| Id Trinity | TRINITY_DN52446_c1_g1_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_350586 |
| Sequence | TTCAAAATGTACATGGATTTGTTTTGGAGGATAGACCTTTAAGGGCTTGTTTTGGAACAACAAAATATTGTCATGCATGGCTCCGAAATATGGTTTGAAA ATTACTAATTTGTAGATATATCTTTAACTTGTGCCTTAATAATGCTTTTAATTTCGGATTGATCTTGATGACCAGCCTTGCAGCAATCCAGATTGTCTAT ATCTGCATGAGATTGGCTCTCAAGAAGATAGTTTCTCTAAAGATGAAATTAGGTACTTTCATTATGTTGAAGTTTTAATATGAGGCTAATTGTGAAAGAG GGTATATCCCTTAGATTGGTTTTTAATAACAGAAGATGAAAAAAGTTTACTATCCTCTGGGTACTTTTCTTAGCTCAATTTTTATACGAGGCTTACTATT ATTCAGTTGAAAGATAAAATCTGTGGTTGAAATTGGGTGATTTTGATCTTGCTGTTCAAGCCTCTTTAATTGGATAAAGCAGAGAATACTTTACTATTAT TTTCTTGAGAAGATTGTTTCTTTTCATTGGCCATGTAAGCATTGCAGATTAATGAATAATCTTTCACTGTTAGAGGATGTAGCATTACATCAACATGTGA GCTTGCTGATGTGTATACAGGGTATTCAGATTCTACTACCTTTCTGACTCTGGCCAGTTTTTCCCACCGGTCTCAGCGTGTTTCTCTGTCTGTTCTTTCT ATGCAGACTCAATCCAAGTCTTGTATCCACAAGCCTAGGCTGTTCGTTATGTTACTGCTACCTCACCTTGAGTGTGCAACTGTGACTCAGGTCTTATAAC ATTGCCATTGGAAGACAATCATGAGTGCTGAGTATGTTGGTCTTCTTGCCAATAGCACATGACTTGGTTCCTCTCCAAGCTATCAAATTGGGTATCGGTT GTCAATTGGTGTTCTGGGTCAAAGAGTACCCTGATGGGTGCATTAATATGTATGGGGCTTGGTTCGCAATCAAAGGTTTCCATCAACAGTCTGGTTTTAC TACATTGAAACCTTCTCACTACTGTTCAAACCTGTGATTGTTGAGCTATCCTAACCTTAGTCCTCAGTAATCACTGGCCTGTCTAACAACTTGATTATAA TAATGCTCTCCTCAGTGGATTCTTAGAGGAAGAAGTTTACACGCAGCAACTTAATGGGTTTGAAAATAAAGAATAATTGCCTTGGACACTAAACAAGGCT AGATTGAAACATGCACTCATGGCCTTCACTTTTTATTAACGCGGGAGCATAGTCATGCGTCCTTGTCTATATACATGACGTCGTTATTATTGGCAGTTCT TGATCTTTAATTAAAAGACTATAATCCAAAACGAATTCAATATTTTCCCTCCAACATTTGGGTAATTTGGACTACTTCCTAGTGATTCTTTGCTTCTCCG GCAACAAAGAGCAGATCAAAGAACTTTTCGAAAGGATAAAGTGGGTGAAGCTTAGGGCAAATCTACTCATTTGCTTGTTGGCGGGAAATTGACCTAGTTT GAGGATATTCACTCCAGACCTCTATAGGTCAGTTGGTGCATTCCAAGCCCACAATCGTTAGATCTGAAATCTGTTATAGTGTGAACAAAATGCATCACTT TCTGCCATAACCTCGGAAAGATTTTTCTAAGTGGTTAAGTGCCTAACAGGGTCCTTAACTTATTGTTTACTGCTGCAGCCATCTCTGCTTCATCCTCCAC ATCCTCTGCTGATTTGGGCACCATATCCAGATAATCATAGATTAACATCTTGAGTTTGTTTGGGGCCTAATCTCACTTCTTGCTAATCAACATGAACATA TCAGTGGTTCCAAGTTCTTGCACTGAATCTTAGTAAAGAAGCCTAGTTAACACTTCAGTAGAGTTACTTTATATTCAGAAACTGCCCAAAGAACACAGTC CCAGTTTTGATGATTGCTATTATCTATGGCTGTGACAACCTAAGCATTGTTTCGCCGATAAATAATCCAATTTCTCTCTCAAAGAGTACAATATGTAGCA TTACATCTGCTTATAATCTTGCTGCCTTTCCAACATAGCTGTGACCAACTTATAGTTAATTATTGTTTTGCCGTGATCTAGGTGGTCTGGACACACTATA TATACCTGGAAAAAATCGATTTCTTTTATGTTATTTTTAGTTAGATTTTGTCTTTTTTAAATAGATTTAGATGGGATTCACATTACGTTAAAACTATTTC CATTATGAACATCTTAATATCGTATTTTCAAGAACCATGCTGTTTTTGAACTGCGTGTAGTGCTTTTCATATAATAGTCTAGTCACTTGCTTTATTGTTT TGAAGAGGTCGTGTTCAACAAATTACTGGTGCTGCCAACAATATGCAACAACGGTCAGGGACTGTATTGCCGCCTCCCTTGGATGATTGCATGAATAATT CGCCAGGAAAACCCATTATGAAAAATGTTTCAAGTCAATGCTCTGCTAGCCTTGTAAGAGGTTCACCTCCTAATGGAAGTTCTGGCAGGCCTATGGCTCT TCCTGCTGCTGCCTGGGGTTCACGGGCTACAAATTCTCAGCCTGCTGCTGAAGGTACATTATGCCCAAATGGCCCTTCCATGCCCAGATCCGATACAATC AGCAATGCACTGTCGTCCTCCTTAGCTGTTGCAGACACAAATCAGGCTTCACTGCATATTGATGTGACAACGAGGCCACTGTCCAGTGATGAGAGTCATA GTATGACATCTAGGGTAAAAAACGAATCGTTGAAACCTCTTAAACAGTACAACAACGTGGATAGCAGTGTTGGCGAAAAAACCTTACCCACTGATGTTTC TCTTGCATCTTTAAATTTGAACAATCAGTTGTCTTCTCTATCATTAGCCAGAGATAGTGATAAAGGCAGTTGTACTACAACAGACACGACAAATTCTATT GACATTACTGGGCAACCAGGTAGCTTTGGTCCTGAAGAAGCAATTATTGCTACAAATGAATATTTTCATAATTTATCTTCTGAGTTATCCTCAATTAACA ATGATAGAAGTGTCCGTAATGAACACTACAGCCTAACTGAACCTAGTAGACCACCTTCTGATTCCATCTTAGTCAAATATTCCCAGTCTGAAGGATCACA GGTCAATTCTGACAAATTTAGAGATTCAATGATTACAAATGCAGCTGTATCAGCTTCCACATCAGATAATGGGGTTTGTAATCCAAAGGAATGGTGTGAT TTGAGATTTGATTCTCAAACCCTCGTATTATCAGGTAATGCTGAAGTCGAAGACGATGTAGCATCTTTTGATAATCAACGGCTCAAGGATCCAGAAGTTG TTTCTCGTTCTTATTTGCCAAAGTCATCTAGCTTCCTCAATGCGTCAAACTGTTGCAGTCCTCATCTTCTGCAACATGGTGAACATGTTGTTGCAAATGC TGGTTCCATTTCTATGCCTGATAAAGTTGGGAATGATTCTGTATTGCATGCACCTGACATATTATACAATGGATACCCTAAAAAATTGGAAAGTATCAGC TCTTACAGTTTGCCTCATGATGAAACAAACAAACAATGTAACGGAAGATTGGTTACTGAAGCCGTTAATACAGGAAGTGGTGCTGCTGTGGATAAGGGTG AGAGTACTATAATTTCAAATATATTGTCCATGGAATTCGATGGCTGGGGTGACTCACTAACATCACCTAAGAATTTGGCCAAACTGTTGGGTGACAACAC TGATAACCAGAATGGTCCATTGAAGAATTCTAGTACCCGAAAAGTCCAAAGTAACAATCAATCAAGATTTTCTTTTGCAAGGCAAGAGGAATCCAACATT CATGCCTTTAATGTACATCCATCATACAATACCAGCCATCAATTTCCAAATAGCAGGTCACCCATGCTGGAATTTTCAGAAAGAGATGTGTCTCTGGGTA AGTTCGGTATTGCTAATGGCTTCCATGCCAGTAGCCTTGAGGAATCTGAAATTCTACGCAATGGTCATTTGCTTGCGTTTTCTAATAAGCCCTCTGTTGT TTCAAGATCTCAAATTTCAGCGCCGCCAGGATTTTCAGTTCCAAGCAGGCTGCCTCCTCCTGGTTTTTCGTTTAATGAGAGAATGGGTCAGGCTGTTGAC TCCTTGTCTGGGAATCGGTTGCTTAACCCTTCTTCCTTACGTAGTAATTCATATCAGACTTCATCAACTGTAAATAATGGTGGTGCTGGAGACATTGAAT TTATGGACCCTGCTATTTTAGCTGTTGGTAAGGGGAGACTGCACGGTGCATTAATCAGCCCACTGTCGGACATGCGATCCAATTATCCACCACAATTAAA TTACTTTGAAAATGAGGCCAGACATCAAATACCTATGCAAAGATCTTTCTCACCACAGCAAAATCTTCGGTTTTCTGAATTTGAGAATAATTTTTCTATG CTTGGTGATTCTTATGGCATTTCTTCAAGGTTAGATCAATCACAAATCGGTAATATGGCCTCATATCCTCAGTTATCTATGCAGCAGTCTAGAAATGCAG CTTTGTCAAATGGGCAGTGGGATGCCTGGAATGAGGTGGAGAGTGGAAATACTATGGATATGGCTGAGCTTTTGAGAAATGAAAGACTTGGACTTAACAA GTCCTATAAAGGATATGATGATTCGAAATATAGGATGCCAAATTCTGCGGATCTTTACAAAAGGACATTTGGGATTTGAATTAGCCAGCTATATTATGTT TGATATTGTTGTCCAAGGTAAGGCCAAGTCAGAAATGGTCAAACCCAATTCTTCTGCATTGCCAAAGATGATGGGAATGATTCATGATATGACTGGTTTG TTGTTTGGGATACCTAATGATGAAATTCTCGACGCATAGTTATAGCTGCAGCTGATTTGGATTTGCGGATGTGAGCAGTGTTGAGATTCAAGATTTTGAT CGCCAATCCTTGCAAGATCTAATTGGCAAGTAGATAGTTGTCGAGTGTTATCTTTTAAATACTGTGGAGAATGGGAGCTAGATGGGCATTCAAATTGATT GATTTATCCCATATTTATTGGAATTGTATCTTTTTCAGTCTAGTTTAAACTAGATTTTTGGATATAAATAGAGGTTTCATATCATAGCTCTGATTCAATG GATTTGATTTTTGCTGCAGCCTTCCATAGTTTGTGTGATATTCATAGTTGATATGCTTTTTCTATTTGGACTGATCTTGTGGCCTTTTCTCCGGAAGATC TTTTACTAGGTATTTTTTTCTGTGCGTAATTAGTGGTCCTTTTTTTGTTTGTCCAATTTCCATTTTGCAATTGTTTATCAGGCTAATAAAGCATCATGGA CAGTGTAGCTTGTGCAACTTTAATGAATACTTTCTACATGTTATAAAGTTA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_192780; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_350586
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000387) |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019457807.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |