Ll_transcript_446291

Id TrinityTRINITY_DN51824_c0_g1_i12
Name TranscriptLl_transcript_446291
SequenceAGAAAAAATGCATGACCATAACTCATAGATCTCAAATTTGATTTAAGAAATAATTTCTAATATCAAACAATGTTTAAGCACGAGTTACCAACAAAAAATT ATTAAAAATGTATAAGACTTGAACCTTGAAATCACTACTTTGCTTAACAAAAACTAAAAGAAGAAAAGATAAAGTGAAGTTGTTCATGGGAGGCACAACT TCATGCAATTTGCACGATTTGGTAATATTTATAAAGTTGCACCATATGGGTAATTTTTTTTAGTCAATGTACATACACAAGTCGTGTAAATTTGTTTATA CTTATTTAATGGCGGCTAAAGAGTCTAGGACGCAAGTTCCATTTTAATAACACAGAAAAGTAGGAAGATCTGTTGATTATACTGTATAACAACACCATAT TGAGTTTCTGTCTTCAACTTTTGTAGATCTGCTTAGCTTTTCTGGGTTGTAAGAACATGTTTTTGCGTTGTAAAAGTGGTTGTAAAAGCACTTAAAAAGG TAAACGTGTTTTTATTATTTAAGAGTGAACGTGTTTTAAGCAGCACCAGTTGTTTCCTACCTTCACACCCTTTTATTTCATCCACTTGACCCTTCTCTAT TCTTCAACCAAGTTCTCTTTTTTCTCTTGTCTTCAAAATACAACTTGGCTTGTTAACAATAAAGTTGTTCACTTTTAGTTTCTTGTGATAGTTATTGCTC AATAAATGGCACTTCTTCATTCTGCTTAATAAACAACCATGTTTCATTGCTTTCTTTCAGGTGGCAGAGAATAAACAATAGTGGTTCCTTGGTTGTAACA TAGCTGAAGAAGTTTTCTGTTGTGTGCATAAACATGCGATCTGAAACTTCAACTTGGGTCACTTCCCTTTCATGTTCAATCTCAGGAGATGTTTCATTTG TTTCAAATCTACCTCATTGGCTTAGATTCATTTTCCTCTCTCCATGCCCTCAGAGAGCACTTTTCTCTGCTGTGGATGTCTTACTCTTGTTAACTTTCTT AGTGTTTGCACTCACAAAGCTATATTCTAGGTTCACTTCTAATGAGAACAACCACGCAGAACTCAACAAGCCCCTTATAAGAAATAGAGAAGCTTCTGTC ACAACAACAATATGGTTTAAGCTAACAATAACTGCAACATCTGTTTTGGCCATATTGTACACTGTTGCTGGTATTTTGGTTTTTACCAGTTCAACACAGG TGACATGGAAGGTGATTGATGGAGTGTTTTGGTTAGTTCAGGCCATAACACAAGTTATACTTGTAATCTTGATTATTCATGAGAAAAGATTTGAAGCTGT TGCACATCCTTTATCCCTTAGGATTTATTGGATTGCAAATTTTATCATTGTTGCTTTGTTCACAGCTTCTGGTGTTATTCGTTTTGTCTCTGTGGACGTG GAGGAAACCAAACACTTCAGCTTCTTGGTGGATGACATAGCTTCTTTCATTTCTCTCCCTTTGTCACTTTTTCTGCTATTTGTTGCAGTTAAAGGGTCCA CTGGGATTAAGTCCAGCAACGACGATTCGCGACCGCTTAATGGTGATAATACCAAGCTATATGATGATGTTACTGGGAGAAAATCCAGTGTTACTGGCTT TGCCTCAGCTTCTTTAATATCCAAGGCCTTTTGGATTTGGATAAACCCCTTATTGAGCAAAGGGTACAAGGCACCACTGAAGATTGATGATGTTCCATAC CTTTCTCCACTGCATAGAGCTGAGAGGATGTCAGTGATCTTTGAATCAAAATGGCCTAAACCAGATGAGAGATCAAAGCATCCGGTTCGAACCACATTGC TTCGGGTGTTCTGGAGGGAAATAGCCTTCACTGCCTTCCTTGCTGTTATTAGGCTAAGTGTCGTGTTTGTAGGGCCTATTCTCTTACAGAGTTTTGTTGA TTTCACAGCCGGGAAGGGAAGCTCTCCATATGAAGGATACTACCTAGTGTTGATTCTCCTATGTGCCAAATTTGTAGAAGTTTTGGCAACTCACCATTTC AACTTCAACTCTCAGAAGCTTGGAATGCTTATCAGATGCACTCTCATCACTTCCTTGTACAAGAAGGGGCTGAGGCTAACATGTTCAGCTCGGCAGGACC ATGGTGTTGGGCCTATTGTGAATTACATGGCTGTTGATGCTCAACAACTCTCTGATATGATGCTGCAGCTACATGCTGTGTGGATGATGCCATTTCAACT TGGTATTGGCTTAATATTGCTGTACAATTGTTTAGGTGCAGCAACAGTTACAGCTTTGATTGGTCTTCTTGGTATTATTGGGTTCATTTTGTTAAGTACT GGACAAAACAAAAGGTACCAATTTAATGCAATGATAAAGCGTGACTCGAGAATGAAAGCTGTGAATGAGATGCTCAATTACATGCGTGTGATCAAGTTCC AGGCATGGGAAGAGCATTTCAACCGCAGAATTCAGGGTTTCCGTGAGTCAGAGTTCGGATGGTTTTCCAAGTTTATGTACTCAGTTTCTGGCAATATTGT TGTATTGTGGAGTGCACCGTTACTGATATCAACTCTCACATTTGGCACCGCCATTTTGCTTGGAGTTTCACTTGATGCTGGGACAGTTTTCACCACCACA ACCGTGTTTAAGATCCTGCAGGAGCCTATTAGGACCTTCCCACAGTCTATGATATCTCTTGCACAAGCAATGGTGTCACTGGGAAGGTTAGATAAGTACA TGTCTAGCAGGGAATTATCAGAAGATTCAGTTGAGAGAGTGAGGGATTGTGACGGCCAAACTGCTGTGGAGGTCAAAGATGGTACCTTTAGTTGGGATGA TGATTCTCAACAGCAGGACTTGAAACATATTAATTTGGATATCAATAAGGGTGAGCTTACTGCTATAGTTGGAACTGTAGGGTCAGGAAAGTCTTCCCTC CTTGCATCAATACTTGGTGAGATGCACAAAATTTATGGAAAGGTTCGTGTTTGTGGGAGTACATCTTATGTTGCACAAACATCATGGATTCAAAATGGGA CCATTGAAGAAAACATTCTCTTTGGATTGCCCATGAACAGACAGAAGTACAATGAAGTTGTCAGGGTTTGTTGCTTAGAGAAAGACCTGGAAATGATGGA GTATGGAGATCAGACAGAGATCGGAGAGCGTGGCATCAATCTAAGTGGGGGCCAGAAGCAGCGTATACAACTTGCCAGGGCTGTATATCAAGACTGTGAT ATATATCTTCTCGACGATGTTTTCAGTGCTGTTGATGCACATACCGGCTCTGAAATATTTAAGGAATGTGTGAGAGGAGCTCTAAAAGGCAAGACCATTA TTCTTGTCACACACCAAGTAGACTTCCTACATAATGTGGATCGTATTGTGGTGATGAAGGATGGAATGATTGCCCAATCAGGGAAGTACGATGATCTACT CCATTCCGGATTGGATTTTTCTGCTCTTGTAGCTGCGCATGAGACCTCTATGGAACTAGTAGAACAAGGTGCTGCAGGTGAAAATTTTGACAAACCAATT AAATCTCCAAAGGCAGCCCCTAATCATAGAGAAACCAACGGCGAAAGCAATTCTGTTGACCAGCCCAAGTCTAACAAAGAAAATTCTAAACTCATCAAAG AAGAGGAGAGAGAAACTGGGCAAGTAAGCTTACATATCTATAAACTATACTGCACTGAGGCTTTTGGATGGTGGGGTGTTACAGCAGTGGTCCTTTTTTC TGTGTTGTGGCAAGCATCTATGATGGCAAGTGATTATTGGCTGGCATATGAAACCTCAGCAACGCGTGCTGAACTGTTTGATCCTTCTGTGTTTATTTCC ATCTACGCGATTATTGCTGTAGTTTCACTTATTTTGATCGTTCTAAGAACCTACTCTGTCACTATCGTGGGGCTAAAGACAGCACAGCTTTTCTTCTCAC AAATTCTTAATAGCATCTTACATGCACCCATGTCTTTCTTCGACACAACTCCATCAGGGAGAATTCTAAGCAGGGCATCTACTGATCAGACCAATGTTGA TATCTTCATCCCCCTGTTCATGAACTTTGCTTTGGCCATGTACATCACAGTAGTCAGCATCATCATAATCACATGTCAAAATTCTTGGCCAACAACTTTC TTGCTAATTCCTCTTATTTGGTTGAACGTTTGGTACCGGCGCTACTATCTTGCTTCATCTCGTGAATTGACTCGTCTCGATTCAATCACAAAAGCACCTG TCATTCATCATTTCTCTGAAAGCATTTCTGGGGTCATGACAATCCGTGCATTCAAAAAGCAGAAAGAATTTAGTGATGAAAATGTTAAACGGGTTAATGA TAATTTGCGAATGGATTTCCACAACTTCAGTTCGAATGAGTGGTTGGGTTTTCGCTTAGAATTGCTTGGAAGCTTAATGTTTTGCTTTTCTACTTTATTC ATGATCATGTTACCCAGCAGCATCATAAAACCAGAAAATGTTGGTTTAGCACTCTCTTACGGAATATCCTTAAATTCGGTGCTGTTCTTTGCTGTATACA TGAGCTGTTTCATTGAAAACAAAATGGTATCTGTTGAGAGGATAAAGCAGTTCACAAATATTCCATCAGAATCAGCATGGAAAATTGAAGATCGTTCTCC TCCTGCAAATTGGCCCGGTCATGGCAATGTTGATATCAAGGACTTGCAGGTCAGATATCGTCCAAACACTCCTCTTGTTCTTAAAGGCATTACTTTAAGC ATTAGTGGAGGAGAGAAGATTGGTGTTGTTGGTCGAACAGGAAGTGGAAAATCAACTTTGATTCAAGTTTTCTTCAGGCTGGTGGAACCTACAGGAGGGA AAATAATCATTGACGGCATTGACATATCCGTCTTAGGACTTCATGATCTTCGATCTCGGTTTGGTATCATCCCTCAGGAGCCTGTCCTTTTTGAAGGAAC TGTCAGAAGTAACATTGATCCAACTGGACAGTATACAGAAGAAGAGATATGGAGGAGTCTCGAACGTTGTCAACTAAAAGATGTAGTGGCTGCTAAGGCT GAGAAACTCGATGCTTTAGTGGTTGATAATGGAGATAACTGGAGTGTGGGGCAGAGGCAGCTACTTTGTTTAGGGCGGGTTATGCTTAAGCAAAGTGGGC TATTGTTCATGGATGAGGCAACAGCTTCTGTTGATTCTCAAACTGATGCTGTAATTCAGAGGATCATCCGAGAGGACTTCGCGTCGCGCACCATCATCAG CATTGCTCACAGAATACCAACAGTCATGGACTGCAATAGAGTACTAGTTGTTGATGCAGGGCGAGCTAAAGAATTCGACAAGCCCTCTAACTTGCTTCAA AGGCCATCGCTCTTCGGTGCTCTAGTTCAAGAGTATGCCAACCGATCAAATGAACTATAAGAAACTCTTCTGTTTCTCTTGACACACAAGACTAGTGCAG AGATGAGATGTTTTTATCACTGGTGTCTTATTTGACAAGTGAAGCCTGGGCAACTCTTGTAATTGGAATCCTACTAGTTATACTTCACATTTTGGCCATA TCTGAGTTTGTATTGAAGAATGTAGGATAGTAGATCCTAATTTTTATTTTGTACTACTTACCAAGGGTAATAAGTTGCGGAGGAAATGCACTGCTTTTTA CACTGTCAGCATCATCATTCGCGTGTTAATTATTATTATTTCTTGAGTAAAATAAGAAATGAAAGTGATACACATAAATGATGATTGACCATGCACCAAA CTTCACTAGCAGTGCATATATATTATTGCAGCAATCCCATTTCACTGTACTGAACAAGTATTTTTGCACCATTAATATAGCTACTCTAGACCTCCAATTG AGCTTTTGTTTGGTTATATCAAAATGGTTGTAATATTTATTATTTTACTATTATTTATAATTATTATTCTTAATAGGCAAAATCACACATTGATCTCAGG TTAAAAAAATAACCAGTTTTTTCATGTGAAAAGCTATTGACACAATGAAAGAGGATATAAACTCATGCTAACACTTTATG BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_187878; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_446291

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_446291

BlastpABC transporter C family member 4 from Arabidopsis with 69.19% of identity
BlastxABC transporter C family member 4 from Arabidopsis with 69.08% of identity
Eggnog(ABC) transporter(COG1132)
KeggLink to kegg annotations (AT2G47800)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019441762.1)
PfamABC transporter transmembrane region (PF00664.22)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;