Ll_transcript_480490

• Id Trinity: TRINITY_DN52729_c5_g3_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_480490
• Sequence: TTTAATGAATGGGGCGGCGGCGCAAATTGGTTCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGGCTGCGGTGGTTTTCCGGCGACAGATCTCTTCTCAGAGTTTC TAATACCAGTAATTTCTATTGATTTTCTTAATTCCTCACAATCAGATCCGATTTTACTTTGTTTTAGATTTAGCGATTTGTGTGGTGTAGTATGTTCTTG GCTATATGTGGAAATCGTAATTAGTGGTTATAGATCCTGATGATGCATGTTATCTGAATCTTAAAAATAACTTTTTTTTCTCACAGAAAAATGTTTTTAC TTTACTTTATGATAGGCTTTTCTTATTTAGATTTGGTTTCCACACTTAAAAACAACATTTTCCAATAAGAAAATAGATTTATTAGGTTTTTACGATGATG CAATTGGATTCTATGTAAAATTTGATAACATTATACAGCCACGTGTCTTAATCTGCTTTTGCTTGATCTAGTTCGTAATACTTTCAGATTGTTTGAATTT GATTTTAGGACAGAACAATGTTTTAAATTGCGGAACGACCGCTTAATCTGCTTTTGCAGTTGCGGTCGTCACAACCGTATCATACCACAATTTCGGTACG ATACCGAATAACAGTATCTGGACCGCAACATAATTGCATCGGGTCGCAGCACAACCGCCTGCAAAATATGTTTTTACTCACAAAGTAATTCACATCGTAA TGGCCACAATCCAAATCGTAGCGGCTGTAATAACTGCAACTGTTACCACAATTGTAACCGCAACCCCAATTTAAAACACCGGCACGGAAGGAGGTTAAGT TTATGAAACGATTTAAGGTGAGTTGTAGAGGGTATTTAGCAGGAATCAAAGGCCTCTTTGGGTTGTAAGTGTAATTTAACTATCAGTTAGCTTTCACAAC TAGAAAAACCCAAATGCTTTGATCAGAAGTACCAATTAATTTTTTTTCTGTCTAAAATCAAGTGAAGGCAAGTGCCATTTGAATACTTTAGTGATATTGG ATCTTCACATGTTTTTCCTCTTATCAGAGAGAAAATAAGGCCTATCTTTATCTCTGTAGGGTTTATTGAAGAATCTACAGTGTTATCATTAAATATCTGT TATTTGTTTCATATTGTGATGTATATGCCATGCTGAATTGCTGATGGTATACTCTGTTGAACTACAAGGTTCTGACATTGTATAGTAATGATCTAATCTC AAGTTTTAAATGTGTGGTCAAATTAGTTCCTGTACTATTGTTGTATGATAGGGACTCTATGGAAACTGTTATTATTTTCTATGACGGTGCAGGGGTTTCA AGGATGTGATCATTCAGTTATGGTGCATTAATATTAGAATAATTTGTTTTTAAATTTGAGCTCAGACCAATCTTGGAATAATTTATGTCTTTATTTGGTA GCATTAACATTGGAATGATTTATTTTTAAATTATGCTCTGATTGGAACTCAAACTCAAAAGTGCTTGGAGTGATGAATTTCTGAGGAGCTTGTTTCCTTT TGTGTATATAAGGTGCTTATTCTCCGTAACTGTATTTTTCAGTGTTTTTCATATTACTCTGAAAATAAGTTCATGGTTTGCAGCATGCCTAATTATTTCT TTGCATGGACATTTTAACTTTTATTTTATTATTGGTGAAAGAAAGGTAAGAGTTGGGTCTATGCAAGACTGTTTGTTGTTTACTTGATCTTATAGGTAAG AATGTAAGATGCTTGCGGAAACATTAATATTTGGGTGCATGAAGAGAAATGCTATTCTTTCCCCTAAATACTCGCCTCTTGATGCAAGCCATTTTCTTCC TTGGAATTCTTCAATAAGACAGGCTATCGGCTATTAGCATACTCAAGTGGTATGAGAGTCAGGTTTGGCTACGACATGGTGGACTTAAGGGGGAGTGCAC TGAAAAGTGTGTGATACTCACACTTGAGGGGGAGATTGTTGGATTTATTCAAGTGTGAAGTTCCATATTGGATATATGGGGAAGAGTGAAATAGTTTATA AGTAGGAAAGACTCATGGAACTAATGTCTTAAGGTTTTAGTTCAAGACATGGTGTCTCACTTGTGACTCTCCACTCTTT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_195104;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_480490

FPKM

• PAB: 4.7
• PNAB: 2.5
• PS1: 1.1
• PS2: 1.2
• PS3: 1.1
• PW1: 2.3
• PW2: 5.7
• PW3: 7.5

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_480490

• Blastp: -
• Blastx: -
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: mtr-MIR168c (MI0019093)
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019430294.1)
• Pfam: -
• Rfam: MIR168 (RF00677)
• GO: -