ta-siRNA 38 details

ID38
SequenceACCGCATTTGGACTGCATCAGACC 

Targets of siRNA 38

LuluDB transcript

Target start position

Target end position

Target sequence

BLAST target sequence

Target details

Ll_transcript_54977; 139 162 GGTCTGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_218145; 992 1015 GGTCTGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_230846; 369 392 GGTTTGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_230845; 1169 1192 GGTTTGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_69200; 160 183 GGTCCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_182118; 20 43 GGCTTGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_242696; 1233 1256 AATTTGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_110516; 6 28 CATCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_272687; 874 896 ATTCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_272691; 1037 1059 ATTCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_272689; 874 896 ATTCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_272693; 1037 1059 ATTCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_146346; 31 54 GGTCTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_10296; 656 679 GGTCTGACGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_91552; 614 637 GGCTTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_91547; 715 738 GGCTTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_91536; 991 1014 GGCTTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_10651; 1 23 GCCTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_190553; 68 91 GGTCCGATGCCGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_178497; 45 68 GGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_178498; 69 92 GGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_8362; 18 41 GGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_201072; 44 67 GGGCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_29455; 81 104 GACCTGATACAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_235391; 109 132 GGCATGATGCTGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_238504; 151 174 AGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_262899; 18 41 GGCATGATGCCGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_262923; 18 41 GGCATGATGCCGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_53735; 1036 1059 GGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_53735; 1057 1080 GGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_69168; 296 319 AGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_250772; 216 239 AGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_250769; 216 239 AGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_224765; 59 82 GGCCTGATGCAGTCCAAATGCAGT BLAST
Ll_transcript_42802; 1056 1079 ATATTGATGCAGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_64654; 286 311 TGTACCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_244899; 980 1003 AATTTGATGCAGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_244902; 980 1003 AATTTGATGCAGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_244882; 980 1003 AATTTGATGCAGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_244883; 980 1003 AATTTGATGCAGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_244912; 980 1003 AATTTGATGCAGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_244906; 980 1003 AATTTGATGCAGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_244893; 980 1003 AATTTGATGCAGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_244891; 980 1003 AATTTGATGCAGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_244898; 980 1003 AATTTGATGCAGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_244890; 980 1003 AATTTGATGCAGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_244897; 980 1003 AATTTGATGCAGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_244905; 980 1003 AATTTGATGCAGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_244908; 980 1003 AATTTGATGCAGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_146319; 353 376 GGTCTGATGCGGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_72211; 410 433 AGTCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_192976; 355 378 GGTCCGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_192975; 355 378 GGTCCGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_64853; 44 67 GGCTTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_54974; 272 295 GGCTTGATGTAGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_142545; 622 645 AGCCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_54935; 334 357 GGCCTGTTGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_180102; 3 26 GGCCTGTTGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_129282; 977 1000 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_129283; 977 1000 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_129280; 977 1000 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_129278; 977 1000 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_129275; 977 1000 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_129279; 977 1000 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_43911; 131 154 GGTCTGATGCGGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_43920; 131 154 GGTCTGATGCGGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_43902; 140 163 GGTCTGATGCGGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_237323; 58 81 AGTCTGATGCGGTTCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_217865; 1372 1395 GGTCTGATGCTGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_224219; 519 542 GGTCTGATGCGGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_224214; 698 721 GGTCTGATGCGGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_193641; 1128 1151 GGTCTGATGCAGTCAAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_193649; 1304 1327 GGTCTGATGCAGTCAAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_142568; 209 232 GGTTTGATGCGGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_162579; 121 144 GGCCTGATGCGGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_262452; 525 548 AGTCTGATGCGGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_129284; 255 278 AGTCTGATGCGGTCCAAATGCAGT BLAST
Ll_transcript_129293; 255 278 AGTCTGATGCGGTCCAAATGCAGT BLAST
Ll_transcript_129298; 255 278 AGTCTGATGCGGTCCAAATGCAGT BLAST
Ll_transcript_129290; 255 278 AGTCTGATGCGGTCCAAATGCAGT BLAST
Ll_transcript_129292; 255 278 AGTCTGATGCGGTCCAAATGCAGT BLAST
Ll_transcript_204155; 57 80 GGTCTGATTCAGTCCAAATGCAGT BLAST
Ll_transcript_204159; 85 108 GGTCTGATTCAGTCCAAATGCAGT BLAST
Ll_transcript_201097; 79 102 GGTCTAATGCAGTACAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_201101; 79 102 GGTCTAATGCAGTACAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_234662; 207 230 GGCTTGATGCAGTCCAAATGTGGC BLAST
Ll_transcript_162613; 65 88 GGCTTGATGCAGTCCAAATGTGGC BLAST
Ll_transcript_217833; 161 184 GGCCTGATGCGATCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_92791; 177 200 GGCCTGATGTAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_101278; 495 518 GGCCTGATGCGGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_17621; 447 470 GGTTTGATGCCGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_42608; 162 185 AGCCCGATGCGGTCCAATTGCGGT BLAST
