Ll_transcript_381270

• Id Trinity: TRINITY_DN51403_c0_g2_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_381270
• Sequence: CTCAAAGTATGTATTGATTCAAATCTCGATTCGTATGGTTTTATATTGCGGTTGCTGTTATGTTGTGTTTATAGACGCGATTGCAAAGTATGGTTTTAAA TTGCAGTTTTGGTTATGTTGTGTTTATTACAATTGTGGGAAAGTGCATCATATAGGACATTTCCAAGTTTTATAGGAACTTTTGTATCAGAAACAATGCT ATCTCCTATGATAGTTCCTCCAGTTGTAAAATATATATTTTCTCACCATCCTCGTAGTATACGAGACAAATATGGATTTCGATCCGGGTCTGTGGAAAAA TGCAGCATTTGTGGGAAAATGCAGCATATATGATCGCAATGTCCTTCTAAAAGTTACAAAATTACAATATTGTGGTCGCAATCCTCAGTATCACCGAATT TAAAGATAGTAAATTCTTCCGAAGTTCAGTTTTCGATATTTAACACATGAACTTAAATGTGTTTTTTTGCAGTGAGATTAGCAAAGTTAAAAGCAAACAA TGTCTACAAAGCACCATGTGATACTTCAGTGCTGTATCCAAAAACAGGAGGTAACATGCATGAATTCAGAGCCATAACTCCATGTGCTGTTCTTGATGTT ATTGGTCCTCCTTATTCCAAAGAAGATGATAGAGATTGTTCCTACTACAAAGATCACCCTTATACTGATTTTCCAAGTAAGTAACAATTTGAATGCATAG AACTACTATTTTTACAAGAAATTATCACCAAGATAGATACAAATATTTATGTAGTTTATAGGTTTGCAAAGTTTTAAGTCTTTTGATTATAGTATTTTCC TTGTTTTTCCTAAGTAGGAAAGTTATGTTTTTAAATGATAAATAGGGCTGAATGTTTCTATTGCTTAGAATTCTTCTTTTGTAATGTTTGGCTCAATGAG GCAATTTGGAAATGGTTACCTCAAGTGGCTCAATATTGAATTTGAAAAACAAATGAAGGCTAGTTATGTTCACAAAGGGACAATATTTCGTGAATGTAAC TCTCAAAGGAATCGAACATTTGAGCTTATGATCTACAGGATCTAGTGAGGCTTTACATCACTAGACCAACGCGTTGTTGGTCAATTCAATCAAGCTTAAT TAATATTATGATTTCATAAAAATAGTGTGTATCGATAGGTAAAAGTTGTTTACGCTTTCAATGCATGAATGTACATGACTCTTATACTAAGGTGATATAC ATGAATTAGTGCATAGATTATAAACTTTTATTTTATTATATTTTTTCAATAATTTAAATATGTCCCACTTGAGGTAGGACCTATTGATTTATTCCAATGG GTTTAAGTTATTAATTAAATAAGAAATTATGTATAACATCATATTTTGTTGATAGAACTTTATTCATTATTGCTGTGTCTCTAACCATAAGTGATTCTTA ATGGTGCAGATAGAGAGATTGGTGAAGTGAAAGATGAAAATGATTGTTATGGATGGTTGGAAGAAATTGAAATGCCACAGAATTCTCAAATGGATAGGAT TGAGTACATGGGTCCTCCAATTATAGATCACAACATCTATTCTATTCCATAGATAACACTTTCTTAGCTACTCTTTATGTGCATACACTATACCATAGGA ATATATATATATATTCCTACCCTTATCTCTGAAATTACGTTCCCACTCATGAGTTTTTGCGAAATTACACCAACCCTTTTTATACCGACCCAAATTACTA TTAGTTGTTATGTATTTATTACACTTAAAGTTTGTTTGCAAGTTAATTTTTGGAAGGATAACGGAGGGAAGAAAGATGAGAAAATGAAATATAATTGTGA GATGATTATGAATTCTTCCATTTTTTCCTATTTCTCTCAAAATTCAGCTCGCAAACATAGCCTTAATATAATCTTGTAAAAGAACGGTGATGAATGTAAT GAGGTTAAATTTGATGTACCAATATAATTTACCTAGTTGTATTGGTTTGTTGTTGAGTTGGTTTATGGTCTTTACTTTTTTAGCACTTAAAATTTTACTA CTTTGTAAGTAAAGCTTTAATACAATCTGCAAGCTGATTTTGAGGAAATTCAAAACCATGGGCTTGAATATTGTTGACCAGTCAATTACTATTATTAATT TATTATTCACTTGGGCTTGGTTCATGGTTTTGTTTTTCTTAAGTTAAAATTTGACCAAGACTTTGGAAACTACTTGTGGATAAGATTGATGTAATTAAGG AAGACATATTTATGGGAAATTAAAATGACTCACGAGTGAAGTGTTTTACTTAATTTTTTAACCAATAGATTTGACTTAATTTAGTTTTATGTATAATTTA TTCTATATTAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_184690;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_381270

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.1
• PS1: 0.2
• PS2: 0
• PS3: 0.7
• PW1: 0.1
• PW2: 0.2
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_381270

• Blastp: -
• Blastx: Plant cysteine oxidase 2 from Arabidopsis with 62.12% of identity
• Eggnog: 2-aminoethanethiol(ENOG4111Y3H)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G39890)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019451395.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;