Ll_transcript_404887

• Id Trinity: TRINITY_DN50519_c0_g4_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_404887
• Sequence: TGGTGTGGCCCTGGAATTGGGTTCTCAGTTGATACTGCTGTTGCTAACTCCTATGTGGATTGTGTTGTGGCAATGAAGAATGTATCTGCAAGAAGGAATC TTGATGTAGAGAAGATAACACACAGGGAGGTACTATATCTAGTTTCTATATAATTGTTCTTCATCATTAGTCTTCAATGATTTGGTGGCTAAATCTGTTC AAAAATAGATTAATTTAATAATCGATTACATGCCTAATAAATTATTATATTAATCACATGAATAAGTACCTTTCCCTTAATGGAGAGGCGAGTGATTGAT TTTAGGCATATTTTTAATATAGTAAAATTGTGATTTCATAATAAATAAGAGGATAGAAGTGTTATTACAACTTGTATTTTATGTGTTATTTTGAATCGTT TGTCTCTCCATTAATAGAGAGGATTCATACTCCAATGATAGCAATATATAAGTTGTCACTCAAATATTGCTAGAATATAATCTTTTGACCTATTTTCATA AACCAATATTTGGAAGATATGTGTGGATATATTTGCTAAAAATCCATACTATGATAATCTAATTCGTTTGTGCTGTGTGAAAAAACATTTTATGTATTGT AAACTAAAAAAGTATGATGTTGTTTTTGCTTTGGTTGATTAATGAGAAAAATGTTATTGGTTTCAAAGTAATACTATGACTTTTTAAAAAACTGCTTTTT TTCTTCTTCATTAAAGATTTTTTTTATAATTTTACTTAGATTTGATAAACTTGTCAGTTTATGTCCAAGATAGCTTTTATAAAAGCTGTTTCCATACAGC TTTAAATTGAACAAAACAAGCTCTAGGTATTTTTTATGTGTAATTTAATAGAGACAGAATATTTGATTCCGTTTGAATTATATTGTGGTTATGCTGCACA GCTAAAGTTTACATTTTTATTGTGAATGTGTCCTCTTCATAACTTGATAGTTGATAAATATTATTGATATTGATTAATTTGTGATGTTTTGTTCATAAAT CACAATAATAACAGATTAGGAAGTTGACCAGTCCTTTTCTTGTTGAATTTTGAAAGAGCATTTTCATTAAATGATAAAGACAAAACTAAATGTGCTACAA AGTACTTCTTCACTTCCAGGTTCTGCATTTTCCAATTTATGTTGTGAGTCAATTCTCTTTCAAATTGAAAGACTTTTTGCAACAACAAAAATGAGAATAC TTAATAACTTTTAATATTAATTGATTGTAAGACCGAAATTTATTTTTCTCCCAATTTTTATATCATAAATGTCCTACCCTAAGTCACTCCACATTTATCA ACTATACTCCTATTGTGTTATCTTTCTTCTCCTAATGCGTGCACGCCTTTCATTTCCTAGTTACAAACGCATGGGAAAGTTATTTATTGGTTTATTGTGG ACCCGTAAAGTAAGATAAGACTTCAACAACATATATTTCATCATTGATATTGTACATGACAATAATAATAATATAGACATGTGAATGATTAACGCAATTT TAGTTCCAATTGTGATATATTAACTAAGTTTCGTTTTTGTTTTGGTTTCTAGTTGCTTTAACATGTTGTCTAAATCTCCTTCATAAATTAATATATTAGC AGCATCTATCTTATTTGAGAAGGAACACTATAAACACAGAAAGTATCTCAATTCTTGATGAATATTCAGACATATTTACACCACGCCCTGGCTTAGAGTC TTTTACTACTTCCAGATACTATCCTCGTGTTCTGCATCCTTCCTCTCATGGTCTTGCTAAGATAATGATACTTCAAGGAAGACTATTAATGGAGGAACAA TTGAATTCACATGACCAATTTAGAGACTGGAGACTTGATGTTGATAACATGTCATATGAGCAACTTCTTGAGCTGGGTGAGAAAATTGGTTATGTGAACA CTGGACTTGAAGAGGATGAGATGAGACTCAACATAAGGAAACTTAAGTTTGTAATTTCAAATGGTATATCAAAGAATCAAATGGACAAAAAGTGCACCAT TTGTCAAGAGGAGTATGAAGGAGGTGAAGAGTTAGGGAGGCTAAATTGTGAACACAAGTATCACTTTCAGTGTATAAAACAATGGCTTGTGTATAAAAAC TTCTGCCCAATTTGCAAGCATGAAGTTGTGGTTAGACAAATGCTAAAGTCCTAATGTTCTTCCCCTTAAATTTAAATTTGTGTTTTCATATTCAATATAA GGAAAAATGTTCATTCCTTGTTGTTCAATATTCATGGCATCTTTTACAACTTCTGGGCTTCCTTTGTTATATTGGGCAATTGTCTCTTAATTGGATTATG CTTTTGCATATTATTACTTATGAATAAGGATGGCAATATGAGCTTAGCCGGCCGGGCCAATCTGTTCGGATATGTATTTTTAGCGAGCCGAGTTGGGGAT TTTAGCCCAAAAACCCATATTCAGCCCGTTTTAGTAGCCCATTTTTAGATGGGTCATGACGGATCGGGCCGGGTTAGCCCGACGGGCCAACATTAAAAAA CAAAAAGAGTTGTAAGGCTTCCCACG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_177788;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_404887

FPKM

• PAB: 108.2
• PNAB: 5.2
• PS1: 1.3
• PS2: 0.2
• PS3: 0.8
• PW1: 4.3
• PW2: 4
• PW3: 4.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_404887

• Blastp: E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 from Arabidopsis with 50.89% of identity
• Blastx: E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 from Arabidopsis with 50.85% of identity
• Eggnog: zinc ion binding(ENOG41121N2)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G34040)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019443280.1)
• Pfam: RING-H2 zinc finger domain (PF12678.6)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;