Id Trinity | FTRINITY_DN43683_c0_g1_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_236017 |
Sequence | GGATAATTGGGCAACGAATAACGACACAATCATTCATTCTTCTTTTCATTTTCTTCCTCTTCTTCTATAACTCTACACCACTCACTCACTCATTCATTCA CTATCCCATTTTTCACTAACCATGAACCACGATGACCCTCGAAACGGCGTCGTCTCCGAAAACAATAACAATAACCACCATGCATCAAAAAAACCAAAAA TAACCCGACCCATTTCAGAACCCGAACTCCGTAACGAATTCTCACACCACCAACCAGGTATTGCCCGAATCAATAACGGAAGTTTCGGTAGTTGTCCCCG TTCCGTTCTAACTGCTCATAACAACTGGCTTCTCCGTTTTCTCCAACAACCCGATCATTTCTACTTCAACACGCTCCGCACTGGCATCTTACACTCACGC GCTCTCATCAAAACCCTAATCAACGCCGACGCCATTGACGACGTTTCTCTTGTTGACAACGCCACCACCGCCGCCGCTATCGTTTTGCAACACGTCGGGC GCCGTTTCGGGCGCGGCGAGTTTCGGAGAAACGATTCTGTTATCATCTTTCACTGTGCTTACCAAGCGGTTAAGAAATCGATTCAGGCTTATGTTACTTC GGTTGGTGGTTCGGTTATTGAGGTGCGGTTACCGTTTCCGGTTCGGTGTGATGAGGAGATTATAGAGGAATTTAGGAAGGGGTTAGAGAGAGGGAGAGAG AATGGAGGTAGGGTTAGGTTAGCGATTCTTGATCACATTACTTCGATGCCTTCGGTTGTTGTTCCTGTCAAAGAGTTGATTCAGGTTTGTAGAGAGAATG GTGTGGAACAGGTTTTTGTTGATGGTGCTCATGCTATTGGAAGTTTGAGGATTGATGTGAATGAGATCGGGGCTGATTTTTATGTCAGTAATTTGTATAA GTGGTTCTTTTCGCCTCCTTCGGTCGCATTTTTGTATTGTAGGGATTCGAGGAGTTTGTATGATGTGCATCATCCTGTTGTTTCACATGAGTATGGGAAT GGGTTGCCGGTTGAGAGTGCTTGGGTTGGTGCTAGGGACTATAGTCCGCAACTTGTTGTGCCAGCTATTTTCGATTTCGTGGATAGGTTTGAGGGTGGGA TTGAGGGGATTATGAAGAGGAACCATGATGAGGTTGTTAAAATGGGTACCATGTTGGCTGAGTCTTGGGGGACGAATCTTGGGTCGCCTCCGGAGATGTG TGCCAGCATGATTATGGTGGGATTGCCTTCTAGGATCGGTGTGACGAGTGATGATGATGCGTTGAGGTTAAGGTCGCATTTGAGGGATCGTCATGGTGTT GAGGTTCCTATATATTACCAGGGAGTGAGAGAGGGTGATGTGGATCCTAGGGACAAAGATGGTTATATAACTGGTTATGTTCGTATTTCTCATCAAGTTT ATAATACTGTTGAGGATTATCTCAAGCTTAAGAATGCAATAAATCAGCTTCTCGAGGAAGGAAAAACTTGCAACATGCTTCCTAAGTAGAGAAAAGAAAA TAGTATGTGCTTTCTTCACTGTGGTGTGATGCTTATTGATGATTAATGTTTCTTTGAATTGTGTTTAGAAATTCTTAAATGGCATTTATGCTCTTAGTTG CTTTTTGATTTAACATCCTAGTTCACTTACTATATTGACTTCGATCTCTATGATGTCTATCATTGATTCTACATAGAATGCAGGGAAATGGTGTGGGTTA TAAGTATTTACTTATGATCCAAGTAAGTATACAAATATGATTGAATTAACTGCAGAATGCCAAATTATAGGTGGATTTTTCTAGAACGAGGTCCTGCTTC AATCTGAGCGTAGAGTCGTAGACCATTTTACAATCTCACAAATAGTTTAGAGTTTAGATTTTTTGGGCAGATGACTCAGATCTCTATCATTTATTGCTAT CCTCAATCTATGGAACCATTGTGCGTGGAAATCAGATTTGATTTTTAGTGCTCTGATCTAGACTTCTAAAAAGTTCTCACTATTGAGATAGCAAAACTGC TGCTGTCAAGTGGTGAAATGATAAAGCCTGTGAGTTTCATGCCAAAAGTAGTGCTCTAATCAACATAAGTAGGAAAACTGTGCGGTCAAGGTTGAGTTTT GTGACTAACTATAATTGGGTGTTAGCCTCTGAGATACTTAGGTTAGTTATCCAGTTTCTTGGATAAGTTGATATATGTGTGTAAAGAACGTTGTAGGATT GTCTATTTCATATCTATCACTTAAACACTGTCGAAATTTAATTGCTATATATGATGATTGTTAGTTTATAAAGCTACTGTTAACTGGATGGTAAATGCTC AACATATTGATTTCTGTCAGAGGTTCTGAGTGTCCAAGTCAACTTTGTTAATTAACTTACTTGGCTTCATTCAACAATTTTACTCATTTACGATTTGTTC CAGGAAAAAGTAGAGTTCTTTAACCTTCAAATATAAGAAATTTTGTTTACTTTGGATTGGATGTCTCCACCTGTGTACCCTTCCCACTTACAAATCCATC CATAACTAATCTTTCACCTTTCTTATTCTTTTTTTCCCCTTCCTAATAACACCTTTTAAGTTCACTGGTGGAGATTTGCTTTTCCATTCAGGTTTTCCAT TGCTAGTCTAAATCGTGGCCTCAAATCAGGTTAGACAGTGGATATTTTGCGAAATTCGCTTTTCCATTTCTACCGTAAATCATGGCCTCAAATTAGTTTA GACAGTGGATATTTTGCAAGCCATGACTATTTGAACCTTTGGTATAGAGCCAACTACAAATCTTAGTGGAAAGGGATGGATTGAGTGGAGATGGTATATA TGGTCATATATTACTAAAAAAATTTAAAACACGGTGTTAATGATGCTTCAGTGAGTAAAATAATGCTCATGGCTGAGGCATATCACATGACATGATGCAT AATAGGTTTTGTATTAATTTTGCTCATAAAGAGGTAACTAATATTCCCGCAAAACCTAATGTTTATCTTTAAATCCTTGAAATTTCTTTATTATTAGCAG ACAGTTGAGTCTGTGCTTTGGATTTGACAGGTAACTGAAAATGATGAATAATAAGAGGACCTTTCAGGATGCCGTGGTTGAGCTAGGTAGAGATTCTGAC ATTTACATCGTGGAATCGACTGTTGAAACAGCTGATGTTTGAGACTGCTGATGTTTGAGGCATTGTTTTCTTCTGGCTATTGAAACACGAGCATATAATA TATAGAAGTTCTTTAGTTTTCCAAATTAGCTTCAACTGAGGTTCTGTTTTTTGTTTGTTACCCGCCGAACAGTTCATGGCATGTGGTTTGTACCTTTTTA TATTGAGGGATGCATCTTGATAAGTTTATACAACAATAACCAAGCACTAATTTGACTAGGTGGATCAACTACATGGATTGAACGATGTTATAATACTCTA TCATATGTCATTTCCATTGACATAAGTTTAGAGCAATAATATCCTACATTTGGATGACAATTTTGTAACCATAGGGGCCATGTTTCTCAACTAGCCAAAA CATGCTTATGCTCTTTGCCATTCTCTGACCCCATATAATAAGCTCAGTGCCTTATATACTAGATCACTATATGGATTACATTCTCAGGTGGTAAAAAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_11658; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_236017
Blastp | L-cysteine desulfhydrase from Arabidopsis with 63.52% of identity |
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Blastx | L-cysteine desulfhydrase from Arabidopsis with 65.06% of identity |
Eggnog | cysteine desulfurase(COG0520) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G62130) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019422317.1) |
Pfam | Aminotransferase class-V (PF00266.18) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |