Ll_transcript_493070

• Id Trinity: TRINITY_DN52856_c3_g3_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_493070
• Sequence: GCCTATTCCAATCAAGCCGAGGTAATAATAACTTTACCATTATTTAGGTCTTTTTTTCCCCTTTTTAATTTTTTTAAGAGTATAAATTGTATGCACGGAT ATTGTAAAGATTTATATAGTCATTCGCCATTTATTTGTATTACTTTTGTTTAAAAGTCGTCAATCATAATAAAATATGAATGATAAATGATACAATGATA GTATAAAAATCTCTTACGTCTATATTTTTTTTTTCTGTTTTTTTAATCACAGATTCCTTTGCATAACTTTATGTAATCAACCTCTTTTCTGCCGACATAT ACTTTCAAAATATTCCACTGTGCTAGCCTAGTGCACTGGGTCACCAGTATTTGTACAACTTAATTAGTTAAGCGCTTATTCACTAAGCCTTTTAGAAATA GCTAAAAGAGCTTATTCTCTTGAGCTTCGATGACAAAACTAATTGAAATGAGCTAGAAAAGGCTTATAGGAACATCATAAGCTATTTTTTCTTAAATAGA CACCTTTATACCATGACTTGGTTAAACAACTTAATGAAATGCTTATTCACTCAGTTTTTTGTTGAAATAAGCTGAAAAGAGCTTATTTTCATAAGCTTAT CTGATAATTTAATTGAAATGAACATAGAAAGAGCTGATAGGAATGTTATAATTATTTTTACAAGTGGTTTGCAACCAAAGTCGTAGTCACAATATTGAAA ATTTCCAGGCCTTAACACAATCGTATTGCAACTATGATTATAGTCACACTAAAAAAAATCATGATTGTAAGCTTATGGATTGTTGCAATTTAAAAATCAT GATTATAAGCATGTGAATTATGAGTACAAAATTTTAATTGTGGTATATCTCAGCTGATGCTATTTTACCTAGTATTCTGTTAAAGGTGGCTTGTGTATGA AGTTTTAAATTATTAATTGAGAGGTTTTAAATTCTGCCTTTCATAGATTGGTTCTGCTCTGAAGAAGCTTTTTGATGATGGGGTTGTTAAGAGGGAAGAT ATATGGATCACTTCCAAACTCTGGTTTGTTGTCTTCTGATAATTTTAAGCTATTTCTGAATGTGAGAATAAATTTATGCCTCTGGTTGTGGTTGCTGAAT AAAGATACTTTGCTTTCTTCACTATCTTCTCTAGGTGTTCAGATCATGCTCCGGAAGATGTGCCAAAAGCATTGGAAAAAACTCTACAGGATTTGCAACT TGACTACCTTGATCTCTACCTGGTATGCATTATCTTCAACCAATGCAATCTGAATTTATATCGGAAATTTGGTGGATGACTAAACGTTATAATCTCAAAT CATGGTTTCACAATTGAGTAAAATTTATTGGTTTTAGATAGTAAGCGTTTATTTGTTAGTTGAATTTTGGAGGGGAAAGAATGGAAAGGGAAGGCTTCAG AGCCATTTCAAAGTGTATTTCATGCCTCTTAAGGTTCTCCCTTCCATTCATTTCTCTTCAAAACTTAACTCGCAAAAGGACCGTAAGTGTAATGATGTGT TCAACACAGAAGGTTTAATAAGTCAATCTATTGAATTGATTCATTTTGCAGATCCACTGGCCAGTCCGGATGAAAAAGGGATCAGTTGGATTCAAGCCTG AAAATCTTGATCAACCTGACATACCAAGCACATGGAGGGCATTGGAGGCGCTCTACGACTCTGGCAAGGCGAGAGCTATAGGAGTGAGCAATTTCTCTTC AAAGAAGCTTCAGGATTTGTTGGAGATAGCTCAAGTGCCGCCTGCAGTTAACCAGGTTGAATTGCACCCAGCATGGCAGCAGCCGAAGTTGCGCGCATTT TGTGAATCTAAAGGAATTCACTTATCTGTAAGTATAGAAGATCTAACACACCCAAAAGAGCTAATAGTTATGCAAATACATTGTCCAGTGACTTATTGCA AGGTTTAGGAAAATACTAATTGCTATTTTGTGTTTTTGGTGAACATTATTGAGCAAATTGAAGATAAATTTACATTTTAGTACATCTTCAAATGGTGGTA CCTCAACAATCATTCCTGTGATTGATAATGGTATGTGATGATGAATTTTCTTTCTCAGGGATATTCACCATTGGGGTCACCAGGAGTTCTCAAGAGTGAC ATCCTTAAGAATCCAGCTATCAGTGTGGTTGCAGAGAAATTGGGGAAATCTCCAGCACAAGTGGCACTTCGGTGGGGCCTGCAAACGGGACATAGTGTTC TTCCTAAGAGCACTAGCGAGGCTAGAATCAAGGAGAATTTCGATGTTTTCGATTGGTCCATTCCTGAGGACTTGATAGCCAAAATCTCAGAAATTAAGCA GGATAGGCTAATTAAGGGTACTGGATTTGTTCATGAGACCTATGGATTCTATAAGACCATTGAGGAACTCTGGGATGGAGAACAGTGAGCAGGGTGCATA TTGTGATGTTTACAAATAGTACACTGCTTCTGTTTGCTGGTTGATTATGTTGTTGATTCAGTACTAGTTTACCATCTTATATGGGTTCCAGTTTGGAGTG CTTGGATTATATCAGACCAAAGAACTGATCGTCTTTGTCATAATGCAGAATAAGAAACCAAGATTGGATTTTCTTTCATAAATATTGTTTTTTTTTCAGG ATAGAAAAACAGAGTGCTATAAATTTGAGAAGCTGAATTTCTCATCCTATTAACATTCCCCTTGTCATTCCTTTTCTCATTTCATATACCCATCCTTATG ACATGAACCATTACTCACGCCACCAAAGATGGCAATGACCTCTAAACTAAGGAGATAATGTTTCCATGCAACATGAGTAGGGATAACAATGACTTTGGAT GGATATAAGTAGTGCACTACTTAGACCTGCTTTGTTCTGCCATTTGGGACCTATGTAGCTAGCAAATTCTGATTGGTACGAGATAATCTTTAGTGGCTGA GCCACGATTAGGTTGCTCTCTTTAAGACGTTTCATGGTACTGCTAAAATTGTGCAAGCAGATTATCAACCACGTTATACTCGGAATAAAACAGTCTAGCT CTCTGTTATATGATTTCCTACTACGCTGTAAGAATTCATTCTGAATACACCGACAATATGACTATCAATGCTAATTCTTAAAGTTCCCACAATATGGCTA CCCGTGTCAATTCTTTACTCACAATATTGACTACCAGTGTTGTTCTCGAAATTCCCACTTTGAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_196305;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_493070

FPKM

• PAB: 0.2
• PNAB: 0.1
• PS1: 0.1
• PS2: 0
• PS3: 0
• PW1: 0.1
• PW2: 0.2
• PW3: 0.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_493070

• Blastp: NADPH-dependent aldo-keto reductase, chloroplastic from Arabidopsis with 72.73% of identity
• Blastx: NADPH-dependent aldo-keto reductase, chloroplastic from Arabidopsis with 72.73% of identity
• Eggnog: reductase(COG0656)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G37770)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0001532)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019430790.1)
• Pfam: Aldo/keto reductase family (PF00248.20)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;