Ll_transcript_388678

• Id Trinity: TRINITY_DN50972_c0_g1_i9
• Name Transcript: Ll_transcript_388678
• Sequence: TTTGATGTTCTGGGTTTTGCATTTTCTGTCTAATTGTGTTAGAAAGTTGGTTCCTTTCTTCAAATTCGTTGTTAAATTTGATGTTTTGATGATACCCCAG ATTTTATTTTTGCCCTATATCATGTGTATGATGCTTTTCCAATCTGTTAATTTTGATTTTATTTTGTGATCTCTATCATGTTAGATTAAGAATATTGAGA TTCTGGGTTTTCATTTTCCACCGTTAGGGTTTTTTCTGTGTTATCGGTCTCTTATGTGTTAGAAAAGAGTTTATGAAAGGTTTTGAAAGTGTTTATTTTT ATGTCTTGTATATCAAAGGTTTTGAGCTTATTATTTTATGGGGTGCTTATTGTGTTTGTGTTATGCTTATTTAGCAGATAGGGTATTCACTTTTTGATAT TTTGCTTCTGTGATGTGTTGAAATGTCTGTATAGGGATTAACCTTAGATGTAATGGTGTGCTTCTATATGTGTCAATGCATGCATTGTTGTTGTGTTTTG TTCACTGAAATGAGAGGTTTGAAGTTACAGAAACGGGTTAAAAAGATGTGTTTCAGTGTTGCAAAATAAGTTTGGGTGACAACAACTAACAATTGTGTAT TCTCTTATTTGAATTTGGTTGATTTTTCTCATGGAGAGTGGCTTGAAATGTAATATTGGTATTTGATCTTTGTTCACTGCTATTGCTTTAGGTTATTTGA AATTCTAGATTTTCCTAAAGCGAAGACTGCAAAGTGAATTGTAATTTTACATTCAGTACCTCCTTCGTACTGTAGATTCAAATATATTTTCTATTCAATC CCACTTTTGTGTAATGATAATTTGGAGGAAAAAAATATATGAGCTTACCGTTACATTATTTATAGCTACTAGTCTATCAACAATTTAAAGTTCATACATT ACAACTTTCCAATTCTTTACTCAAAAAGTGATTAGGATGTTGGGATGGTCTAACTATTACATTGAAATCTTTAGACTCATTCGAGTTCATCTATCTTTTG CATTGATTGGGGTTGAGGTAAAGCGAAAATGCATTTTTATATTGATCAAACTGTCTAGGGAATTCAGAATCTAATTTGGTACGTGAATATATATTACTGC TTCTCAGTCCCATCCCGCTTGTATAGTGTTTTTTGTCTCCATTATTTTCTTTTCTCATATTTTGATATTATTGTTTGCTAGAACAACAACCAAGCCTTAG TTCACTAGGATGGGTCATATTGTATTAGTTTATGCATAAATTCTGTGGGATTTTTTTACCAAACCAGAGTGTTTTATTTTTTCACTTACTCATGTTCAGA AATACCATTGCAGGAGGAACTATTGCTTTGGTTTGACACTTAGATTGCACCTTTTTCTCTGAGCAGTGAATTTGAGAAGGGTTCATTCCGACTCAGTGAC AGAACAAAACAGAGAATCGGGTGCTTTTGTGCTGATGGCAACTAATGAGAATCTTCCACCAAATGTAATAAAGCAACTTGCCAAGGAGTTGAAAAATCTT GATGAATCCCCTCCCGAGGGCATTAAAGTTGTGGTAAATGATGATGATTTTTCTACAATATTTGCTGACATCGATGGTCCAGCTGGGACTCCTTACGAGA ATGGAATTTTCCGCATGAAGTTGTTACTGTCTCATCATTTTCCACATTCTCCGCCTAAAGGTTTTTTTCCTAACAAAAATTTTCCATCCAAATATTGCAA CCAATGGAGAAATTTGTGTCAACACTCTTAAAAAGGATTGGAATCCTACTCTTGGATTACGGCATGTTCTAATTGTTGTTAGGTGTTTATTGATCGAACC ATTTCCAGAATCAGCTCTAAATGAGCAGGCTGGGAAATTGCTGCTTGAAGACTATGACGAATATGCTAGACATGCCAGGTGAGTTAAGCCGATGATGATA TTCTTATCATTTAACTTTTGTTCGGAAACTTACTATGTATAATCTTGTGATGGAGTGATCTGTGACAAATGAATTTTAAGCAACACTGTAACTGAGTATT TATGTGTATGTATGAAGTACCTGATTTTCTTTCTCTTCCTTCCTAAGTTCAGCCGAAACACCTTTCTTTCTGTTCTTAAATAGCTCACTGAAGCAACCAT TTTGAGTAGATCACTCTTGTTTACGAGTTCTGGATTTATTTTCTCAAGTTCGATAGAAATTTCACGAGTTCAATAAACCTGCATATTTGATTTTTAAAAT TTCCCCCCTTATTCATATTGTTAAGGAGATTAAGTTGTTGTACGCAGGCTTTACACTGGAATCCATGCAAAACCAAAGCCCAAGTTTAAAAGCCGAGCTA TATCTGAATCAACAACTGCTCTGAATGTTGGTCATACAAACACCTCAGTGCTTAGTAGTGAAATAAAAGCTGCACCACCCGGTGCTGAATTGCTATTGCA GTCCTCATTAGCCCGCTCTACCACACCAACAAGAGGAAATGGTCAGGAACATACCCTTCCAACCGAGACGATCGTCAATGTTTCTGCTAATATAGTAAAT TCTGCTGCTGCATCACAGAAGAAGGAAGGTGGACAAGCAAAAGCTCAGCCAGACAAGAAGAAGATAGATGCTAGAAAGAGAAGTTTGAAAAGATTGTAAT AAAGTGGTTCAATAATTGAACTTTTCATTTGTGGCTTAGTTTTGCTACTTTATAGAGAGGAAAAAGGGAGGGAGTCCTTGGAAGATGGATTTTGATTTGA CATTTTCTGTAATGATCAACTTCTGCTGGGAATAAATGGATGAGATTGAATTGTTATGGCA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_181421;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_388678

FPKM

• PAB: 0.5
• PNAB: 0.2
• PS1: 0
• PS2: 0
• PS3: 0
• PW1: 0
• PW2: 0.1
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_388678

• Blastp: -
• Blastx: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 22 from Arabidopsis with 87.84% of identity
• Eggnog: ubiquitin-conjugating enzyme(COG5078)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G05080)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_007161841.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;