Ll_transcript_289765

• Id Trinity: TRINITY_DN51383_c1_g1_i15
• Name Transcript: Ll_transcript_289765
• Sequence: AAACCAGCGAAGCACTGCCCGTGTCCATTTTGTAAAGAGGGACCAGAAGCTCCTTCCCCTTCTTATTTATACAATTCCTTTTCATTTCTTAATTCTTCCA TGGCTTCTACCTCAATTCCCGCACCTGAGGCCGTACAGGTTCTCGTTTCCTTACTCTCCGATGATTCCTCCACCGTCAGAAAATCCTCCATGTCTTCTCT CAAGGACATCGCCGCCTTGAATCCTTTTCTCGTTCTCGAGTGCTGCGCTGCGGTTTCGCGTGGAGGACGACGGGGATTTGGAAATATGGCGGGAGTTTTT CAAGTGATGGCATTTGGGGTACGAGCTCTAGACAAAAGAGATGTTGATCCTGCTTTCATGGCAAAACTCGCTAAGATTGCCACTGCGGAGATGATTTCGT CAAAGGAACTCAATTCTGATTGGCAACAATCAGCAACACGTCTACTTGTTGCAATAGGCTCACATTTACCTGATCTTATGATGGAAGAAATTTTTCTTCA TTTATCTGGTACAAATGCAGCATTACCTGCTATGGTCCAAATACTTGCAGAATTTGCTTCTACTGATCCCTTGCAGTTCATTCCCCGTTGGAAAGGTGTA CTTTCACGAATTTTGCCAATTCTTGGAAATGTACGAGACATGCACCGGCCAATTTTTGCAAATGCATTTAAGTGTTGGTGTCAAGCTGCTTGGCAATACA GTACAGATTTTCCTTCACATTTTCCCCTGGGTGGTGATGTCATTGCAGGTCATTTCTAAATTCTGCTTTTGAGCTTTTGTTGAGAGTTTGGGCAGCTTCA CGGGACCTAAAGGTTCGGGTAGCATCTGTGGAAGCACTGGGACAGATGGTTGGTCTCATAACACGTACACAATTAAAAGCAGCTTTACCAAGGCTTGTTC CTACAATATTGGACTTGTATAAAAAGGATCAAGATATTGCTTTTCTTGCAACATGTAGTCTCCACCATCTGTTAAATGCCTCGTTATTGTCAGAAAGTGG TCCTCCTATGATTGACTTCGAGGATTTGACTCTTATTCTGTCAACACTTCTACCCGTGGTTTCTTTCAATAGTGACAGCAATGATCAATCAGATTTCTCC GTGGGTCTGAAGATGTATAATGAGGTGCAGCATTGCTTTCTGACAGTTGGCTTGGTGTATCCAGAAGATCTGTTTTTGTTCCTTGTAAATAAATGCAGGC TGAGGGAAGAACCATTGACCTTTGGTGCACTGTGTGTTCTGAAGCATCTTTTACCAAGGTTATCTGAAGCTTGGCACAGTAAAATACCTGTACTAGTTGA AGCTGTGAAGTCTTTGCTAGAGGAGCTAAACTTAGGTGTCCAAAAAGCACTTTCTGAGTTAATTGTGGTTATGGCTTCGCACTGCTACTTGGTTGGTTCA TCTGGTGAATTGTTCATTGAATATCTTGTCCGCCATTGCGCTCTAACAGATCAACATTGGAGTGATTTTGAGAGCATCCCATATAAGAAAACAGAGATGA AAATTGGAGCAGTTACTCCAGCAGAGTTAAGAGCAGTTTGCGAAAAAGGTCTCCTTCTGGTAACTATCACTATTCCTGAAATGGAGCACATTCTTTGGCC ATTTCTGTTGAGGATGATTGTTCCACGGTCCTACACTGGTGCTGTTGCCACGGTTTGCAGGTGCATCTCGGAATTGTGGCGGCATAGATCTTATGGCAAT GACATGTTGAGTGAGTGTAAAAACCGTCCTGATATGCCAATTGCTGAGGAACTTCTTGCCCGTTTAATCGTGCTTTTGCATAATCCTCTTGCAAGGGAGC AGTTGGCCACCCAGATTTTGACAGTTCTATGTCTTCTGGCACCTCTATTTCCAAATAATATCAATTTGTTTTGGCAAGATGAGATTCCAAAGATGAAGGC ATATGTTAGTGATACAGAAGACTTGAAACAAGATCCACAATGTCAAGACATTTGGGATGACATGATAATTAATTTTCTTGCAGAATCTTTGGATGTGATT CAAGATGCAGATTGGGTTATGTCTCTCGGAAATGTTTTTGCCAAACATTATGAACTTTATGCATCTGATGATGAACACGCCGCACTCCTTCACCGGTGCT TGGGGATTCTGCTTCAAAAGGTTAATGACAGAGCTTATGTCCATGATAAAATAGATTTGATGTATAGGCAGGCGAGCATTGCGATTCCAACAAATAGGCT TGGGTTGGCAAAAGGAATGGGATTGGTTGCGGCATCCCACTTGGATACGGTGTTGGAGAAGCTAAAGGATATTCTAGACAATGTTGGACAGACCATATTT CAGAGGATAATGTCATTATTCTCCCATAGTTTCAGAACAGAAGAGTCTGATGACATACATGCTGCTTTGGCACTAATGTATGGATATGCTGCAAAATATG CCCCATCCTCAGTTATCGAAGCCAGAACAAATGCCCTTGTTGGGACCAATGTGCTTTCACGGCTTCTTCATGTGCGGCACCCCAGAGCAAAGCAAGCTGT CATCACAGCAATTGATTTACTAGGTAATGCTGTCATTAATGCCGCTGAAAGTGGTGCACCATTTCCCTTGAAAAGAAGGGACCAATTGCTTGATTATATT TTAACTTTAATGGGTCGAGATGACAGTGATGGCTTTGCAGATTACAATGAACATTTGCGTACACAGGCCCTTGCTATAAGTGCTTGCACCACTTTGGTCT CTGTGGAGCCAAAACTAACAGTTGAAACTAGAAACCATGTAATGAAGGCCACACTAGGGTTCTTTGCTATACCAAATGATCCAGTTCATGTTGTCAATCC TCTTATAGACAACCTAATCACTCTCTTGTGTGCAATTCTTCTCACTAGTGGAGAGGATGGGAGAAGTCGAGCAGAGCTGCTTCTGGTTATCTTGAGGCAA ATTGATCAATTTGTATCTTCCCCTGTTGAGTATCAGAGGAAAAGAGGTTGCCATGCTGTCCATGAGATGCTTCTCAAGTTTCGGCTGGTTTGTGTTAGTG GGTATTGTGGACTGGGAAGCCAAGGGAGTCATGTACATAACAAGCTAATTGATCGCACCATATATGGGAATTTTTCAAAGCTACCATCTGCATTTGTATT GCCAAGTCGTGAAGCTTTGTGTTTGGGAGATAGGATAATAATGTATCTTCCACGTTGTGCTGACACAAATTCCGAAGTCAGAAAAATATCTGCACAAATA CTTGACCAACTCTTCAGCATCTCTCTTTCACTTCCTAGACCTGCAGGTTTATCTATGTCTTCTGAAGCTATAGAATTGGCATACAGTGCTTTATCTTCTC TTGAGGATGTTATAGTCATATTGAGGAATGATACATCTATTGATCCATCAGAAGTTTTCAAGAGGATTGTTTCCTCCCTCTGCATTCTGTTGATAAAGGA TGAGCTGGTAGCTACACTGCATGGATGCTCAGTAGCTATATGTGATAAGATCAAGCAGTCAGCTGAAGGTGCTATTGAAGCTGTTGTTGAGTTTGTTACA AAGAGAGGGAATGAGCTGACTGAGATTGATATTGCAAGGACAACACAATCATTGATCTCTGCCACTGTATATGCAACTGATAAGCATTTGCGCATAGAAA CACTTGGTGCTATTTGTACTTTGGCTGAAAGTACTAGTCCAAAAACTGTATTTGATGAAGTCCTGGCTACTGCTGGAAAGGATACAGTCACCAAGGATAT ATCCAGGCTACGTGGTGGATGGCCCATGCAGGATGCATTCTATGCCTTTTCTCAGCACATGGTACTGTCAAATTTGTTTCTAGAGCACGTGATATCTGTC CTTACGCAGACTCCTATCCTTAAAGGTGATGTGGATAAAGTTGAGGATAGCCAAATTGACAATAATACAGAGGATGGCAAACTGCAAGCTGCAATTTTTG CTCTTACTGCTTTCTTCAGAGGTGGGGGGAAAGTTGGAAAAAAGGCTGTTGAACAAAATTATGCTTCTGTTCTTTCTGAGCTTACACTGCAACTTGGAAG TTGTCATGGTTTAGCTAAGTCTGGTCAGCATGGACCATTGCGGAATCTTCTAGCCGCATTTCAGGCATTCTGTGAGTGTGTTGGTGACCTTGAGATGGGC AAGATTTTAGCTAGAGATGGGGAAATAACTGAAAATGAGAGGTGGGTTAATCTAATTGGAGACATAGCAGGCTGCATATCAATAAAGCGGCCAAAAGAGG TACAAAATATTTGTCTCTCTTTGACAAAATCATTAGGTCGACCCCAGAAATACCAAAGGGAAGCTGCAGCTGCAGCATTATCAGAATTTGTTCGTTATAG TGAACTTGGATCGCTTTTGGAGCAAATGGTCGAGGTTTTGTGTCGGCATGTGTCAGATGAGTCTTCAACTGTTCGCCGTTTATGTTTGAGAGGATTAGTT CAGGTCTTGTGTTTCAACCTATGATATTTTGTCATGTAGCCATGTTTTCTTCATTTTCAGTTATAGTTATTTTCACATGGATTTAAGTTTTTTATATGCT