Ll_transcript_429872

Id TrinityTRINITY_DN52126_c2_g1_i10
Name TranscriptLl_transcript_429872
SequenceATTTATAAAAAAGCTAAAATAAAAGACACTTGTGTGTTATAACTTATAGTTATTAACTTATTTTCTTTACATGCAGTGAATCCATGGCTACCTCTTCGGT CCTCACCCATTAATGAATATAGACAAAGATCTTGAATTTGCTTTGTTCTGAAAATGGGTTCAAAAATTAAGCTTCTGGGTATGTGCATATGGCTATTTTA CTTGCCAAGTTTCACCTTCATTGTTGTGAATACACAAGATAATGAAAGTGGAAGAAGTGCAACTTTGAAGGGTAGTGTTGTCATTAATGGAAGATCTGTG ATTGGAAATATTGATGATGATTTTGTTTGTGCAACCCTTGATTGGTGGCCACCTCAGAAATGTGACTATGGGAGATGCAGTTGGGGTCTTGCTTCTCTTC TCAATTTGGTATTGTTGTTATTTTTCTTTTTATCCAAATTGTTTTTGATTCTTTTAAGGTTTTTTTTAAGAATGTTTAACTGCTGCAAATTTTTCTATGA CAACGTAAGTATAAGTAGTTTTTATTGTTTGTTAACTAGAAGTGATGTTTTTTCTATTTTCCTAATGCTTGCTTTGGATCTATTGGTACAGCTGCAAAAT AATTACTGTATAAAATTTAATCTTTTAATTTTATTGTTTTCTTAAAAATATATGTCATTATCTACTCATTGGTGAGGATCTGAGGCCAAGTTGATAATTT TATCACCACATAATGGTGAGATAATTGCATACTTTTTTTTTGCCTTTGGTAGATTATGTTTAACAAAAGGATAATTGAAATTAACTTTTGCTGAAATTTC AGGTTTCAATCTTTCATTTTCCTGTGTTCTTTAATGAATTAGGTTGAGTATATAAGTGAGAAGTCACATATTTGATATAAAGGAAAGAATGAAAGAGTTT ATAATTGACAAAGTCTATGAGACCATTACCTTAAGGTTTTTGTTTCAAGATATGGTGTCTCATTATAACTCTTTACTCTTTCCAATGCCCCGATGGGACT CTCGGTCGTTGGAGGTTCCCCAGTTGTGAATGGGCCGAACAAGTGGTATTAGAGCCGAGATGGCTCGACTGGGACATGGTGAACTCAAGGTGAAGTAAGT GTGTTGTGTGTGGTACCCACACTTGAGGTGGGAGATTGTTAGTTATATTCAAGTGTGAAGTCTCACATTGGATATGAGAAATAATTGGAAGAGTTTATAA GTCAAAAAGACACATGAAACTATTGTCTTAAGGTTTTTGGTTCAAGATGTGGTGTCCCACCTCTGGCTGACTCTTCACTCTTCTCATGCTCGATAACAAT GGAACCAACTGGTAGTTGGAGGCTCTTTTGTCGCAGTCGGGTCCAACAGATTAATTAATTGTTTTAATAATATATTGTACAGTTTGTAAAGGGAAGAGAG AACTCAAATCTTATAAATATTATCTCATGCAGGACCTCAACAACAAGATTTTGTTGAATGCAGTGAAAGGTAAGAGACAATGTTGCACCTCTACAATTGT CATTAGCAAGGTATGACTAATTGTCTTTGAATGTTTTGCAGCCTTTTCACCTTTGAAACTTAGATTAGGTGGAAGTTTGCAAGACAAGGTCATATATGAG ACAGAAAATGATCAACAACCATGTACTCCTTTTCATGCTGACACTTCTCAAATGTTTGGTTTCTCACAAGGGTGCCTCCCAATGAAAAGATGGGATGAGC TAAACAACTTTTTTGAAAAAGCAGGAGTTAAGATTGTCTTTGGATTAAATGCTCTTGTTGGAAGAACTGTATCTGGCTCTGCAGTTGGACCTTGGAACTA CACGAATGCAGAATCTTTTATTCGTTACACTGTCTCAAAGAACTATGCCATCGATGGATGGGAACTTGGCAATGAATTGAGCGGGAGTGGAGTTGGAACT AGTATTTCAGCAGACCAATATGCTTCTGATCTAACCGCTTTACGAAACATAGTTTACAATGCATATGAAGAGATTGATCTTAAGCCACTAATCATTGCAC CTGGAGGTTTCTTCTCTGCGGATTGGTTCAAGGAGTTTATAAGCAAATCCGGCACATCTTTGGATGTGGCCTCCCACCACATTTATAACCTTGGACCAGG AGTTGATGAGCACCTTGTGGAAAAAATTCTTAATCCTTCCTATCTTGATGGAGTGGCAAGCACATTTAGAGACCTAAAAAATGTACTTGAAAGTTCAGGA ACCGCAGCAACCGCATGGGTTGGTGAGTCAGGAGGGGCTTACAATAGTGGCCATCATCTTGTATCAGATGCATTTGTGTACAGTTTCTGGTATTTGGATC AGCTTGGTATGTCAGCTGCATATGATACTAAAACTTATTGCAGACAGAGCTTGATAGGAGGAAACTATTGTTTACTTAATACCACTAATTTCATGCCAAA TCCGGATTATTATAGTGCTCTTCTTTGGCATAGACTCATGGGAAGACATGTACTATCAACTACCTTCTCTGGGACAAAGAAGATAAGAGCTTATGCACAC TGTTCAAAGCAATCTGTGAGTAAAACTTGTGTCACTATGATTATGAAATGCATATTTATGTTGGAGATTAATTTAAATGTAGTTTTAGGTTAATGTTTTT TATGCTATAACCAATCATACATCATACTTTCGAAGTAGTCATCGTGTAAGCCAAATATCGTTTTTTTCCGTTATTGAATGATAGTGTAAAAATCTTTTAC ATTACCGAATGCATGCAGAAAGGAATCACAATACTATTGATCAACCTGGACAGCAGCACGACCGTTGAAGCCGATGTGACCTTGAGCAGCACCAAGAATT TCTTGCATAGAAAAATGTCTGATGATTCAAAGCTAGTGAAGCTACCTCTCCATTATGCAACAGAAACAGCAAGAGAAGAGTACCATCTAACTCCACATGA TGGGAATATACATAGCCAAATCATGTTATTAAATGGAAACATTCTAACAGTAAACTCAGATGGGGACATTCCTTCTTTGGAGCCTACATATGTAAACTCA TCAAACCCAATAATTGTTGCACCTTACTCTATTGTATTTGCTCATATACCAGATGCTGTAGTTAAAGCTTGTATATAGGTAAGTGGCACTAGAAGAAACC AAGAATTGGTTTCACTTGGTGATTGATAAAACTACATGGGAAATTATCTTTGTTTTAAATTTATTGTTGAAGAACATGGTGCTGAAATTTTGTGTTTGGC ACTAAGACTTAGATTTTTTGTTTGGTTCTTAGGGATAAGATTGAGTTCATTATGATTACAATTTGCAAATTGAAAGTGTTGGTACAGTGAAAATGACCTT TGCACAACTCG BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_190272; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_429872

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_429872
BlastpHeparanase-like protein 3 from Arabidopsis with 67.45% of identity
BlastxHeparanase-like protein 3 from Arabidopsis with 62.3% of identity
EggnogHeparanase(ENOG410YDJW)
KeggLink to kegg annotations (AT5G34940)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019417502.1)
PfamGlycosyl hydrolase family 79, N-terminal domain (PF03662.13)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;