Ll_transcript_12878

• Id Trinity: FTRINITY_DN49183_c0_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_12878
• Sequence: GTTTTGTTATCTTTCAACTACTTTATTTAATTTCTTTTTATTTTTTTGTATTATTTTTTATTTTTAAATTATTCAACAATGCCCGCGGGCCATCTGCATG CCTGTTAGCTCGTTTTAAAACGGGCAGAACATGTCATTTTATCCGTTAAGATAATGTTCTACATATTGCCATATAAACAAGTTTTTTTTAAAGTCACATT TTGATTGGCCGGGACAAGAGATGAAACATCATTGGAGACATGTGATCTCCCCATGTGTACGAGAATTGTTTTAAAACTATGACATTTTGGGTTGGAACTT GGAAACCTAGTACTTTCTCTTTTTGTCTTAGCCATATCATAATACTGAATCTGAGTCTGATAATTAGTCTCTTATCTTCACATCTCAGCTTGTTTGGGGT CTCATCTCTCATATTATGACCTCACATTCTTTACTAGTGCAAATCTTGATCATTTATACCTGATTATATTGTGCAGCCATACATTAGAGTTTTAAAAAAA TGTTGTATCTTGTAACTGTATCCGTATTGGGTGCTGATACCGTACCTGCATTCATGCAACATATATGATGGGTCATTTTTGGTGTTTTTGTATTGAAGGT CTAACATGTTACCTATTGTTACAGTCCATACTGAGACAAACCAATTTTAAAGGTGCAAAGTTGTTAGGTGCTAGCTTCTTTGATGCTGATTTAACAGGTT TGGCTAACATCTCATATTATGGTCAATTACACTCACCTTTACACCTCTTATCCTTCTTGTTTCAAAAATCATCCTCACATTTTAGTGTAATTTCAACCAT TACCCGTTACGGCTAAATGTTACATAACTTAAACTTCAAGGGAGGTTGATGTATTTTCTGAAAAAAAGAAATGTATCATGTATAAATAAACCGGAGGTTG ATGATATCGGCGTAATTTTTCATGTTTATTACGAGTGCAGACAGATATTATATGGCTTAGTGGCTTACATTTGCAATAAAAAAACCTTCCTGCACCCTTA TGACTATTTATATCAATTCTATTTCTACCTCTCTTGTTGTCAGGTGCTGATCTTTCAGATGCTGATCTTAGAAGTGCTGATTTTTCCTTAGCAAATGTAA CCAAGGTAAACTTAAGCAATGCTAACTTGGAAGGTGCACTTGTAACAGGAAATACATCTTTCAAGGGCTCAAATATTACAGGCGCCGGTATGTAGTAGTT CCACTTAGCTATTTATATGCTACAAGTGGATTTTTAAGAGAAATATGGTTATAAAGGTGTATTTATCTGATAATAACTTTTAACTCATTAAAGGTCAGAT ATTAGGATTAACTATTGATTAATTTACAAATTCTAATTCCGAGACCAATCGTGCTAATTAATCACGGCCAGGCTATTGACATACAACTAATCTCGGGTTT AAGCAATGTATGAAGTCAAGGCTTTTAGACTTTTAGGGAAAGAGAGAGCTTTGTAAGAGAGTGAAACTGGGAAAGCAAGTTTATTAGCAAAAATCCTTTC ATTACTTAAGAGACACCACTATATCTAGGCAAAGCGCGTCAAATCTTCGTACTATAAGAACGGATAGTTACCAATTTTTGTTGACCTTCATTCCAAGAAA CATAGATTTCATCAAATAAAGAAGCCTAGTTTGAACTATATTTTTGTTTTATATACTATACCAGTAACCAATATTAAAATGATTCTGTGATTGTTACTTC AGATGCAAGAGTATTATAGTTAGTGTAATGATTGGTGCACTATACCTACATAATCTCAGTTCCTACCATCTTATGTTCTTGGATTTAGTCATGTAACACA ACTGAACTAACACATGTAATGGTGAGAGTGTTATATGTAACATTTATTTGTTACTAATTATTACAAGTAGGAACATGATCTTATTTTTAGCTTGAATGTC AATATATTTCTAGCAATCTAGCATTAAAAGACTGAAAGGTTTACATCTTCATCTAAGAAGTTTGATGTAAGGAAACTTATACCAAGAGAGTTATTAATGT GTGCTTCGTATCTTCGCTAAGCCAGATTTTACGGATGTGCCTCTCAGAGACGATCAACGCGAATATCTCTGCAAAGTTGCAGATGGGGTGAACCCAACAA CTGGAAATGCGACGCGTGATACGTTGCTGTGTAAATAGTGTTCATTGCTGCTGCATCTCAAACTATAGAGTTCATGAATAAATTGTTTATACAAAGTGCT TTAGGTAATGACAGTTAAAGTAAAAAAAAACATGTTCATTGTTTTGGTGGAGTGCTTTATGGGGACAGCACTGAGTTACACTGAATTTGATTGAACATTA TGTTTACTTTTGTTGTTGTTCCATTCATTTTGGTTGTGAATTTTGCATATCTAATACGCATAAAAGTATTTGCAAATGAAGAACTTGGATTTGCAAGGAA ATCATCATCTCCAT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_18150;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_12878

FPKM

• FPAB: 0.2
• FPNAB: 0.6
• LF1: 0.6
• LF2: 0.3
• LF3: 0.4
• LF4: 0.3
• UF1: 0.4
• UF2: 0.5
• UF3: 0.4
• UF4: 0.4

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_12878

• Blastp: -
• Blastx: Thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic from Arabidopsis with 93.94% of identity
• Eggnog: Pentapeptide repeat-containing protein(ENOG4111W3N)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G44920)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0000276)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_020202224.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;