TGGTTGCTTGCTAAATTCATCTTCTACTTTATTTAATGTTTGTTTATCATGTCTAAGGTAATCTGGATATGTTTAGACAATGTCCAATTAATTGACTTCT GTTTTAAACTATTGATGTGTATACACTGTCCAGACTATTTTGCATCAAGGCAAGCCGCAGGATTACTTTCATCATTTTATTACCCTTTTTGTTGAATGTA ATGCGATCTCAATATCTACAAAAAGTTAATTCTGATATGACTTGTGAATGTGAATCCATATGGGTGTTAACTTCATATTTCCAGTTAGATTTTTAATTCT GTGGAGGATAGTATACTCCCTATGTTGCCCTTTTAGAAGAATTAACTTCTCCAAATATTGAAGTTGCAGATTCCATCTATACATATTCTGAAGTATGCAG CTCAATTGTTGGGTGTTATATTAGCTCTGCTAGACGATTGTGATGAATCTGTACAGTTAACTGCAGTTTCATGCTTGCTGATGATTCTCGAATCTTCACC TGATGATGCAGTTGAACCTATTTTGCTTAATCTGTCACTACGGCTTCGAAATCTTCAAACAAGCTCGAATGCAAAGATGCGAGCCAGTTCTTTTGCAGCA TTTGGAGCGCTAAGCAACTACGGAATTAGGGGACTAAATGAACCATTTGTTGAGCAGGTACATGCTGCTGTTCCTCGCTTGGTTTTGCATCTTCATGATG AAGATGTTACTGTCCGACTGGCCTGTCGGAATACCATGAAACAAGTTTGCCCCTTGATAGAAATCGAAGGATTGGTTTCCCTGCTTAACACACACAGTTT CCTATCTGATCACAGAAGTGACTATGAGGACTTCCTCCGAGAGATTGCAAAACAATTTATGCAGTATCTTCCATCCAGAATTGATACTTATATGGCGTCA ACGGTGCAGGCTTTTGATGCACCATGGCCTATAATTCAAGCAAATGCCATATACTTCTGCAGCAGTATGCTATCTCTATCAGACAATCAGCATATTCTAG CTGTTTACCACACAAAGGTATTTGGTATGCTGGTGGGACAAATGAGTCGGTCACCTGATGCGGTTGTTCGAGCAACATGTTCTGCTGCTCTGGGCTTGTT GCTGAAATCCTCTAATTCAACATGGAGAGCGATTCATCTCGATCGGCTAGAATCAACATCCAGGAACCATGAGCTTGAGTCATGATTAGCAATGAGCTCG AACCATCGCATACTGGTCAGCTACTCAACTTATTTGGGGGGTACATGTGAAACTGTGGAAGTCAGGTGTTGGCATGATTGATGAGATTAAAGTTCATAAT ATGTGCAGTCTTTATTTGTTTTAGAAATGATCTCGCTATTTAATCCATTTGGCTGTGTCTTTTGAGGGCGATCCTTGCTGCAATAGCAAGTTACCCTGTC TTGTGACAGAGGTTACACGTTCTGTGGACCATTTTTAATGTAAAGTTTGAAAAGAACCCTTCCATTCTCATTGATGTACATTAATTATTTTTCTGATTGT ATGTGATGTTGTATATTAATCTAAGTTTTATGTCATTATCATTTGTTGTAAACTTTCATTAAAGATCTTCAACGGAAAAAAAAAACTTTCATAAAAGATT TGTTTGTTT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_184522;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_289765

FPKM

• PAB: 4.5
• PNAB: 8.4
• PS1: 7
• PS2: 5.5
• PS3: 7.5
• PW1: 5.1
• PW2: 5.7
• PW3: 5.4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_289765

• Blastp: Protein SHOOT GRAVITROPISM 6 from Arabidopsis with 72.43% of identity
• Blastx: Protein SHOOT GRAVITROPISM 6 from Arabidopsis with 72.65% of identity
• Eggnog: Heat repeat(ENOG410XQE8)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G36810)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0002789)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019425603.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;