Ll_transcript_473621

Id TrinityTRINITY_DN52072_c5_g2_i5
Name TranscriptLl_transcript_473621
SequenceCTTCAAAGCCTCAAACTCAGAAATCAGAATCATCCACTTTCCCTCACACAATAAGACCATAGAAGGAGAGAATGGCTATACTTCTGAACCTTGAAGAATT AAGAAAGACAAGTTTGATTATTAATTTCACTGCAACTGAAGGAGACATCCAAAGGGATCGCATTGATCCAAGATTGTAGTCTTAAATCTCTCTTTGCCTT CACAGAATATTTTGGATCATGCTATCCCTTTGGATTCTTCCTTTGGTGGCTTCTACCACTTTTCACACAGAAACTGCATTCTCTAGCTAAAAAAGATCAC GGCATATATAGTTCCGGTAAGTCCATATAATTGACCTTGTTAACTTATTCTATTCTATCCCCTCATCAACTAATGCTTTTAAATTGTGGTTAATATCAAT ATGTAATTGCTTCTGGTCTTCCACTTTTATTTTTCGTTTTGATTCTTTTGTAACTTATTTATTTTTAGTCATATTTGTTCACAAAAAATGTATCCGACAA GCGTAGGAAATTGCAGCCGATGTAGGTGCAATTATATATTATTGTGATATAGATCCAGTTATGAAGAGTATGAAAATCATAATATTGTAGTCTTGTAACT ATGGCAGCATATCTTAGTTTAAAACTATGGATCTATTGAATAATTTTCAGATACAGTATAATCCAACCAGAAATTAATTTATGATTATATACAGCAAGTT GAACATGGTTGAATTCATATTTCAAATCTGAAGTACTCAAAGATATATCAGTTCTTCAGTCCCAGGTGCTTGGATCCTACCAAGGTAAATTATTCTTGTT GAAAGTTGTATCTCGTTATTCTTTCACAACATTCAAGTTATGTTCCAGCTTCGCAAGGTGAAGTACATAAGGAAACCCTTTCGATGTTTAATTCTATTAT GTAGCCTAGCTTGGAGTTTTTGTTTTGGTAGGATAGATTGTTCTACCATGAGTCCATGAGTTTTTTTTATCTCTTTACTAAAATGTTGTTGAGTATATTA TCCTTGAAGTTTGGGTCGTTGTGTTAAAAAACAAAAAACAGAAAGAAACTAGCAGCCTTTTGGTGAGAAAATAAGCTAGATTATTAAAGCTAAAGTGGTA GGTTGTATTTATGAATATGTGGTTGTTTTTCTCCTATAGCTTCTGCCTTCAACCAAAATTCATTCATATCTTTATTTCCACATTACTTTTTTTATGGATT TTCTTCACTCTGAAATTAATGTATTTATGAATATGTGTTTTTCTTAGCCGATGTCCTTTAGCTTGGGACAAGATCACCTATCCCAAACCATATCTCAATT GGTGTATCAAGTCAATCAAAATATTACATTTTGTTATTTTTTATTTATAATTTTTTTATGTTATGTGGCAAAATCTTATTGGTTTGGGACACACCCATCG AATTCAGTACAAGTAATCCCCATCCCTACGACACACCCATTCCATAGAGATCTATATAAGTAGCAGATTCTACAGCTCCACCATACACCGACTTGAACGG AGCAGAACCGCTCCATCTCCGCCGCACGTGCACGCCGGAAAATTAAATTCCATAACTTCAGATTTTAAATAACTAAAAAATTACGCCGCGATGAGTAATT CTGAGTCGAGAGAAGATGAATCGAAAGAAGAGGATAAGGACAACGAAGCTAACAAACTCCTACAACATCAATCATCATCATCATCGGATAATGAAGAAGA GGTTGCATATGAAAATGGAGATAAAATCACGATCGTAGATTTCGACTATGTAGACGGTGATGAAGATTCAAACGTAACACCTCCTTTCTCATGGAAGAAG CTATGGGTTTTTACGGGACCAGGGTTCTTAATGAGCATAGCGTTTCTGGATCCAGGGAATCTAGAAGGGGATCTCCAAGCTGGAGCGATTGCTGGTTACT CTCTGCTATGGTTGTTGATGTGGGCCACTGTTATGGGGCTTTTGATTCAGCTTCTATCAGCGAGAGTTGGCGTCGCCACTGGTCGCCACCTTGCTGAGTT GTGTAGGGATGAGTACCCTAATTGGGCGAGGTATGTGCTTTGGTTTATGGCTGAGTTGGCCTTAATTGGTGCTGATATTCAAGAGGTGATTGGGAGTGCA ATCGCTATTCAGATTCTTAGCCATGGCGTGTTGCCGCTTTGGGCTGGAGTTTTGATTACTGCTTCTGATTGTTTTTTCTTTCTATTTCTTGAGAACTATG