Ll_transcript_408538

Id TrinityTRINITY_DN51645_c0_g1_i6
Name TranscriptLl_transcript_408538
SequenceGCTGGTACAAGCAACTATCACAACTCCGCTCTCGTTTTCCTTCTCTCTTTCTCGTGTGTATATAAAGAGCCACCCACACCTCACCACCAAAACACAAGCA ACATCATCTCTTTTCCCCCCTCTCTCTCTCACTGTTTACATGCAAAACCGTTTCTAGGGTTTTCACCTTTTCTCCCTTCTCTCTTTCAATTTCAGTAACC GCTTCTCCGATACCGCATTTCAATGGCATTTCCGGCGAAGAAGCTCATCGGCGATCCCATTAATGTTGTGACTGAATTCATTGATGGTCTTGTGGAGACA TATCCTGGCTTACAGTATTTAGATGGCTTTCCTCAGGTGAAGGTTGTTTTACGCGCTGATGTTCCATATGCAACATACGATAAGGTTGCAGTAATATCAG GGGGAGGAAGTGGCCACGAGCCTACTCATGCTGGATTTGTCGGAGAAGGAATGCTGACTGCAGCCATCTGTGGAGATGTCTTTTCTTCTCCACCAGTTGA TTCCATTCTAGCTGGGATACGAGCTGTAACTGGTCCAATGGGGTGTCTTCTGATTGTAAAGGTATTATTTGTTTTTTCCTTGTGTGGTACTATAGCACTT TGCCTTGTTAAGTACTGGTTTTCACGTTGGTTTTCTGGATCAGTATGTGTGTGAGATGACTTTGCATAGAAATTGACAATAAATGGCGAAAAAAATTGAA AGTAAGTTTCTTCATTACAAAAATACTAGACACCATGTAACCCCCTTCCCCAAGAAAAAAAACTAGAAACCATGTGAAATCAGCTGAATCTAGAATAACA TATACGACAGTGTGGTTTTTGCACAAGTCTGGTAAGTTCATGTGGTGTCATTAGGATTTACTTTTGTTTATGGATTCATAGTATTCAAATTTGAATGTTG ATAGAACTATACTGGTGATCGCTTGAACTTTGGTTTGGCCGCTGAGCAAGCAAAATCTGAAGGTTATAAAGTGGAGACTGTCATTGTTGGGGATGATTGT GCACTACCTCCACCTCGAGGGATTGCTGGAAGAAGAGGTTTAGCAGGGACTATTCTGGTTCATAAGGTTGCAGGAGCTGCTGCAGCTGCTGGCCTTTCTC TTGCTGATGTTGCTGCTGAAGCTAAAAGTGCATCTGAAAAGGTGGGGACGATGGGTGTTGCTTTAACAGTGTGCACACTTCCTGGTCAGGTTACATCAGA TCGTTTGGGCCCAGGAAAGATGGAGTTGGGTCTTGGAATTCATGGAGAGCCTGGTGCAGCTGTGGCTGATCTCCAGCCTGTAGATGTGGTGATTTCTCAT GTTCTGAAGGAAATATTGTCCACGGTATGCCACAATATGTCTGGAGGTCTCTTGGCCGAATTATACGGATTAACTGTGAACAAAATGCTCTCATAACATT TACTGTGCCATCACATCAAAAAAATAAAAGAAATACTGGTTTGTGATGAACATACTTTTTTCTCTATATATTTTTCTGACATGACTTCTATGTGCCATGT CTTGAACTCTCAATTTTTATTTATGTATTTATTTTTTTCTATTTCATATATGTATACTACTCAATATCATTTTTTGCATTGAGTATGCTAACCTTGCAAA TTGGTCAGTTTGTTTTTATTTAGTGGGTAAAAAGAATAAATGGTTTTTTAATTGCAATTAACTTTAAGCACCTACTGACACTAGCGCCTAATTATTAGGA TAAGGTCTTTACATATATTGGATTATATCAGGATAGATTAATATAAATAAGAGAGGCAGCAGGAAAGTACATAGATGATGAGTTTTCCTCTGAATTAAAT CAACAATAAATAACGACACATGAAAATTGGGGAGGATATTCAAATGTGGCCTCTGATCAAGATGTTAAGTCCAGGGGGGATGGCTTTATTTACTTATCGT AAATTTTTACTCTTGCTTCAGTGGGAGATGCTTAAGTGTATTCACTAAAATGGCAGTGCTTCAGTGGGAGTGCAAATAATGTTGGTTTAATGGAAGTAAG GATGTTGGGGTTTTCTGATGAAAATCTTCTCTCAAGGATAGTCAAATATAAGCAGCACCAAGCAGAAAACAATTTGATGAAAGCAGCAGATAAATTAGAT AAGGAATTGTTGGAAATCCTATAATCTGTAGCCAGGAAATGTTGTGAACATAGTAAATGAGTTCACTGTACTGTTTATATTTTATAAATAAATGGCAACA AAACTATTCTTTTCTCCCCCTAATTTATCTGTAAATCAAAATTTGAGAAATTAATCCGTAGTAGTTTTTTCAACAAAAAAGTTTATAACTGTTTGTATGT CCTTGTATGCAGTGCGATTATTTTTCTTTGTAATGAGTTACACTACTTTTTTGTTGGTGATGTCTCCAGGAAACAAACTATGTTCCAATCACACGAGGCG GCAGGGTGGTGCTCATGGTCAACGGGTTAGGTAGCACTCCTTTAATGGAACTAATGATCGTGGCAGGAAAGGCAGTTCCAAAATTGCAGCTGGAGCATGG ACTGGCTGTTGATAGAGTTTATACAGGGTCGTTTATGACTTCTATTGATATGGCAGGTTTCTCAATTTCTATCATGAGAGCTGATCCACCTATTCTTCAG CGATTAGACGCAGCAACCAAAGCACCATACTGGCCTGTTGCAGTTGATGGTAATCGCCCGCCTGCTAAGATTCCTGTTCCGGTCCCCCCATCCCCATCAG CAAAGAGTGACGAGGTATATACATGAAAATCTGTCATTTCCCTCACATGACATGTAACAATTGTGGTATCATGCGAATTCTTAGTCAAAAGTAAATAAGC ATGGATATAATTGTGGATTTGTGGTTTTTGTCTTGATAATTTATTTTTTAAATTTCCAGACCTTATAATATTTCTAACTGCTTTCTGAATAAGACATTTT TAGCACATAAACATTGGAAGAACTAAAAGGTAAGCATATTTCACGTGCATGTTGTATCTCAATTAATTATATCTACCAAGTATTGTTCTAGTTTCCTTGA GGCTTCATTTGGTTCACAAATTTTTTCTCAATTTGTTCCATATTTTTCTTGATATTGATGCAATAGTCCAACTTCAACCATTTAAAACCCTTCCCTTCTG ACCATCTATTGTTGTACTTCTTGCTAGAAGCATCCATCATCTGGCCATCTGTAGCTATCATTTGTACTTCCTCAAGATTATGTTATCTTCCTCTTCCATG TTCATACATATGTAAAAGTGTGGAGTGAATTTTGCATTTGAGAAGAAACTCGTGTTACATATATCAATTTTTTTTATTAGGATTATATTTAATTTAATGC AATAATAATTAAAAAAGAAAGATTAAAATTGTCAAGGGTCAAGATGACATACATCCAACCAAATTATTAGTTTAACAACCTTACCCTTGCATGTGAATAG GTTATTTTCAGGATTAGAACCCATGACCTCCAGGTCACAAGGCAGATAACCTTTCCGTTGCATTGATGCTTCCACCCTCTTAGGGTGCAAGTCAATCAGT TGGTGAAAAATCATATAACTTAGCATTGTTTGTATATGAAAAGAATTCTTCAATTTTCACTGTGAATAATGTTCTTTTATGCAGCTCTTCTTTTATTTGT GCCAATTTACGGAAGATTTTGTGTTCCTTTTGTCAACTGAGGAAAATAGACACTTTATCTCAGTTTTTTAAAAATATGTTTTCTTACTTTTTTTAATATA AGTTGTGATATCTGACTTCCATATGTTTTTTTATACAAGCCACGGAGTCGTCCACTGCAACTAAATGAACAAGGCCAAATTCTTGAGGCAGCCATTGAAG CTGCTGCTAATGCAATTCTAAATCTTAAGGACAGTCTAAATGAATGGGACAGTAAAGTTGGTGATGGTGACTGCGGGTCTACTATGTATAGAGGTGCAAA AGCAATTCTTGAGGACATCAAAACCTACCCTCTGAATGATGCTGCAGAAACTGTCAGTGAAATTGGATCGACAATTGGAAGAGCTATGGGGGGAACAAGT GGGATCATATATACAATATTTTTTAAGGCGGCATATACACAACTGAAAGCAAGCCCACATTCTGATGTCACTTCAAAGCAATGGGCTGAAGCACTGACAG CTTCTATTGCCGCTGTAAGTAAATATGGGGGCGCTAGTGCTGGTTACAGAACATTGCTAGATGCCCTCAGTCCAGCATCGTTAGTTCTTCAAGAGAAACT TGATATTGGTAATGATCCTTCCACTGCCTTTGTCCTTTCTTCTGAAGCTGCATTAGCTGGAGCTGAGTCAACCAAGCACATGCAGGCACAGGCTGGGCGT TCTACTTATGTGTCTGCAGAGATTCTGTCATCAGTTCCTGATCCTGGTGCAATGGCTGCTGCTTCATGGTACAGAGCTGCAGCTTTAGCTGTGAAGGAAA AAAAATACAAGAGTTAGGAGACATACAATTCTTGTTTACGCGGATTTAGGCAAGTTTTGGTCGTGAGTTTGAATTCCTGTCACCATTAGGTTCTCCGCTT ATGTCTTTATGCGTAATGCTGAGAGGGCGATTGAGAGACAGTTTTATCAATGCCAATGCCAAAATTCAAAGTGGATGTAAATTTGAGCACTTGATGACTA GTTGACTACAATCGACAATAATACCAATTTTCTCTGTTGGTCTATTGATTATCAGATCAATTTTATGTGCATCAAAATTTATGTGTATCTTGATTGCTGC TGTTAAGAATGCTCGACTGGCTTGATTCTTGCATACCCGAGTGTGTGGGGTTTGTTGAAATTACGCCTTTATGAAAATTGTTTGATTAATATGCAAACCC ATAAGGTGGAATTTCGTGGAAAGCTCATTTGAGAATATGAAATGCGAT BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_186581; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_408538

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_408538

BlastpPutative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase from Lycopersicon with 73.56% of identity
BlastxPutative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase from Lycopersicon with 72.65% of identity
EggnogDihydroxyacetone kinase(COG2376)
KeggLink to kegg annotations (544126)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019433182.1)
PfamDAK2 domain (PF02734.16)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;