Ll_transcript_408111

Id TrinityTRINITY_DN51670_c0_g1_i12
Name TranscriptLl_transcript_408111
SequenceCGATACTCTACGCCTTTGACCAACCAATGAATTCTACTCTAATCGTCACCACGACGGTGCAAATGCCGTTTCTCAAATCGCTCAACCGCCACATCACCGC ACCTCCTCACAACCTCCTCCTCCTCCGCCGCAACAACCTCAAATACGTTGTTGCTTCTTATAACAACAGCTCTCACTGCATTTCCACCTCCTTCGCTTCT GCTCCATCGTCACGCTCGCTCTGTGCTTTCAGTTCACTTCTCCGACGAACGCCGTTCCTTCTGCGGTGTGTTTCAAGCTCCGACGCTTCCTTTGCTTCTT CAGCCGGCGGAGGAAATTCTGGCGGTGGAGTTTCCGGCGGAAGTGGTGGAGGTGGTGGTGGTTCTGGCGGGGATTATGGAGATGGTAGTGGTAAATTGGT TGTAGACGCGGCGGTTCAGGATCTTTCAGAAGTTTCAGCGGACGTTATTATTTTAGATGTTTCGGTGTGTGAAACTCTTCTTTCTCTGCGAAGTTTCATT GTGTTATTCTTTTTCTTCTTCGTTAATACAGTATAGTTTTTTGTTTCTGTGCGTGTGTATGATAGGGAATGGTGTGTGGTGGATGTGCAGCGAATGTGAA AAGGATCCTGGAAAGTCAAGTAAGTTGTTCAAATTTTGTATTTGATTTGATTTGATTTAGATGCTTCAATTACTAAGATGATAGGGGTTCTTATAGGTTC AATTTAATGTTGATGATGTTCTGCTAACTTGCTAAGTTTATATTGTTAGTTATTGAAACTGGATAATTATGAGCTCACCATATTTTTATAATTTCCTTAA GCCTGTGGATGTTCTTGGAGAAAATTAGCAACCGAGGTGAAAAAGTTATGCTGAGAGATTTAAAGGGAATGTGGTAGTTTACTGTCTGGGAAGTGGGAAT TCTTAATTTGAATTTGCTCTTTTATACATATGGATTCCAGAAAATGAAAAACAGTCGAACAAAGAAATTATTTGCGGGGAAGGGTAAAATTGGCATTCTA GTTTGGTTCCATGCCATCTTTTCTGATAAAAATAAGATGTAATAAAGGAAAAAAATCAATGAAAGAAATATGAGGTAAACAAAGTTTATATCTTCTTTAG ATGTGTGAGCATATATAGTTTTATTTTTAACTTTTCAGTAATATAAATCATGGTTCTTTAATTTTATGTCGATGGACAGCCACAAGTATCATCGGCTAGT GTAAATCTAACAACAGAGACAGCAATAGTTTGGCCTGTATCTGAAGCAAAGACTGCACCAAATTGGAAAAAGCAATTAGGAGAGGAACTTGCACAGCATT TAACTGGCTGTGGTTTTAATTCTAGCCTTCGAGGTATATTTTCAAGTTCATCAACAAACCACTTTTTTTGTTAAAAGAAGTTCAGGGGGTGTAAGGTAGG TTAGGTCAAGCATGCAACAGATGAGGACATATCATGACCCTTGCTGGTGACCTTCCAATGAAGGATAGGCATGAGGGCTTAGGAGTTGAACCATATAAAT ACCTTTGATTGAGTCAACACGGTGTACTCATTCCAGTTGAGCCAACCACCATTGGCTCAACACAGTGGCTTTTACCTTTAATATGCTACCTGCATAATTT TTATAACAAATGTCTGTTTTGGTTGATTATTCTTCTTTTCCATCCTTTTTATTATGTTATCTGTTTGCACTAATGCCCATCCGATCTTAGCAATTGCACT TCTTTTACTGTTTGAGTTGTTAAAGTAAATTGGTTGTTTAATGGTTATAGTGCAAGCGTATTATGTAGAAAACTTCAATTGGGAACAACAAAAACAACTC CCTTTCTGAAGTAGGATTCTTAAGCATGGAGATACCTTTGAATTGTCAGATGGATGTAACTTATGAGCTTAGATGTTATCTATGTTTTGGAGTTCATTGA TTTACATGAAGCTGGGTGGGTTAAGTGGCAGGTGATGAAGATAGCAACTGAAGCAGTTATTTCATTCACCATATAAATGCACTAGAGTGGTTGTTTGGAG TTGATGGAGGTGAGTATCTGTGATCTGTGGCTTCTTGTGGTGGGTAGGAGAGACATCTGTGTTCAGGCGACCTTGCATGTTGAAGAGTTTGCTGATGTTG AATCTGAAAGTAGCAATCCTTTAGTTTTGAAGATTTTTGAGGACTCTTATGAATTGAAATTCAGTAAGAGACAATTTCTTCCAAATTTTTCAAAGGAAGA TGGAGGAAAAGCGTAAACAATTAAGAGAAAGTGGTCGCGAGCTAGCTGTTTCTTGGGCCCTATGCACTGTCTGTCTTGTTGGCCATCTCTCTCATTTCTT TGCAGCAAAGGCACCATGGATCCATGCATTTCATTCCACTGGATTTCATATGTCATTGTCATTGTTTACATTGCTTGGTCCTGGCCGTCAACTTATCCTT GATGGTTTGAAAAGTCTTCTTAAAAGGGCTCCAAACATGAACACCTTAGTTGCTCTTGGGGCTTTATCATCATTTACAGTCAGTTCATTTGCTGCATTTC TGCCAAAATTGGGTTGGAAGGCTTTCTTCGAGGAACCAATTATGTTAATTGCATTTGTCTTGTTAGGAAGGAATCTTGAACAGAGAGCTAAAATTAAAGC