Id Trinity | FTRINITY_DN49162_c0_g1_i6 |
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Name Transcript | Ll_transcript_13063 |
Sequence | CTTATGAGCCCAATCACCATCAAGAACCACATGAGTGAGCCCGCAGGCTGCAAAGAACCCGTGAGGCTCGTGTCGTGTTAAATACCCAAGGCTCGATTCT TCTGAGAAAATACAAACATTTTGGTTCTTAAAGTGATTCAGCAGAAGAAAAGCTGAAAACATCGTCTTGTTAAGAAAAGCGATTTTAGGGCTTAGGATTA TGAATAATAGTTCATCACCGGCTCATTCATCGTTATCAACGACGACAGCTGTAGGTGGTGGAGGCGGTGGTAGCAATGCAACCGCTTCCTTTGACGATTT ACATTTCCCTTCTGATCCTATCTCATTCTCAACTCAACTGCGAAAAGATGAATCCATGCTAGGTTTACTTTATATTCAAATTTATCTTTCAATTCAAATT AATTTTTTATTGATTTTCCTCCTTTTAGGTTTCTTTTTAGGTTCGAACTCACATGTAGCCTCGAATTGCATTCTAGCCCGTTAGGGTTCATATTAGCATA ATCTTTTTTGTGTCAATTACACATTATTATTACAAGACTTTCTTTAAGATGAATCCAATAAATGAGAAAACCTAGTAGGCCCTATGGAAGCGCCAAGATG GATATTTGGTTCAAGAAGAGTGTTGGAACCTTTCTATGTAGTTTTGTAATCAGCTTATGCATTTTATGTATATTCTTAATTGAGATGATAAGGTGAATCA TGCATCATATAGACATTCTGATATCCTGTTTCACAGTTTTAAAATCGGATCTCATGGCTGCACTTGACAAGGAGGTTAAATCTTTGGATGAAGATAATTG GAAGTTTGAAGGTCCTCGTTCCCGGATCCACCTCGTATCACGTCCAGGTTTTTAGTATATCAATTACTCAATAACCCAATCCATTAGCACGATATCGTAT ATAACTTCAGTGTTTGTAGAATATGTTAGAAACATTATTACATTATGTTTTGGTTTCCAAACCGTAGATTAAAACTTGGTACTTGGTGAGTGGCTTTGGT TTTGTATTATGTTAATTGATGCTACCAGCTTCAGCTGACAATCATCAAAGCATAACTTCATTGTTTTAAAACTAACTTTACTGGAATCCTTCTTAATGTG GTTGAAAGAAGATGTAGATAACAATGCTGATTTCTTTATCTCATGATAAGTACAGAGTTATGCTTTTGGCATGATAATTAAAATAAGTATTTATTCTTTG AAGATGATTGTCACCTGCATTATCATATTTAAACCTCATCTGATCTTTTGAAAATTCAAGGTGATATCATTTTCACCCTGCCAATCTTCTTTTCCTATTT GCTGATTTATTAGTGATAGGTAGAACGATCCGAAGCTTAGATTTAGAAGAACATATCCCTCCTTACATTTGCTCAAAGTCTTATATACTTATGCATGGTT TCTACTGAATATTATGTTGCAGGTGGTTATCTCCATAAGCCCACAGAAATTTCAAAGAATTGGAATTTAACTCTACCGAAATAGTTGGAAATCACACCTT AAAGCAATGTACCTGTTTATTTTCAAATGGATATGGTTAAGATCTGCAGATAAGAATTGTTATGCCCTTCTTCGTTTTCTTATTTCCCCGAGGATAGAAG ATTGATATTCTGCTATAACTTATGTTGGTATTTAGTTCGGAGAAGGACGAGGGTTGCAAACGACATGTTCACTTTACCATTCCCTCCATCTGCTCTGACT CCCAAGTTTGATTTTAAATGTCGGCTACTTCAGCTATTTGTGGTTGAAACATTACAAAAAAGGGAAAACATGATTTTTAACAGTGTAAGTAGTTTGATTG TTTTCTTTTTAAATTTATTATGTTGGCCCTGTGATGCTGGGTCTGGTCCCACTGCATTGTTAATGTATTCTTTGTCCTCTTTATAGGCTGCAATCTGTAA CTTATGCATGCTATATTGATTGCTTAAACGCTCCTCTGGTAGTCTTTCTACCAGGCAGAAAAAATAGGTGTACTTTATTATGTACTGTTGCTTTAGTTTT GAGAGATCTATGGTTGTTGGCAGTTGTTTTCTTCGAGTAAGTGGTTTACTCAAGTTATTAATGGCTAACAACTTGCATGACTTGAGTAACTATTTACCAC TAACCACCCCTTCTTGGTTCAACATGTTTGTTGGCTATTCTTAAGTTTACTTTGAATAGGGGTCTGGACAGCAGGTTGTTATTCAAAATAATTCAACAAT TTGAAAAATTGCTGACATTTATTCAGTATTAATTTTTAGGAAAGATATCCACTTATTCTAGGAGTAAGTTAAAAAAACTATTTCACATCTTAGTCATTCA TTCTATGAAAACTAATGGTTTGAATTGGTGAGTAGATCTGAATAATTAGATTGGTGGCTAAGATGTGAAGTAATTTTTTTAACTTACTCATACAGTAAGG AGATTCCCTCCCTAATTTGTCTTGTCATTATTGAGTTGTAATTTTTTTATTGTATTCATTTAATTCAAATTCAATATTGAAAGTAGTACTTGTAAAATGT GTTAAAATTTGAGTTTATAGTTATTTATCTATTTATTTATTATTATCATTGAAGATGTAATGTCATACTGAACCTTCAATGGAATTATCATCCTTAAAAA CTATCATCTAAATTATAGTTGCATTATTTCATGTTAGATTGATGTTAAGATTTCAAGAAAATATGAAGTGGAAAACTTAATTATGGAGTAGATATTTGGA GCCACCGCATTGTTGCCATTCGTTCAGTTCAAGCAGAAAGAAGAAAGATCATATGTGCCTTCTTCAAAAATCTAATTAATTCAAATTCAATATCCTGAAA TAGAAGAGCTGAGCTGTTGGATTGGAACCCTGCTGCATGCATCAGATTATTCGGATCACAATCCGAAATGGATGGAAAAATCATAGAATTTTAATGTGAT TTTCACTTAACATATACGCTTGTGTTTGTTTGTATAAAGGTAAGAGATACGAATCAAGTACATGTTGGAGTTTTATTCTTGTTTTGCTTGTAGAACATGT AACGTTGGAAGAGACCAGATATATTTACAGGTGGTTTATATATGTGCCTATTTGGAGTACAAAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_18114; |
Additional information | - |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_13063
Blastp | - |
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Blastx | Protein SAMBA from Arabidopsis with 73.17% of identity |
Eggnog | NA(ENOG410Z6S4) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G32310) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0001173) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019445282.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |