Ll_transcript_386276

• Id Trinity: TRINITY_DN50969_c3_g4_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_386276
• Sequence: TTTTCGATACAAAATTAATTTTAAATAAAAACGGACCGGTACAATCAGTATGGTTCAATTGAAAACCGACAGTATTACTACTTTTGACCGATATGATTAT ATGACCAGTTTAATTATTGTACCGTACAGGTATTGGTACCAGTTCACCAGTTTACCAGTTGAACCGGACGACATGAACCGGTTTTTACAATGCCAATAAG TTCTCAAAGGTTACTTATCAATAAGTCAAAATAGGAGGTTGTAGATAAAAACAAAGTATTATATATGCATGAAAATTGAATGTAATGCCTAGAAATATTG AAAATGAACAATGTCTCTTAATCCTAAACCATTAAATATTCACATTATCTACATAATCTCTTGTTATTATAGATGATTCCTGTAGCTGCTAATGATGTTG CTTTCTCAACTCATGCTGTTATACTGAATTTAATTATACTATCACAAATTGCAATCTATGAGGTAAAGTAGTTTCATATTTAAGAGATTTATTTTTCCTC TTATATAACCATAATTCTAACATTGTTAATGTCTTGTGATTGTTGTTTATGGTTTTTGCAGTGTGGAACTCAGAAATTCTCCAAATTTGCTATAACAATA GTAGCAGTTGTGTTGTTCAGTGCTGCAGTTTGTTTTTTCATAGCATTACCAAGCCATTCATGGCTTTGGTTAATCTCCATTTTCAAGCAAGTTACCTTCT TATTATGACTAATTGTAGATATGCATGATGATTCTTTGTTTCTGAAGCATGAACATATAATTGTTGTTCATTCCAAATTTCTCAATTTGGGTAGGTTTGA AGTATGAGAAAGTTTGTGTTTTTTTGTAAGTAAGAAAGTTTGCTTTCATTTTAGTGTATAAACAAAAAATCAGCCTCTTCAAGTGTATTTAATAGAATAT AGGATAAAATTTGTTTCTTCTTTTGTTATTTTTATATAATTGTTAATATTATGGTTGTCTTATAAGCTATGCTATGATTAAATTTTCATCTAATTATAAT GTTGTGGAAATGTATCACACTGCAGTACTATTCAAGTATGTTTGACCATCATCAAATATTTTCCACAGGTCAGAATGTCTTAACCTCCACATTATGATCA TCTGAAACTTTGACCAGAGATATTACATTGAGTTTGTCTTATATGTTATATTGAGTTTGTTATATCATCCAATATAGGACCTCTAACATTGTCACCCCTT TAATTACCGATAACCATGATGACTTTAACTCAATCGATACTGACCTAATGATAGCCCTTTTTCTTTTGGTTGTTTCACTCACTTATCAATATTCGGTAAC ATAGCAACGGACGTTGGTTCAAGTGGTACATGCTTGATTCCCCTTAAGGAAGGTATCGGGTTCGATCCTTGTGGATGAAAAAAATGTCCGCGGGGAGAGT TAGCTCCACTTACCTGTGGATATTCCTGGCTCGGGCAAGATTGCCTCAAGTGCAAGGATACAGGTGGGAAACCAAAAAAACATACCTTAATGCAGCCATA GGTAGCCTTTTTCATAGCACAACTTCCAATAAAAGTAACAATTGTTATTAGGACTTAAGCACAGAACTCAAACCAAAAGACTAGTTTATTAGGTGGAAAA GCCACATATCTTATGTACCTTATTGATTTTGCTATGCTACCAAATATGTGACTCCTAACTTCAAGATATATTTCTCTTCCTTGATATGTGATAGAAATAC AAAATTATGGATATTCTGTTAAGAAATGCAGGCACTCATGAACTTCATGAGAAAGAGCACTGATGGATTTAGCATTGGCAGTATTCTCCTTGATTTTTCT GGAGGGATCTTCAATTTTTCACAAATGGTTGTGCAATCCATTGATCAAGGTTCATGGATGAACTTCTGTGGGAACATTGGAAAAGTAATGATATCCTTGG TATGGATTTCTCTGTCACTCCTAATTCTTAGCACCTTTTTTCTAAGATGATTAATGTTTTGCTCTTATTTCACCAATTAAATCAAGAATTGAGCATTTAC ATATTTTAAATTATTAAAGCAGCATGCCTCATAAGGTAAGTGACATAATGAATGGAGGAATTGCTTAAAGTTTGAAAGTTTTAAGCTGAGGTTTGTCAGG TTATTTAAAAGTCATCCTGATCGGTGGATCGGCTAAATAGATCGAACGATGCCATAATATTCTAACATAAAATCATGTCTATCCATAAAACATTGATTTC TAAGTCTTTTTTTAATGATTTCGACTATGATTTTTCTCGATCCCCTCTTCCTATGAATTGGACTAGCCTTCATTTGATCTTAATACTTTTATATCCAAAT CATCTAAGATGTTATTCTACCATTTTTTCTAAGTCC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_181400;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_386276

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0
• PS1: 0.3
• PS2: 0.2
• PS3: 0.6
• PW1: 0.1
• PW2: 0
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_386276

• Blastp: -
• Blastx: Cystinosin homolog from Arabidopsis with 46.73% of identity
• Eggnog: cystinosin(ENOG410XQSD)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G40670)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019427033.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;