Ll_transcript_199120

• Id Trinity: FTRINITY_DN49770_c0_g2_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_199120
• Sequence: AGGAACTGGATCACCAATTCCTCCTATTCGAGGAACTGGATCACCAATTCCTCATGGAACTGGATCTCCAGTTCCTCCTACTCGAGGAACTGGATCACCA ATTCCTCATGGAACTGGATCTCCAGTTCCTCCTACTCGAGGAACTGAATCACCAACTCCTCCTACTCGAGGAACTGGATCAACAAATCGTCCTACTCTGA TGCGTGATCTCCCTCGTCCACTCCCTCATACAATTCATGCAGATATTGAACGGCTAAACATATCAGAGTCAGATAACAAATGGGAAAAGATTTCACCTGT GCACAGGCCTGACAATGGTGGAACAATAGCAATTCGGAGAACCAGGCTTCGCGTCAATCATTTTGCCGTTACCTTCAATCCACAAACTATAATTAATCAC TACGATGTTGATGTGAAGCCGAAGTTGCCGCCAAGACAAGGTCGACCTCCGAAGAAGATATCGAAATCAGATTTATCTTTGATTAGGGACAAATTGTTTG CTGATCATCCTAAGACATTGCCTTTGAAAATGACTGGATATGATGGTGAAAAGAACATAGTGAGTGCAGTTCCACTACCAGAAGAAACCTTTACTGTGGA CATCTCTCATGGAGAGGATGAAAAGCCTGTTTCATATGTTGTTAGTTTAACTCTTGTTAACAAGCTTGAGTTTCGAAAGTTACGGGATTACCTTAGTGGC AATGTTCTGTCAATTCCTAGGGATGTTTTATATGGAATGGATTTGGTTGTGAAGGAGAATCCTGCAAATAGCACTGTTTCTTTAGGACGATGCTTCTATC CTACAAACCCTCCATTGGTAGATAATGATCTTGGACATGGCATAATCGCAATTGGAGGGTTTCAACACAGTCTGAGACCTACCTCTCAGGGTTTGGCTAT GTGTTTGGACTACTCGGTTTTATCTTTCCGTAAGAAATTGTCTGTCCTGGACTTCCTAGCTGCTCACATTGATGGTTTCAATTTGGCTGGGTTTTGGAAA TATAAGAGGCAGGTTGAGGAGGCGCTTATTGGATTGAAAGTCAATGTCACTCACAGGAGAACCAAGCAGAAGTACACTATTGCCAAGTTAACAGATAGGG AGATACAACATATTACTTTTCCTCTGGTGGACCTAGAGGGTCTAAACCCCCCAACGGATGTTAGTCTTGTTGCATACTTCAAAGATAAATATGGTGTGGT CATTAAGCACAAGGATATTCCTGCCTTGCAGTTTGGAGGCAGCAAGATGAATTATGTACCTATGGAGTTGTGTGTCTTAGTTGAAGGTCAAAGGTTCCCG AAAGAATATTTGGACAAGAATGCTTCTAGGACCTTGAAAGATATGTCATTGGCTCGTCCGTGGGATAGGGAAGCTCTCATACAAAGGATGATAAAATCAA GTGATGGACCTTGCGGGTAAGGAGAACATAATTTCATGAGCTATTCAATTTTGGCATTGTATTGTTTCCTTTGCATGATTTTAGTTACTATTGTCTCGAA TGATGGTGTTGCATTGTTGGTTGCATATTGATAAATGGTTCTAACTAGGCTTAGTTCCACTTACAGTGTTGGACTGCTTGATAAATGAGTGTTTATTTGC ATATTGTAAAATGACATCAAATGTGAGAATGCTAAATACATTGACATGACTGTTAAACTTCTCATGCATTGCCCTTTCTCTCCTCATTTGTTAACTTTTT TATTAACTGATTGCAGTGCCCTATGTTTGGTGATTGATGAATGAAGATTCTCTTGCTAGATATGTACTTCGAAAATATTATTATTGAATGTTTATTTTCT GGTACTTGTATTACTGATTTTCTGCTATTCTTTACTACTGTTTGATGGAATATAAAATTGAATATTTTGGCAAGCTTATGTGAAGCTTTCTTTTAACTTG CCTAATTTTCTTGATATCAATATGGACCATTTCTAATGATTTTGGGTTTTTCTTTCCTTGCTGCTTTGCACTGTCCAAGAAGAGTTTTTTTTCATCTAAA AAAGGTGAAATAAACTAAATGAGTTTTAAAGGACTGTTAACATAGCAGTACATCCTCAAATGTCCATGCATGGTGCACTTCGTCTATCATTATAATTGGC ATTTTATCTCTTTCCTGATGGACATTGCATTGGTTCACACTTTTCTTTATTTATTGGAAACAGAGGTGGTATTCTTCAAAACTTTGGAATGAATGTCAAC ACTACAATGACAAATGTCACTGGACGTGTCATTGGGCCCCCAAAGTTGAAGTTAGGTGATCCAACTGGTAAGATTATTAGTCTGACGGTGGATCCAGAGA AATGTCAGTGGAATTTACTTGGAAGATCAATGGTGGAAGGGAAGTCAGTTGATTGTTGGGGCATTCTTGATTTTACCAGCCAGGGGCCAAATTGGAACAA ATTAAAAGGCGACCAATTCATTTGGAAGCTTGTCGATAAGTACAGAAAATTGGGCATTAACATGGCAGAGCCAGTTCATGTTGAACATTCTACAATGCGG AAACTTGGGGATTATGGTTCACTGTGTAAGCTACTTGAAAAAATTAATGATGGCGTTTATAAAAAATGTCAGCGCCGGTTGCAATTTCTTCTCTGTGTGA TGGCCAACAAAGATCCAGGTTACAAGTGGCTCAAATGGATTTCTGAGACGAAGATTGGCATAGTGACACAATGTTGTTTATCTGGTAATGCTAATGAAGG GAAAGATCAGTATCTTACTAATATTGCTCTGAAGATCAATGCAAAACTTGGAGGCAGTAATGTAGAGCTTAATAATAGGCTCCCACACTTTGAAGGTGAA GGTCATGTTATGTTTATTGGGGCTGATGTCAATCATCCTGGTTCCCGGGATGTTGATAGTCCTTCGATTTCTGCAGTGGTTGCCACTGTTAACTGGCCTG CTGCAAATCGCTATGCAGCACGTGTTTGTGCTCAAGTGCATCGGAAGGAGAAAATTATGAACTTCGGAGAAATTTGCTATGAGCTTGTTCAATGCTATTA TGGATTGAACAAAGTGAAGCCTGAAAAAATTGTCATCTTTCGTGATGGAGTTAGTGAGAGCCAATTCCATATGGTCCTTACTGAAGAGCTACTGGATTTG AAGAAAGTATTTGAGCGCTCAAATTATTTCCCAACCATCACTCTCATTGTGGCACAAAAGCGACATCAGACTCGATTATTCCCTGCAGGTAGGAACGAAG GGACATCTGGTGGCAATGTGTACCCTGGAACAGTTGTGGACACAAAAATCATACACCCTTTCGAATTCGATTTTTACCTGTGTAGCCATTTTGGAAGCCT TGGTACAAGCAAGCCCACTCACTATCATGTCTTGTGGGATGAACACAAGTTTACTTCTGATGGATTGCAGGAACTCATATATAATATGTGCTTCACCTTT GCAAGGTGCACCAAACCTGTATCTTTAGTTCCTCCTGTGTACTACGCCGACCTTGCTGCGTATAGAGGACGTTTATACCATGAAGCGAAGATTGGGGTGC AATCTCCATATTCTGCTGCATCCTCATCACCCATGGCGACCACAATTTCAAAAGATCTAGATTGTTACAAGTTGCATGCTGATGTGCAAAATGGAATGTT CTTCATCTGAAGGGTGTGCTCTTTGTTTTGCGTCCAAATTTGTGCGTGAATCTAAGACCTTGTGTGTTTGAAACTGTGTCGCCTTATTTTCTTCTATGTT TAGTAATTTCAGTTAGTAAATTGTATTGTCTGAGTCATTTTATTGATCTCAAAGTGAGATTCCATGTCTGTAGTGGTTTGGTTGGGATGGGAATTACCTA TTACTATTCTTGAAGATGGCAAAGTGATTGGATGATAGCTAAAGGGACAATGTTCACAAGCCTATAGCTTGTATTTCTTTTTTTGTCCATTTTGTTCTGT CAGCTAAGTTCATGGGTATCTCTTGGGCAATGTGTCTGCCCCTGTGTTAATTTAAGAAAAAATTAAAAAATTATGGTGAAATGCATTTAAATGCTTCAAA AACTTATGATGTGATTTTTTCTATATAAAATAAAATTTACTTAAAAAA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_19042;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_199120

FPKM

• FPAB: 7.7
• FPNAB: 7.2
• LF1: 4.8
• LF2: 5.6
• LF3: 3.8
• LF4: 0.5
• UF1: 1.6
• UF2: 2.7
• UF3: 4.4
• UF4: 2.6

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_199120

• Blastp: Protein argonaute 2 from Arabidopsis with 44.99% of identity
• Blastx: Protein argonaute 2 from Arabidopsis with 53.25% of identity
• Eggnog: eukaryotic translation initiation factor 2c(ENOG410XP07)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G31280)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019421826.1)
• Pfam: N-terminal domain of argonaute (PF16486.4)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;