AACCAGTGATATGACAGGACTTCTTAGTATGCTTCCATCAAAAGCTCGCCTTCTAGTTAACAATGGGGAATCAGAAGTTGGCACAATTGTTGAAGTTCCA TCGGACAGTCTTTCTGTTGGAGATCAGATTATTGTGTTACCTGGAGACCGTATTCCAGCAGATGGAGTTGTCCGAGCTGGTAGAAGCACTGTAGATGAAT CAAGTTTCACTGGGGAGCCACTTCCTGTAACAAAACTACCCGGGAGTGAGGTTGCAGCTGGAAGTATAAATCTGAATGGAACTCTTACAATGGAAGTGCG GAGACCAGGTGGTGAAACTGCCATGGGGGACATTGTCCGTCTAGTTGAGGAAGCACAGAGTAGGGAAACTCCAGTACAACGGTTGGCTGACAAGGTAGCT GGACACTTCACTTATGGAGTGATGGCAGTCTCTTTTACCACATTTACATTCTGGAGTCTGTTTGGCACACACATTTTACCCGCTTCTCTGTACCAAGGAA GTGCTGTTTCACTGGCTTTGCAGCTTGCTTGCAGTGTTCTGGTTATTGCTTGTCCATGTGCACTTGGGTTAGCCACACCTACTGCCGTGCTGGTTGGAAC TTCTTTGGGAGCTACAAAAGGATTACTTTTGCGTGGTGGAAACATTTTAGAGAAGTTTGCCATGGTAAAAACTGTTGTGTTTGATAAAACAGGGACCCTG ACGGTTGGTAGACCTGTTGTAACAAAGATTCTCTCTCCTACATGCAGACAAAATGCAAATTCAAGTCAAACTGAAGAAACTACTTGGTCTGATGTTGAAA TCCTGAGGTTAGCAGCTGCAGTAGAATCAAGTTCAGTACATCCAGTTGGAAAAGCGATTGTTGATGCTGCTCAGGAACTTAATTGTCATAATGCCAAGGT AGCAGATGGTTCATTCCTGGAAGAACCTGGATCTGGTGCAGTTGCAACCATTGATAACAAAAAGGTTTCTGTTGGGACATGGGAATGGATCACCAGGCAT GGAATTAAAGGCAGTATCCAGCAAGAAGTGGAGGAGTGTAAAAACCAATCTGTTGTCTATGTTGGAGTTAATGATACTCTAGCTGGCCTAATTTATACTG AAGATGAGATAAGGGAAGATGCAAGACATGTTGTTGACACATTGTCTAAGCAAAATATTGATGTATACATGCTGTCTGGAGACAAAAGGAATGCAGCTGA ATATGTTGCATCTCGTGTTGGAATTCCAAAAGAGAAGGTGCTATCTGGAGTGAAACCAGATGAGAAAAAGAAGTTCATAAATGAGCTACAGAAGGATCAG AACATTGTAGCCATGGTTGGTGATGGAATTAATGATGCAGCTGCTCTGGCTTCTTCACATATTGGCATTGCATTAGGTGGAGGTGTTGGGGCTGCTAGTG AGGTGTCTTCAATTGTATTGATGCGCAACCAGCTCTCACAGCTACTTGATGCTTTGGAGCTTAGCAGGCTAACCATGAATACTGTAAAACAAAATCTTTG GTGGGCTTTCATTTACAACATCGTAGGGATTCCAATTGCAGCTGGAGTTTTATTTCCTGTAAATGGGACCATGCTGACTCCATCAATTGCAGGTGCTCTA ATGGGGTTGAGTTCCATTGGTGTAATGTCTAACTCATTGCTTTTAAGATTCAAATTTTCCTCAAAGCAGAAACAAATGCATGCCACATTCCCAAATATCA AAATCAAGGTGGATTCTGATTTGCCACGCCGAAACCAGAAAATAAAATATTCAAGTTAGATGTTAGATGGAGGCACATAATAACACAACATAAGTCAAGT ACACCTTGGCAGGAGTATGAACTTCAAAGAGAAATTTAATGTATAGAAATCAAAGAATCACACTATATGTGATGGGGAACTTCAAAGAGGAATTGTATGA ACTTTATTTTTTCCGAGAACTCCATATTTCCACTATTAATTTGTGTCTAGTTCTTTCAACTTCACTGCATTGTGTATTGAAAATTTTATGTGGGTTTTAC TCGCTTGAAAAATATGTATCCAGACTGTAGCTTTTTATATTTACAAACAAGGTTATTTATAAATCATTTGTCAGCAAATTCTGGTTTAATCAATCCTCAT AAGTAAACATGAAC BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_186739; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_408111

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_408111

BlastpCopper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic from Arabidopsis with 70.54% of identity
BlastxCopper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic from Arabidopsis with 70.11% of identity
Eggnogp-type ATPase(COG2217)
KeggLink to kegg annotations (AT4G33520)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019461308.1)
PfamE1-E2 ATPase (PF00122.19)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;