Ll_transcript_69198; 92 115 ACATTGATGCGGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_180856; 236 259 GACTTGATGCGGTCTAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_64852; 44 67 GGCTTGATGCGATCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_103190; 487 509 GGTCGATGCTGTCTAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_64858; 44 67 GGCTTGATGCGATCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_64864; 44 67 GGCTTGATGCGATCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_146322; 548 571 TGCCTGATGCGATCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_192975; 397 420 GGTCCGACGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_192602; 7 30 GGACTAATGCGGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_192604; 7 30 GGACTAATGCGGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_192605; 3034 3057 GGACTAATGCGGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_192610; 3183 3206 GGACTAATGCGGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_283038; 275 298 GGTTTGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_477076; 49 72 GGCTTGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_387906; 1227 1250 AATTTGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_365815; 29 51 CATCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_315445; 837 859 ATTCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_315444; 1000 1022 ATTCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_296824; 56 78 ATTCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_312041; 345 368 GGTCTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_378096; 24 47 GGTCTGATGTAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_388897; 164 187 GGCCTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_435310; 51 74 GGCCTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_435305; 890 913 GGCCTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_514067; 129 152 GGCTTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_369828; 637 660 GGCTTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_389794; 66 89 GGCTTGATGTAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_403779; 207 230 GGTCCGATGCCGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_403787; 1287 1310 GGTCCGATGCCGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_403785; 1287 1310 GGTCCGATGCCGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_403784; 1284 1307 GGTCCGATGCCGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_403789; 1284 1307 GGTCCGATGCCGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_405011; 760 783 GACCTGATACAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_405008; 1020 1043 GACCTGATACAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_405022; 1152 1175 GACCTGATACAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_405019; 1705 1728 GACCTGATACAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_405012; 2305 2328 GACCTGATACAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_306306; 190 213 GACCTGATACAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_345827; 1142 1165 GGTCTGATGCAGTCAAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_345840; 1226 1249 GGTCTGATGCAGTCAAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_345835; 1313 1336 GGTCTGATGCAGTCAAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_345842; 1397 1420 GGTCTGATGCAGTCAAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_375478; 559 582 GGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_375478; 580 603 GGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_375440; 559 582 GGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_375440; 580 603 GGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_466061; 340 363 AGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_327229; 1 23 GTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_482455; 88 111 GGCCTGATGCAGTCCAAATGCAGT BLAST
Ll_transcript_437988; 510 533 GATCTGATGCAGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_350041; 89 112 ATATTGATGCAGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_424522; 238 263 TGTACCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_477178; 837 860 AATTTGATGCAGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_477177; 837 860 AATTTGATGCAGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_437838; 420 443 GGTCTGATGCGGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_284241; 658 681 GGTCTGATGCGGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_284240; 658 681 GGTCTGATGCGGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_388885; 162 185 GGTCCGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_388880; 162 185 GGTCCGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_502013; 37 60 GGCTTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_514078; 69 92 AATTTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_402457; 274 297 AATTTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_454092; 20 43 GGCTTGATGTAGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_308800; 629 652 GGCTTGATGTAGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_329984; 1218 1241 AGCCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_319840; 944 967 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_319816; 944 967 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_319847; 944 967 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_319818; 944 967 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_319828; 944 967 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_489570; 3121 3144 GGCCTGTTGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_502054; 44 67 GAGCTTATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_528926; 75 98 GGTCTGATGCGGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_528925; 75 98 GGTCTGATGCGGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_334465; 74 97 AGTCTGATGCGGTTCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_366823; 15 38 GGTCTGATGCGGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_366813; 446 469 GGTCTGATGCGGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_284215; 258 281 GGCCTGATGCGGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_284216; 276 299 GGCCTGATGCGGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_284213; 447 470 GGCCTGATGCGGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_319809; 48 71 AGTCTGATGCGGTCCAAATGCAGT BLAST
Ll_transcript_319813; 48 71 AGTCTGATGCGGTCCAAATGCAGT BLAST
Ll_transcript_319810; 48 71 AGTCTGATGCGGTCCAAATGCAGT BLAST
Ll_transcript_472632; 78 101 GGTCTAATGCAGTACAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_330621; 213 236 GGCTTGATGCAGTCCAAATGTGGC BLAST
Ll_transcript_301856; 73 96 GGCTTGATGCAGTCCAAATGTGGC BLAST
Ll_transcript_284246; 199 222 GGCCTGATGCGATCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_282075; 526 549 GGCCTGATGCGGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_522074; 397 420 GGTTTGATGCCGTCCAAATACGGT BLAST
Ll_transcript_285644; 58 81 GACTTGATGCGGTCTAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_454747; 91 114 ACATTGATGCGGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_290975; 459 481 GGTCGATGCTGTCTAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_296806; 259 282 GGCTTAATGCAGTTCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_284250; 65 88 TGCCTGATGCGATCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_388885; 204 227 GGTCCGACGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_388880; 204 227 GGTCCGACGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_501283; 2 25 AATCTGTTGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_371508; 1063 1086 GGACTAATGCGGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_272689; 874 896 ATTCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_296824; 56 78 ATTCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST

Expression of siRNA 38


Labels

FPAB_1 abscising flower pedicels (replicate 1)      PAB_1 abscising pods (replicate 1)      PW2_1   pods wall stages 4-6 (replicate 1)
FPAB_2 abscising flower pedicels (replicate 2)      PAB_2 abscising pods (replicate 2)      PW2_2   pods wall stages 4-6 (replicate 2)
FPNAB_1   non-abscising flower pedicels (replicate 1)        PNAB_1   non-abscising pods (replicate 1)        PW3_1   pods wall stages 7-8 (replicate 1)
FPNAB_2   non-abscising flower pedicels (replicate 2)        PNAB_2   non-abscising pods (replicate 2)        PW3_2   pods wall stages 7-8 (replicate 2)
LF1_1 lower flowers stage 1 (replicate 1)      PS1_1 seeds stages 1-3 (replicate 1)      UF1_1 upper flowers stage 1 (replicate 1)
LF1_2 lower flowers stage 1 (replicate 2)      PS1_2 seeds stages 1-3 (replicate 2)      UF1_2 upper flowers stage 1 (replicate 2)
LF2_1 lower flowers stage 2 (replicate 1)      PS2_1 seeds stages 4-6 (replicate 1)      UF2_1 upper flowers stage 2 (replicate 1)
LF2_2 lower flowers stage 2 (replicate 2)      PS2_2 seeds stages 4-6 (replicate 2)      UF2_2 upper flowers stage 2 (replicate 2)
LF3_1 lower flowers stage 3 (replicate 1)      PS3_1 seeds stages 7-8 (replicate 1)      UF3_1 upper flowers stage 3 (replicate 1)
LF3_2 lower flowers stage 3 (replicate 2)      PS3_2   seeds stages 7-8 (replicate 2)        UF3_2 upper flowers stage 3 (replicate 2)
LF4_1 lower flowers stage 4 (replicate 1)      PW1_1   pods wall stages 1-3 (replicate 1)        UF4_1 upper flowers stage 4 (replicate 1)
LF4_2 lower flowers stage 4 (replicate 2)      PW1_2   pods wall stages 1-3 (replicate 2)        UF4_2 upper flowers stage 4 (replicate 2)