Ll_transcript_464002

• Id Trinity: TRINITY_DN52646_c5_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_464002
• Sequence: CTCTGCTTCTGTGAGTATCCTGCGCTCATTTTTGCTAAATTGATGTCTTTTGTTTGCTTAACTTCTTTTATGATATGTTGTCTCTTGCATGATATACCGT GAAACTCGGAAATTTACTTTAGTTCAGTTAAATTATATTTTGTGAATTAGTTATGTATATATTTTTATCATGTGAAATTGAAACAACATGAATATATCAA TATTGAAGGACATCTTTTGATGATTTTGGCCTTCGGGACCCGTTTTGAGAGTTCATTTACTTGGAATGGCCATGTCATCTGATAAAATCTATATTTTTTT AGTGAATTTAAATTTAAATTTTTAACCATAGACCCTTTAATTGAAAATGTTAATATAGCTACTTATACAAGAGAAATTTCTGTAGTCAGAATTTTTAGCA GGAGTTGTGATTACTACAATGGTTTTATGAAACTTCGTTAGATTGACAAAACTCAAAAAAGATATGGTAACTCAATCCTAAAAGATTGGAAAGTAAGGAT GAGTGATAGGAAAATTGATATTTTTTCTGAGCAATGAGAATGACCAGGATCTGCTTATCAGAGAAGGGTAACTCCATATCTGTGGTTAAGTATTTTGTGG GTATTCTCTGTGAACTGTCCTAACACTATAGTCTTCAATCTATAAGTAGGGGAATTGCAAACATAACGCCTACTCCCCGTTCTCTCATTGGAATTACTAC CTTTATCTATAAATAGGGGAATGGCAACATAAACTGCTAGTAACATTAGTAAAAAGAAGTAAGCAATGTTGTCTTTTCTTTAGCCGGTTCTCACTTAATG CAATCTTCGGCTTTGGGTCTTCTTAGACTTTAAGTATTCTTGGCTTTGGGCCCTTTTCAGTCCAGGGAGTAAGAATCTTAATGTTTTAGCATCCTTTGAC TCATCTCTTTGCTGTAGTGTCTCTTTTAGATCAGATCATTAGATGCGTTATTGAACATCTATGTAGCCTCGTGGCTAAGAGAAAAGATTGTTGAACGATG TTGGTCTAGTTTAGGAGGAAAACTCGATGGAGATTCGAATGCTAGAGTTTAGTTTTTATGCATTTGCTTGGTAAGCAGGATTATTGGGAAACTGTAATTG CATTACATGCTTAAATGCCTTGAGTATAGAGTACAAGTCGAGAACCAGTGATTTAACATTGCATTGGTACTCCGTGAGTTGTCATGCTTATCTTCTTCCT TTTTTTCTTCTTTTGGTGCATTTGGGATTCAACTGGAATTAGGGCGGGCAGAAGTGCAGAACACCCATGTGTTATCAAGTTTGTCAGCATCGCGGCAAGG GTCTTATGATGGCCCTGCCAATGTTTTTTGCCCATTCTTGCAATAACAAGAAATCATAATAAAATATAATACCGTAACAATTTAGTGTTGTTGCCATGTG AGAATGAGGTCACAGAATCAAGCAGTGGAATAAGCCTCTTGCAAATGCAAGGCTCCCTACTATTGATTCTATAGATCCTCGTACTGGGTCTGTCCCTTCC CTGGGTTATAGTAGTGATTAACCAGGTTAATGTTATTTACCTGATAATAAGTTTTATCAACCATAATAGCTGTGCTCCATATTTTATTCGTTCACTATTA CTATTATTATTATTATTATTTCTTTTATATATTTTACTTGTCTTGATTTGATTGAGATAATTGTATGCTTGAAACTTCTAGTAACTATTATTGGTTTGTT TATTGGATCCTTATGAAAGTAGATGGAAAGATGAGTGTTTGTGTGCTTGAACTTGGTATATGGTTGGGTACCACAGTAATGAGTACCCTCCCTTTGCCCA AAGCCTTTCTTGTCTCTCCGAATTTAAATTTGGGAATCTTGGAGCATCAATGAGGTGGCTGGCTGTTACGACTATGCCTTAGCTGATCTGTGATCACAGA TATTGTGTTCATCTTTGCGGAAACTGTCACAGGGAAAGGATGAATGTTGATTAAGCTGGATTGTACAGATTGTGTAACTACACATGCTTAATATGATTAG CTCTGTGGAGTATGCATGTAAATATTGAAAAGAATTACCTGCATTCCTTCCCTCTTTCTCTTATTACTTAAAATATTATGTGCTATTGAAGATTTACCAA CTTTTTTTTCCAGATATATACGCCTAACCATCATTATTGCATCTGATTGTTTTAAATTTTGTGTCTTCCCCAAAATTACAGCTCGAAAAGACTGCAGGAC CAACATATGGCAAAACTACTCCGAACCAGAATGTCTCTTTTAACAGCCAAGATGTGCACAAATTTCGCACCTATAGCCCCATTTCTGTTTTCGAAAGCAG TAGTTCTTCCTCAGTTGAGAACTCCAACTTTGACTTACCTGTCATCCCATTGAAGCGTCCACGAGGCAAACGTCTGCGTCTCTCGAGCTTCAATCAACTA TTATCACTTCCTTTCATCTCCCATTCGCCAGATTTTGAAACACAGACTTCGGGTAAATTAAAAACCACAGTCAAAAGGCAGAGGAAAAAGGATCTCTTAC TACCCCCTGATCACAGTGAGATGAAGAGATCGTCGTCACAGGAGTCAGATGTCTTCGGAAAATGCACACATTGCCAGGTGACAGAGACACCACAATGGAG AGAGGGACCTATGGGTCCAAAAACCCTATGCAATGCTTGTGGGGT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_194384;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_464002

FPKM

• PAB: 0.9
• PNAB: 2.3
• PS1: 1.4
• PS2: 0.6
• PS3: 1.1
• PW1: 1.6
• PW2: 1.7
• PW3: 0.9

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_464002

• Blastp: -
• Blastx: GATA transcription factor 11 from Arabidopsis with 67.57% of identity
• Eggnog: Transcription factor(COG5641)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G08010)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019453953.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;