Id Trinity | TRINITY_DN51925_c0_g1_i13 |
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Name Transcript | Ll_transcript_399574 |
Sequence | CCCCAACCCGCCTACTCATCAGGGGTAGGCATTCATTCCCATTTCATTTCCTCCTCTCCCCGAATTTCAAAACCCTAGCACACTCTTTCTACGATTCTCA CCCCCTCTTTCACCTTCGCCGACCCCATTTCATCTTCGATTCTCTCCTTTTCTCACTTGGTGCATATCATCCTTCATCCTCGCTTTCGACCTCAGTTTCA CCATCATCTTCTGTTTCAATCTCGCCTTTCATCATCTCCCCGCCTTTTTTTTTCTCCTTCGCCTTCGCATCGAAGGATCTCTCTTTACACCGAGGAAATC TCCCTCGTCTTCTCACCAAGGGATTCGCCTTTGTCTTCTCACCGATAGATTCACCTTCGTCTTCTCACCGATAGATTCACCTTCGTCTTCTCACCGATGG ATTCACTTTTGTCTTCTCACCGAGAGACTTACATTCGTCTTCTCCCCGAGGGATTAGCTTTCGTCTTCTCACCGAGGGACTTACTTCTATGTTCTCACCG AGGGACTCACCTCTGTCTTCTCACCGTGGTAATTCCTTCTTCACCTTACTTTTCTTTTGCATACTATATACTTCAGGGCTTGTGATTTGTTCTTTCTTGT GCATGTGGTTGGACGAGGCTTAAGGGATGATCACTCCGAACTCTCAAGGCATTCTTCGTCCATTAGGGCTCGATTAATTCGATAAGTATCCCAACCCTCT CCTATTTTCGATTAATTGACCATGTTTATCGAATTTGTTTATGTGTATTGAATCTGAGCATAGGTTTATGTCACTAAAAAAATAGATACGTACTTTCGAT ATTTTGGATTTACCTATATTTACAGTACCTTTCGAAATCGCCTTTTCGTATTTGTGTTTCTGTGAATCTTAAGTGTTTCTCGAAGCAATTGGAAAACAAA ATTTATACGCTTGGTTCGATCTGCAGTTGATACCTGGGTATATATATGTGTTGTTCTCTGTTTATACAGCCATTACTTTGATTAATTGAAACACAAATTT CTTTTGTATGATTAACTTATTCATAATGTCATGATATTCTGTTATAGCAAGGCAATCCGAAAACATAAAATGCATATAAAACAACATGTGTGATATGTTA AAACTGTAAGTCGCTTGATTAAGACTAAGGATGTTTCATAGTAGTGTGTTATTTATGTCCTTAATTCGGGGGGTTTCACATTTGCATACATGATTCATGG AATTGATATGGCATCTTAAGTCGTGGTTTCTATGTACATGATATTATCTTTCGGAGGTTGCATAAATGAATGGATTAGACATTTTTACCTGAGCGTATGA CCTCTATATCTGGTGTTGATGATACTCCGGTAGTGTGTTGTGCAAGCCGCTTTTTGCTTTGTGTTCAATTGCCTCTGCTATCTGTCTTTGTACTCTCTTT TTTCTCTAAAATTTACGTGTGCTGCCTGTTTCAATGCTATATGATCTTTTTTCTCAAAAAATATCCTCTCCTCCCTTCCAATCCATTTTGCCTTTTATAT AGGTTTTATCAGCACTTCTGGCAGGCTCCTGAGTTGCCAGAATTGTATAACTTACACCCCCTGCCCCTTCCTATTTGAAACTGCCTTATTTGTATTTAAT AGTAATCTTCTTCCAACCTATCTGAAATCATTTCTTGCCCCGCCCCATAATGGCCTAATGATGTAGCTGGATGAAACTGAAATTCTTTCCAAATGCCATG ATATGCTTTTAAGATTCTTTTCAAAACTGTTCTTTTGATTGGTAATGATTTTATGAATCCTGAAACTGCTTACTGATCTATGACCTCTCAGCTATTCTGC TCTTAATGCCATTTTTAACTTTCTGAAACTGTTGAAACTGGCCATCTTCGATTGGCTTTCTTTTTGTCTTTGTCTGTTGGAATGCTATGGCTGATTGGTT TCTTTTTTTTTTTACAAACATTTTTAGAAACAGTTATAAGGAAAAGGTATTCCCCTTTTACTTACACTATTCAGCTTGCTATATTTCATACTTTTATTAG ACATTACGAACGACCAAGTCTCTAAGGATTGATCAGCCCCTCCTGGTCCCCCATTGCTTGTCCTTTTTTAACCAAACTGCCATGATGCATACTTGCATCA CCCACTGATGCTCATACATCACTACCTGAAGGCCATCCATCTCCTGTTTCTAGATTAGGGGCCCTAACCTTTTCCAATAATCGCAAGAGGGGTATCTAAT GACGCGTGCTCATCCTGCTCCTCTTTCATTTATGCCTTTATATGCCTAACCAGGATAATCATGGGACTCGGTTTACTGCTTTGAATGCACATGGTTATCC AGTCATCATTCAGGATGGTATATTATGAATCTCTTACTTCTGTTTTGTTCTTGGATTTATTTGTGATTGCTTGACAAATTGCTTTGGTACTGCGAATGTT TTCCATATGGGTGAGATTGGTTTTTATCCATATTTATTGTTGCATTGGTATGCTTGGTGGCATTCATAAAAAAAATGACTTTTTATTCATCCTATGATAT ACTTTGAACAGACTGATTTATGCATCCCTTGATGTGCTTTGCGACTGGAACTGTTTTATGCATCCCTTAATATGTTTCGAAACTGTCCTTGCGTGTAGGC TCCTTTGCATTGAAAACTCCCTTCATTTTTACTACTTCCCCAGTGATAGTACCTGCTTAGTATTTCTTGTTTCTCCCGAATTCATTTCTTACCATATAAG CAGTCACCGCTTGATCTTGAGTTCCCTGGTATGATGTTTCGGGTACTTGAATTGTTTTGTCCTTAAGAAGGGTCGTGTTAACTTGTATGTGCATTCAAAA ACACATTTAAGTTTTGTCTTTTAAATAAACTTGGTTTGAATCTAATCTCACATTCTCATTATGTGTCACATTCGATGTTTTCTTGTAATCAGCATGCCCT GGAATCGCTTATGTCTGGAAACCAGTTGTTCCCTTGTTCATGAGCAGATGATCGCAACAATGGCATAAATCTTCTTGAAACATATCATGTAATATATGGG GGATGAACCCATATTGGAGAGGGCCATTGGATAAGTCACTTTTCTTCATTTGCTTCATCACATTGCTTGCATACATAGTTTCCAACCATCTGAATGTGGT ATTTTACTTGCTTTCGGCTGGTTCTTCTTTTGTTACTATTTGATCTGCATCGTTATGTTGATTATCGGTTGGTTCTCGCTGATCGTTTATTGCAGTTTTC ATCAATGGAGGAGGATATCATTTTATATGCTGAATTTACAAGGCAAGTCGAAGGGTCAAGAAAGAGTGTTGCAATCAGTGATTGATTGAGTTCATGGTGG TTGCTGAAAAATACTGCACCCTTACTTAGTAACTTGTGATTTTTATGATGTTCTCTTAATTGGTTGTTAGTTTTTTTTCGGACACATTGGATGACTGTAT CCTACTATAAGATTACCGTTCATTGTTAATAGATATTTTATGAATGTTTGAAAAGAAATTTCAGTGGTGCACCCAGATTGAGACAGTTGGTGCTATCAAA ACAACAACTTTATAATAGGCACTATGAAAAAATTAGCATTCAAGTTAACTATTTTTTGCATCAATGAACCCAGATTGAGACAGTTGGTGC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_188634; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_399574
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019413264.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |