ta-siRNA 290 details

ID290
SequenceTAAATGGATTTAAGGAGATAACTT 

Targets of siRNA 290

LuluDB transcript

Target start position

Target end position

Target sequence

BLAST target sequence

Target details
Ll_transcript_154282; 909 932 AAGTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_213647; 3655 3678 AATTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_213656; 3494 3517 AATTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_213654; 3415 3438 AATTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_59609; 2659 2682 AATTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_59617; 2606 2629 AATTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_59606; 2603 2626 AATTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_59610; 2571 2594 AATTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_213645; 2563 2586 AATTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_213653; 2484 2507 AATTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_59623; 2392 2415 AATTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_59608; 2339 2362 AATTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_59619; 2336 2359 AATTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_59628; 2252 2275 AATTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_15038; 650 673 AAATTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_129523; 207 230 AAATTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_81199; 1737 1760 AACTTATCTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_228708; 1770 1793 AAATTATCTCCTTAAATCTATTTA BLAST
Ll_transcript_81192; 1671 1694 AACTTATCTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_228706; 1674 1697 AAATTATCTCCTTAAATCTATTTA BLAST
Ll_transcript_163107; 1650 1673 AATTTATCTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_163098; 1622 1645 AATTTATCTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_228709; 1415 1438 AAATTATCTCCTTAAATCTATTTA BLAST
Ll_transcript_228707; 1335 1358 AAATTATCTCCTTAAATCTATTTA BLAST
Ll_transcript_228710; 1319 1342 AAATTATCTCCTTAAATCTATTTA BLAST
Ll_transcript_228711; 1239 1262 AAATTATCTCCTTAAATCTATTTA BLAST
Ll_transcript_204014; 56 79 AAATTATCTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_204016; 207 230 AAATTATCTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_199592; 224 247 AAATTATCTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_43866; 191 214 AACTTATCTCCTTAAATCCGTTTA BLAST
Ll_transcript_18403; 180 203 AAATTATCTCCTTAAATCTATTTA BLAST
Ll_transcript_83523; 1781 1811 AAGTATTTGTTTATCTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_83512; 1222 1252 AAGTATTTGTTTATCTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_83517; 1215 1245 AAGTATTTGTTTATCTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_102958; 3260 3283 AAATTATCTCCTTAAATCCATCTA BLAST
Ll_transcript_102960; 2988 3011 AAATTATCTCCTTAAATCCATCTA BLAST
Ll_transcript_102956; 2713 2736 AAATTATCTCCTTAAATCCATCTA BLAST
Ll_transcript_81187; 87 110 AAATTATCTCCTTAAATACATTTA BLAST
Ll_transcript_102963; 2486 2509 AAATTATCTCCTTAAATCCATCTA BLAST
Ll_transcript_81149; 87 110 AAATTATCTCCTTAAATACATTTA BLAST
Ll_transcript_102965; 2214 2237 AAATTATCTCCTTAAATCCATCTA BLAST
Ll_transcript_102964; 1939 1962 AAATTATCTCCTTAAATCCATCTA BLAST
Ll_transcript_144492; 254 277 AACTTATCTCCTTAAATCCACTTA BLAST
Ll_transcript_213638; 777 800 AAGGTATCTCCTTAAATCCATCTA BLAST
Ll_transcript_204005; 357 380 AATTTATCTCCTTAAATCCATTCA BLAST
Ll_transcript_213626; 159 182 AAATTATCTCCTTAAATCCATTCA BLAST
Ll_transcript_141449; 215 238 AACTTATCTCCTTAAATCCATTCA BLAST
Ll_transcript_23323; 59 81 AAGTATCTCCTTAAATCAATTTA BLAST
Ll_transcript_23321; 59 81 AAGTATCTCCTTAAATCAATTTA BLAST
Ll_transcript_23325; 59 81 AAGTATCTCCTTAAATCAATTTA BLAST
Ll_transcript_23322; 59 81 AAGTATCTCCTTAAATCAATTTA BLAST
Ll_transcript_23326; 59 81 AAGTATCTCCTTAAATCAATTTA BLAST
Ll_transcript_256405; 1562 1585 AAGTTATCTCCTTAAATCCATTCT BLAST
Ll_transcript_154295; 2 25 AAGTTATCTCCTTAAATCCATTCT BLAST
Ll_transcript_248274; 39 62 AAGTTATCTTCTTAAATCCATTCA BLAST
Ll_transcript_214359; 633 656 AATTTATTTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_233678; 656 679 AATTTATCTCTTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_272553; 100 123 AAATTATCTCTTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_150701; 2045 2068 AAGTTATCTCATTAAAACCATTTA BLAST
Ll_transcript_230573; 159 182 AATTTATCTCCTTATATCCATTTG BLAST
Ll_transcript_230574; 159 182 AATTTATCTCCTTATATCCATTTG BLAST
Ll_transcript_17070; 588 611 AATTTATTTCCTTAAATCAATTTA BLAST
Ll_transcript_168457; 26 49 AATTTATTTCCTTAAATCAATTTA BLAST
Ll_transcript_288491; 914 937 AAGTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_343668; 3717 3740 AATTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_343671; 3638 3661 AATTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_343670; 3477 3500 AATTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_343667; 3398 3421 AATTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_343672; 2467 2490 AATTTATCTCCTTAAATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_369744; 1785 1808 AACTTATCTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_369748; 1749 1772 AACTTATCTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_369741; 1687 1710 AACTTATCTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_369753; 1671 1694 AACTTATCTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_434114; 1644 1667 AAATTATCTCCTTAAATCTATTTA BLAST
Ll_transcript_434118; 1548 1571 AAATTATCTCCTTAAATCTATTTA BLAST
Ll_transcript_467925; 474 497 AAATTATCTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_351046; 197 220 AAATTATCTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_315081; 1516 1546 AAGTATTTGTTTATCTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_315074; 1182 1212 AAGTATTTGTTTATCTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_342746; 1292 1315 AATTTATCTCCTTAAATCCATTCA BLAST
Ll_transcript_342754; 1292 1315 AATTTATCTCCTTAAATCCATTCA BLAST
Ll_transcript_387912; 30 53 AATTTATCTCCTTAAATCCATTCA BLAST
Ll_transcript_342748; 1292 1315 AATTTATCTCCTTAAATCCATTCA BLAST
Ll_transcript_387909; 30 53 AATTTATCTCCTTAAATCCATTCA BLAST
Ll_transcript_363760; 68 91 AAATTATCTCCTTAAATACATTTA BLAST
Ll_transcript_443544; 2486 2509 AAATTATCTCCTTAAATCCATCTA BLAST
Ll_transcript_363753; 68 91 AAATTATCTCCTTAAATACATTTA BLAST
Ll_transcript_443542; 2214 2237 AAATTATCTCCTTAAATCCATCTA BLAST
Ll_transcript_342741; 861 884 AACTTATCTCCTTAAATCCACTTA BLAST
Ll_transcript_443550; 1426 1449 AAATTATCTCCTTAAATCCATCTA BLAST
Ll_transcript_407050; 169 192 AATTTATCTCCTTAACTCCATTTA BLAST
Ll_transcript_303442; 1118 1141 AAGGTATCTCCTTAAATCCATCTA BLAST
Ll_transcript_343697; 1128 1151 AAATTATCTCCTTAAATCCATTCA BLAST
Ll_transcript_343679; 1117 1140 AAATTATCTCCTTAAATCCATTCA BLAST
Ll_transcript_303460; 634 657 AAGGTATCTCCTTAAATCCATCTA BLAST
Ll_transcript_506628; 665 688 AAATTATCTCCTTAAATCCATTCA BLAST
Ll_transcript_407039; 169 192 AATTTATCTCCTTAACTCCATTTA BLAST
Ll_transcript_303438; 492 515 AAGGTATCTCCTTAAATCCATCTA BLAST
Ll_transcript_360664; 298 321 AAATTATCTCCTTAAATCCATTCA BLAST
Ll_transcript_513360; 39 62 AAATTATCTCCTTAAATCCATTCA BLAST
Ll_transcript_479842; 60 82 AAGTATCTCCTTAAATCAATTTA BLAST
Ll_transcript_282792; 90 112 AAGTATCTCCTTAAATCCATATA BLAST
Ll_transcript_282793; 90 112 AAGTATCTCCTTAAATCCATATA BLAST
Ll_transcript_282794; 90 112 AAGTATCTCCTTAAATCCATATA BLAST
Ll_transcript_479843; 60 82 AAGTATCTCCTTAAATCAATTTA BLAST
Ll_transcript_479844; 60 82 AAGTATCTCCTTAAATCAATTTA BLAST
Ll_transcript_288474; 1571 1594 AAGTTATCTCCTTAAATCCATTCT BLAST
Ll_transcript_423581; 137 160 AAATTATTTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_528731; 267 290 AATTTATTTCCTTAAATTCATTTA BLAST
Ll_transcript_410301; 525 548 AAGTTATCTCATTAAAACCATTTA BLAST
Ll_transcript_410307; 525 548 AAGTTATCTCATTAAAACCATTTA BLAST
Ll_transcript_410310; 525 548 AAGTTATCTCATTAAAACCATTTA BLAST
Ll_transcript_498894; 54 77 AATTTATCTCCTTATATCCATTTG BLAST
Ll_transcript_498875; 54 77 AATTTATCTCCTTATATCCATTTG BLAST
Ll_transcript_479840; 558 581 AATTTATTTCCTTAAATCAATTTA BLAST
Ll_transcript_282814; 256 279 AATTTATCTTCTTACATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_346890; 138 161 AATTTATCTCTTTACATCCATTTA BLAST
Ll_transcript_447511; 2131 2154 AAATTATCTCATTAAACCCATTTA BLAST
Ll_transcript_447518; 2116 2139 AAATTATCTCATTAAACCCATTTA BLAST
Ll_transcript_447528; 1037 1060 AAATTATCTCATTAAACCCATTTA BLAST

Expression of siRNA 290


Labels

FPAB_1 abscising flower pedicels (replicate 1)      PAB_1 abscising pods (replicate 1)      PW2_1   pods wall stages 4-6 (replicate 1)
FPAB_2 abscising flower pedicels (replicate 2)      PAB_2 abscising pods (replicate 2)      PW2_2   pods wall stages 4-6 (replicate 2)
FPNAB_1   non-abscising flower pedicels (replicate 1)        PNAB_1   non-abscising pods (replicate 1)        PW3_1   pods wall stages 7-8 (replicate 1)
FPNAB_2   non-abscising flower pedicels (replicate 2)        PNAB_2   non-abscising pods (replicate 2)        PW3_2   pods wall stages 7-8 (replicate 2)
LF1_1 lower flowers stage 1 (replicate 1)      PS1_1 seeds stages 1-3 (replicate 1)      UF1_1 upper flowers stage 1 (replicate 1)
LF1_2 lower flowers stage 1 (replicate 2)      PS1_2 seeds stages 1-3 (replicate 2)      UF1_2 upper flowers stage 1 (replicate 2)
LF2_1 lower flowers stage 2 (replicate 1)      PS2_1 seeds stages 4-6 (replicate 1)      UF2_1 upper flowers stage 2 (replicate 1)
LF2_2 lower flowers stage 2 (replicate 2)      PS2_2 seeds stages 4-6 (replicate 2)      UF2_2 upper flowers stage 2 (replicate 2)
LF3_1 lower flowers stage 3 (replicate 1)      PS3_1 seeds stages 7-8 (replicate 1)      UF3_1 upper flowers stage 3 (replicate 1)
LF3_2 lower flowers stage 3 (replicate 2)      PS3_2   seeds stages 7-8 (replicate 2)        UF3_2 upper flowers stage 3 (replicate 2)
LF4_1 lower flowers stage 4 (replicate 1)      PW1_1   pods wall stages 1-3 (replicate 1)        UF4_1 upper flowers stage 4 (replicate 1)
LF4_2 lower flowers stage 4 (replicate 2)      PW1_2   pods wall stages 1-3 (replicate 2)        UF4_2 upper flowers stage 4 (replicate 2)