Ll_transcript_382066

• Id Trinity: TRINITY_DN51401_c2_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_382066
• Sequence: GCTTCGTTATCCTTGGGTGCACCATCACCAGTAGTTCATCCACCTATGCAACTAACATCTTCCGCGTTGAGGAATGGACTCTCATCCGGAGCAAAGACCA AGAAGCCAAAACCAGTAAGTGTTTCAGTTTTAGAAGATCATGAAAATGAAAACTAGATACTGATTTTTACTTCCTCCACGTTCATTGTTTTCCATTCTTA AATAACATATATAAAAAAAGACATTGACTAGTGCATCCTCAATCAAGTGTACAATTACCTTCGACATGAGTTACTAGCAGAAGCCACGTTGCTAATCGAG GAGGTTCTTCGGGTGCCATTGCAACAAATGGACTTGCTCCTTCCTCTTATGATCTATTGATTGGAAAAAAGTTTGGACAAGGTGGCCTGATGATAATCAC TTCTATGAAGTTGTTATTACTAATTATAATCCTGCTGAGGTGTGTTATACTATTATTGTAGACTACAAGAAACTTTGTAAAATATGTGCCGTAGTTAATC TATCTAATTAAATATTTGGCAGGGACGACATGCTTTGGTCTATATGATATGAATTCAGTAGATGAAACATGGGAGTGGGTCAATCTCAAAGAGGTAAAAT TCTTGCGATATTCTTCGGTCTGTGGTAAATGGTAATTTTGTAGATGAAACATGATGACTATGTCTTATATGTTGAATCTCAATCCTTGAAATGGGCATGA AAGATCTTATAAATTTAATAAGATAAACATTATATTTCTGTCTTAATAAATGTAGTTGTTTTTGTGGATGAAGGTATTGTCATATAGTCAATATCCTTGG TTGGTTTGAGCCATCATTGTGGGTGATTTCCTTTGTATAAGTATCTATAATTGATGCAAACAAATAAACTTCAATCTTATATATGATAATTCATTCTAAA GTATAGATCAGGCTACAATGCAGTAACATACTCATGTTTTTGTTCTCTTAGTTTTATCAGGATGTTCATTAAGCTTGATGCTGCAATTGTTAACATTTTT GTAATGCAACTTTGCATTTGCTTCCTGAAGCCTTTGTGACTGGCTTTCTCTCTAATTTGTGCTAGAGAAGTTATATGGCCAAATACTCAATGGTTTGGCC AGCAAACCAGCTTGATAATATTGTAACTTCTTTAAAATCAGAATCAATCAATTGAGATGTTGTTAATATATAGAAACCTTCTACTTTCATTAAACCTCCT CGTGTTTCCATCTGTCAAATCGTGCCATAGTAATATCAAAACATTAATAAGCTTGTTCTTCGCATTAATTGGTTACAATCAGTGAGATGTAGTCTTTATT TTAATCATACACCAATGTTAAGACAATGCACTACCTTGAAATTAAAATCTTCTTTGCAATTAAAATCCATGCACTAGATAAAGTAGTAATTATGAAAAGT TAATATAGACGAGTGTGCCTAAAAAAACATTCAAAATGTAAGAATTGTTTGCTATGCATCTGATGCTTTGTAATCTGGCTGCTTTGAAGTTCGATTGATA TGTTATCCTAATATGTACCCACTTGTATCCAATGGTTAGCTAATTTGTTCAATTAAATTCAATTTCATTAAACAATTATTTGTACCCACTTTTATATTTT GGTTACTCTTTCATTTTTTCTTATTAATTGATCATTGTTCAAGTAGTCTTGTTTCATTATTGTGTTGTTAATCTCATACTTTCCACTGTACCACAAATCT CAAAACTTTCAAGGTGGTGATGAAGTGATGAAATGGCCAAGACTAGATATTCCATGTGATTATGCGTGAAATTTTTACTATAGAAATATTAATATTTGTG TATTTGTCTTTCCCCGTAGTTGTTAACCGAATTTGGAATGCTTCAACAATTGGTTTGGATGATACATATTATATTAACTTATTAATGCTCGTGTATTTGT GAATTATTTTAAGAAGGTGGTGATAATTTGAGATTTTGGGTCCAATTTCTT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_184681;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_382066

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.3
• PS1: 0.3
• PS2: 0.3
• PS3: 0.5
• PW1: 0
• PW2: 0.3
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_382066

• Blastp: -
• Blastx: Protein EMSY-LIKE 3 from Arabidopsis with 57.58% of identity
• Eggnog: Chromosome 11 open reading frame 30(ENOG410YF3T)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G13020)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019451064.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;