GAGTGAGGAAATTGGAAGCTGCTTTTGCAGTTCTCATTGCGACTATGGGTCTTTCTTTTGCTTGGATGTTTGCTGACACAAAACCTAATGGAAAAGAACT ATTGATGGGTATTTTGCTGCCAAGACTTAGCTCGAAAACAATTCGTCAAGCTGTGGGTGTTGTGGGTTGTGTCATAATGCCTCACAATGTATTCCTGCAT TCTGCTTTAGTCCAGTCGAGAAAGATTGATCCCCACAAGAAAGGCCGTGTGCAGGAGGCTATTAACTATTATTCAATTGAGTCATCGGCTGCACTTTTTG TCTCCTTCATGATTAACCTATTTGTCACAACAGTTTTTGCTAAGGGGTTTTATGGTACAAAGCAGGCAAAAAGCATAGGATTGGTGAATGCTGGGCAATA TCTTGAGGAAAAGTATGGTGGAGGACTTGTGCCCATTCTCTATATATGGGGGATTGGGTTATTAGCTGCGGGACAGAGTAGCACCATCACTGGCACATAT GCTGGGCAATTCATAATGGGGGGTTTTCTCAACCTACGTTTAAAGAAATGGTTGAGAGCATTGATCACTCGAAGTTTTGCAATTGTGCCGACTATAATTG TAGCTATTGTTTTTAATACATCAGAATCCTCATTGGACATTTTAAATGAATGGCTTAATGTGCTTCAGTCCATGCAAATTCCTTTTGCCTTGATTCCCCT CCTCACCATGGTCTCGAATGAGCAGATCATGGGGACCTTTAGGATTGGACCTGTTCTTGAGGTGAGTTAATCATCTCACTGTTCTCTCATTTCATCATTT TTTAATCATAAGATCTCTGAAGTAACTTCCTGCATGGTTTGAATTATGTTTTTCATCATATTATATTATTTGATGACAAAGAAATGGGTGGTTTAGAAAA ATGAGATTGAAGTTTTCTTATGTTTAGCTTGTCTCTGCAGCTATCGAACTTTTTCTATTGTTAATTTACTTGTCCGTCTAAATTGATGTGTGGGTGTAAT CTGTTAAACAAATGTCATGTTTCTTAAGATAATAACTATTGGCTATTCAATCAAGAATCTATGCATGTTTGCTCGGTAAAAGTAGGAATAGAAATGTAGT AATATAGATGCATGCAGATGAAAGTCATTAAAAGTGCTAATTCTCTGGCACAGATTGTTTTTCAGATCATTAATGTTCACTGCAGTAGGTGAAGATGCAT AAATTTCAACTTATACTGTTGCTTGATCGAGTTCATTAAGTCCTAAACTTCAAGGAGTTGTCTCATAACACTTGAGGAAAATGTTTGTTCACTTGTTGCA TGTCAATTTCTGTTTAGATACCAAAATCATGCATAGATTTTTTCCTGCCTTCATTCACTCACTTCTAAATTGTATAAATTACATTGTACTGGATCTAGGG CGACGAAGAAGTTAATTATATAAACATAATGTGGTAATATAAGGTCCACAAAATGATCTCCAGTTATTAAAGTTATCTGTTTTCTTTGTTACTAATTTTT TGTTCTATTTTTGCAGAGGGTAGCATGGACTGTTGCT BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_189835; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_473621

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_473621

BlastpMetal transporter Nramp2 from Arabidopsis with 81.46% of identity
BlastxMetal transporter Nramp2 from Arabidopsis with 84.74% of identity
EggnogH( )-stimulated, divalent metal cation uptake system (By similarity)(COG1914)
KeggLink to kegg annotations (AT1G47240)
CantataDB-
Mirbasetcc-MIR393a (MI0017505)
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019417585.1)
PfamNatural resistance-associated macrophage protein (PF01566.17)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;