGCA ACGCTCTTACAATGAACTTGTGGAGTATAAGCTTGTTCTGGAGAAGGCTGGTGAATTTTTCCACACTGCTCAAAGCCGTGCCATAGAGCAGCAGAGAGAA AATGAATCACGCCAACTGGTTGATGAATCTTTGGAAACACCTTTATTGCAAGACCAAGAATTGGTAGGTGATTCATCGAAGCAAGTTAAATTGGGCTTTT TAGCTGGTCTTGTTGCCAGGGAAAAGTCTGTGGCATTTGAGAGAATTTTATTTCGTGCCACCAGAGGCAATGTGTTTTTGAGGCAGTCTGCTGTTGAGAA TCCTGTCACAGATCCGGTTACTGGAGAAAAGACTGAGAAAAATGTATTTGTGGTCTTCTATGCTGCCGAAAAAGCGAAATCCAAGATTCTGAAAATATGT GACGCCTTTGGCGCTAATCGTTACCCTTTTGCAGAGGATGTTGGAAAACAAACTGAAATGATAAAAGAGGTATCCCGAAGAATTTTAGAATTGAAGACAA CAATAGATGCTGGACTGCTGCATCGGGCTACCTTGCTACAGACTATTGGTGATCAATTTGAGCAATGGAATCTTTTGGTGAGGAAGGAGAAATCTATTTA CCATACCCTGAACATGCTAAGCCTTGATGTGACGAAAAAATGTCTTGTGGCTGAAGGGTGGAGTCCTGTTTTTGCAACAAAGCAGATCCAAGATGCCTTA CACCGGGCAGCAATTGACGCTAACTCTCAAGTTAGTGCCATTTTGCAAGTTCTGCATACTAGAGAGTTGCCACCTACATATTTCCGTACAAACAAATTTA CTTCCTCATTTCAAGGAATTATTGATTCATATGGGGTTGCGAAGTATCAAGAGGCAAATCCTACTGTGTACACTGTAGTTACCTTTCCATTTCTTTTTGC TGTTATGTTTGGTGATTGGGGACATGGAATATGTATACTACTGGCTGCTCTATATTTCATAATTCGGGAGAAGAAACTTTCTAGCCAGGTAACCTTTTAT TTTACAATGAAAATTCTTCCTTCTATGAAAGTATTAAAAAGAAATGTTATATTTTGATGGGAAAAGTTAGATTGATTTTCTCTACTTTTTGTCTAAAATG TCTTATTAGATGTCTCATGCTATATATGCATGATAGATCTATATGCAGGAACATATTTAGACCATGTTGGTAAATAATCTTGGTATTTTGACAAGGTTAG AATCCTTATGGATTAATGAAAACCTTTGGAAATCTTTTGTGGTAACAGTTCTTTATGGCAACCACAGAACTCTTCCATAGCATATTCAGTAATTTAATAA TTTTCAAAGGTTCATATTGCTGCCTGATAAGTGAGACAATTTTCAAGTGTGTGGAACACTGCTCTTTTCAACACCATGCACCAAGAGTGCTTGAATTCAT TGAAATCAGTGGTTTTTGTTACTGTAAAAAGGCCATATTTTTTGTGTATTAGTTTAGATGGTCACCCTCCCTATTGAATTTTGTAATTGTTGCAAAATGC AACAGACTTACCAACTAAGGCAACTGGCACCTTTGTCCATATTCCATTGTTGCTATTAACCAGATGATGAAAAAAGTCTGTAAAATCTGTTGATTGACAT TTGACAGTTCGTTTGCCATCAATTTCTGCCCAGTAGTGTTTTATTTTTGTTCCTCTTGCATAAATATATTTCAAGGCCTTTTTTGTTTATAAAAACAGTT TTCTAACATTAAATCTTTTGGTGATAAACAGAAGCTTGATGACATCACAGACATGACTTTTGGAGGACGTTATGTTATTTTAATGATGGCAATCTTTTCA ATCTACACTGGTTTCATATATAATGAGTTCTTCTCTGTCTCATTTGAAATCTTTGGTCCTTCTGCCTATGAATGTCGTGATCTGTCTTGCACGGAAGCTA CAACAGTGGGCCTGATAAAAGCGCGTCGTACTTACCCATTTGGTGTGGATCCTGTATGGCATGGTTCACGAAGTGAATTACCATTTCTAAACTCCTTGAA AATGAAAATGTCCATTCTTCTTGGGGTTGCTCAAATGAACCTTGGAATTATAATGAGCTTTTGTAATGCTAAATTCTTTAAGAACAGCGTAAATGTATGG TTCCAGTTTGTTCCCCAGATAATATTTCTCAACGGTCTATTTGGCTACCTATCCCTTCTTATTATTGTGAAGTGGTGCACTGGTTCTCAAGCTGATTTGT ATCATATATTGATCTACATGTTCCTGAGCCCGACAGATGATTTGGGTGAAAACCAACTCTTCGTTGGTCAGAAATATCTGCAGATTACACTTTTGATTCT GGCCTTTATCGCTGTGCCTTGGATGCTGATCCCAAAACCTTTTATTTTGAAGAAGCAACATGAAAATAGGCACGGGGTTGAATCTTATGCACCACTTCAA ACGACAGAGGAAAGCTTGCAAGTAGAGTCAACTCATGATTCCCATGGTCATGAGGAATTTGAGTTCAGTGAAGTCTTTGTACATCAACTCATACACACCA TAGAGTTCGTACTTGGAGCAGTTTCTAATACAGCTTCTTACCTTCGTCTATGGGCCCTTAGTCTTGCTCATTCAGAGTTATCAACTGTGTTCTATGAGAA GGTTCTTCTAATGGCATATGGGTACAATAATGTGGCTATCCTGATAGTTGGTCTGATTGTGTTCATTTTCGCTACCGTTGGAGTGTTGCTTGTGATGGAA ACATTGAGTGCCTTCTTGCATGCTTTACGTCTTCACTGGGTGGAGTTCCAGAACAAGTTTTATGAAGGAGATGGTTACAAGTTCCACCCTTTCTCCTTCT TATTGGTAGAAGATGAGGATGAGTGAATAAGGTGTTGTATTGTTATGTTACTACCTTTGCACCTTTACTTATTATTTCGTATGCGGGGTGTAATGGTGGA ATTCTTGGAGCTTTTTGGTCCAACACCATTCCGTATCTTATTTATTTATGCATTTGGGTGGGGAAATAAATATTATATTATGATATTCTAGGCTGGCATG GCATGGCAGTGTAATAACTACAATATAACTTAATATTTATGTGCTTTTTGCCTTAAAAAATTGATCGATATTTAATATGCTGGTATCATAAGATGCATGC TTTTGTCATAAAAAAGTTGATCTAGTCGTGTCCGTCTATCAACGTGTGGCATCAGCAGTGCCCCTCTTTTATGTACAAAATATA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_177010;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_345210

FPKM

• PAB: 25.6
• PNAB: 32.1
• PS1: 33.9
• PS2: 23.6
• PS3: 34.9
• PW1: 35.6
• PW2: 39.2
• PW3: 26.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_345210

• Blastp: V-type proton ATPase subunit a3 from Arabidopsis with 73.48% of identity
• Blastx: V-type proton ATPase subunit a3 from Arabidopsis with 73.48% of identity
• Eggnog: ATPase 116 kDa subunit(COG1269)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G39080)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0001114)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019454213.1)
• Pfam: V-type ATPase 116kDa subunit family (PF01496.18)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;