| Id Trinity | TRINITY_DN52463_c2_g4_i4 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_349322 |
| Sequence | AATAAAGTAGTTTTGCGAATTAGTCCCTAACAGAACGACTTGCCGTTTAAACGGGTCAAGATTTGATGAACCCTTTCGATCTCAACCAATCAATAATCGA ATTATATTTTATATAATAATAATAATAATAATATATATATTCTTCAATGTTCATATTCTTGAATCTCCAATCTTGATAATATTCTGTGTGATTAGATCGA AAGAACAATGTCTGGTTACGCGATGATGGGAGAATCAAGTTCATGGGGAAGTGCACTTGTTAGGATCTCTCCTTATACATTCTCCGCTCTCGGAATCGCT ATTTCTATCGGCGTTTCTGTTCTCGGTGCTGCTTGGGGGATTTATATAACTGGTAGTAGTTTGATCGGTGCTGCAATCAAGGCTCCACGAATCACTTCCA AGAATTTAATTAGGTATTCTATCATCATTGCTTTTTTACCGATTTGCCCCTATTCAATTTTCAATTGTTGTTTGTGCTTGTGTTTATATCGTTGATAACT GTTTTTGTAATGGATACATTTGTATTGATTTTGTTTTATGTTGATTTTGAATGATGTGATTGGTTTTAGATGATAGCGAAACGTAATTGCGTATCGTCGC GATTTTAGATTCTGTTGTGGATTAGATGCATTGTAGGAGACAAAGAGGAGAATGGTGTTAGTGTTGAGAATTTCAATCTAAACAAAATCTTACTTTCAAA TGTTGTTTTTTTTCTTTCCGGAAACAAGACTTTTTGAGCCGAGAATTTTAACGAAGATTTGTATGTGAATATTCAATTACGGATCATGGACCCAAGTTAA TTGTGGCAGGAACAAAAGGGGTGAATGGATTCAACTAAGGCTGTAGATGGCAAAACGGGCAAATCCCGTGGGCTCGCCTGTAGAAGCCTACAAAATTTTG CGTAATTAACCTCTCTGTCGTGCAAACTTCTTAAAGAGTGGAGATTCCAATGCGTAATTAACAAAGATTTGTATGTGAATATTCAATTAGGGATCATGGA CCCAAGTTATTAAACTTCTTAGTGTGAAATGAGTCTGATTTCCCAACTTTAAAAGAGGCTTCAGTAATTGGCGTTGTTGATTGAGCATATTTTTTTTACC AGTGAATGGGAATTGATGGTTGGAATTGTATTACAGTTACCTTCCATGTCATGTACCATTCACACGTAACAATATCTCACTGACTCTAGGGTTTAATATC CACCTTCATTTGGGAGCACCAGTCATACTGATAAACTTCTTTCTAAAGAAAGGCCATTTACTTATTTGGTCTCTATCTACGATGCTGCATGGCTGGTGAA ATTCCATATGTTGACTTGGTTTTCCCTCTAATATTTGCCTTGGCTCATTTTCTTTGAAAAAACCATTATATCGAAAATGTTTTTGATTGAAGATGGCTTC CTGAAAAACATTTTCTGTAAGAGATTTTTCTAAACAACATTCAGTTGAATTAGTTTTTCGTACACGATGCTTTTGCTCAAGATTTTCTTTTATTTGCCTC ATTAAAAGCTCTTTGATATAGCCCAGTGAAGTACATTGATCCTTGAAGCTGACTCTGCCCACTTTTATAACTGTACAAGGCATGGTTTTTATTGTTGCTT TTTTTTTCCCAAAGTGGTTTGTCTTGTGTGTAGTGATTAACTAGAAGAGTGTTTTTATTTGATTGTTACCGAAACTTCTGAAAACATTTTCTGGAAAAAC AATTTTCCACCAAAAGGAGGACATTTTCAGGAAAATTTTCCCACACCACCAACATCAATTACAAAGTGTGTTTCTGTTAAACAAGCATACAAACTACATA ATATAGTTTTTGGTGAGGAAATACCTTTGATGTTAGGTCGAAAAAGAAGCTGATTGATATTTATGACATGTAATAATTAAAGTTCATTTTAGTTTACTCC TCTGTATGTGAGGGGGAAGATGGTGATTGTGTGGTTGGGTGTTATTTGACCTTTTTTGGCTTTTAATGTCAGTTGATAATATAAGGTTTCGTTTGCTCAA ATCAAGTAGCCAATAACAGCCAAAGCCTCTTTCTACTAGGCTTTGTTGATTGATCATATAATAAAGGTTTTTTTACTTCCATGGAAATTAAATTCAGAAA TGTCGTTCTGAATGTCTGAACTTGATATTGTTCAATTGGATGCTGTGAACGTTGATGTTCCTTTTTATAGGTATCTGCATCAAGTATCTTGATGCAGCTG ATATAGTTCCAAATATGTCTCATGTGTGCCACTTGACGTATGGTTCTTGATGTTTATGGTATTTCAGTGTAATCTTCTGTGAAGCTGTTGCTATCTATGG CGTTATCGTGGCTATTATTCTGCAAACAAAATTAGAAAGCGTACCATCAGCAAATCTCTATGCTGCTGAATCTCTTAGAGCTGGATATGCAATCTTTGCA TCTGGAATTATTGTTGGCTTTGCAAACCTTGTTTGTGGGTTATGTGTAGGAATAATCGGAAGCAGTTGTGCATTGTCGGATGCTCAAAACTCCTCTCTCT TTGTGAAGATTCTTGTGATAGAGATCTTTGGTAGTGCACTTGGACTATTTGGAGTTATTGTTGGAATTATTATGTCAGCTCAAGCAACATGGCCAACAAA AGCTTAGTTTTTGTTACATCAGAAGCTTGGGAATGAAGAAACTATGATTGAGCACAATATGTTTTCTGTTATCTACTACCATGTTTACCTAAAATACCTT GCCTCCATTGCAACTTTAGGCTGTATTATTTACCATTGACTTTATAAAATGTGTTGTGTATCATCAGATATTTCAACTTGTTGGTTCAGTTTAAATATTT TTGGAGGACCTAATCTTCTGTTTGTTTATTATGAATAAAAATTGTGAAATTATTTGAGCAATTGGATAAACTCAACAAACAACTTTATTGAAATCCCGGG TTCAAGATCTCATTCAAGTATTTTGAGCCTTGGCTTTTCTCA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_192928; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_349322
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | V-type proton ATPase subunit c''2 from Arabidopsis with 95.54% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019457890.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |