Ll_transcript_275160

• Id Trinity: FTRINITY_DN50016_c0_g2_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_275160
• Sequence: CGCTATTTCCTTTTTTATTTATTTTATTTCATAATTTGGTAACAACTTTTCATATAGTATTCAGAATGCACAATTGCACATTATCTCTGAATCTCAGATT TTGATATATTCCAATGCGTGCCTCTTGAATTTACTTACTCTGTTTATTTAATTCTCGTAACTAAATTTGCGGTTGATAGTTAATGAAGACATAATTGACA CGGTTAGGTTGGTTTGAATTCTATATCCATGTATGTTAACAAATACTCTTCATAATTATCTATTACTAGGTCACGTTCATAATCAGTAGAAAATTTAATG AGTCTATTTCATTTTCATTATTTGCTTTGTTTTATTTTAATTTCTAATTTTAATTTTTCTTGTCGTTTTCTGAGGAGTTTTGACAATTTATGTTGTTTCT GATTTTTTGTTATGTTGTTGTGGTTGTGCTATCTATGATTTGAGGTTTGGAATCACTGTTTGTTAAAATGGTTGTATCAATTAAATGCAAATGTAGCTTA GATTTTTATTATGTTTGGGTGCTAAACTTGGATTTTGATGTCATGGTGGGTGTTTGTTTCATGTTTCTAGCTTTTCTAGCCCCTGATAGATACTCCATCT ATGTTGGGGATGCAATTTTAGGCTTTTGAGTATGAACCTCAAGGACTTGTAGTAGAAATGGCAGCAAGTGGAAGTGAAACTTCGTTTGTCAAAACAAAGA GGACAAATGGTTTCATCGCACTTCTTACAACTGCAGCTTGTGAGTGGTTTTTGATCTTTCTTCTGCTAGTTGATGCCGTGGTGTCGTTTCTGCTCACAAA GTTTGCAAGTTATTGCCAATTGCAATTGCCTTGTTTGTTATGCTCCAGGCTGGATCATATCTTTGGCTGTGAAAAGCCAGAGTTCTACCAGGACCTATTT TGCAGCAACCATAAATCAGAAATAACTTCTTTGATATCATGTCATATTCATGGTAAAGTTGCAGATGGTCATAGGATGTGTGATGATTGTCTTCTGTCAT TCACCATAAGCACCAACCACAACAAAAAAACTCATAGGTTGTTGGCAGGAAAATTAGGGTTGGTTCTTGGTGGGTCTGGTTTCCAGAGCCCGTCATTGAG CAGAGATTTGTTTACTGCCTCTAAGGGCTCAAGGCCGTGTATCTGCTGTGGTAAGCTTTGGAAGTCAGAACAGAATGCCTCGAGATCTATCCAACTAAAA TCATCTGGTAGAGCTGTTCTTAAGCCATACATTCCTTTGCCACATGCACCAAGGCAAAGCCGTTTAAATCACCGGGAGAACTCGAAGAAAGTAAAGGATA AATTTTATGGAACAGAAGGAAAGGGATATTTTCATCATGTTGGGTACACTGAGCTGAGACTCACTTCTGATTCTGAGTCCGAGTTTCTATTTTCTGATGA TGATGATAATGTTGGTAATGTATTTCATGAAAACATTGAAGCTGGTAATGACCCTACAACTCAATTTACACCAGTGATTCCCCCAAAATGTATTCAGGAT GATTTTAATCCATCAAAGGTACACGTGGAGCACAACATCAGCAAGCACTATGATGAGAAGTTCCTGGGTTCTGATGCTGCTAATGAAGATGGTCTGGAAG ATATTAATTTGCTGCAAGAAAATAAAAGGTCACCTAGTTCTGACCTGCCTGTGCTCATTTCACTTGATGAAGTTTCACCATCACCTATTGCTGTGAACCA TTGTAACGATGAATCAGAAGTTGATAAAGCTTCATACCTTTCTCATAATTCTCTTACTAGTCCCTTATCAGCGGAGTTCACGACTTTGGATGGTGCTCAT ACACTTGTTGGATCATCATCAAATAAATCTGCAGATGCTGCACTAGCAAGTGGTACCGGACTTGTATCTGAATGTCATGGCGACATCTTAGAGAACATTG ATACAAGGGTTGCTTCGATTGAAACTGATCCCATGATAAGTGATTCTGCTCCTACAAATACAAGTCCTATGCCAAATAACTCAAGTAACATTAGTAAGTC CAATCTCACCTCTATGGAAAGAGAGGTACCTGGTTTTGTCACAGAACAGCCGACTATTCAGGAAATTGTTAAAGTCACAGAAGAACTGGGGCTATCGCCA TCACGTAGTACTTCTCCTCACGGGTCTAATATGTCATCAGCAGTTCCCATAAATCATGCTCGTTCCCCTGTGATAGATGATGAGGCTTCCAATTCAAATG CAATTCAGGGTCTTCAAAGGTCGGGCTCAGTGGAATCTGCTCTTGAATCTCTGGATGGATCCAATGTTAGTGAAATTGAAGGGGAGTCTATAGTTGATCG ATTGAAGAGACAGGTTGAGCATGACAAGAAATACATGGATTCTTTACAGAAGGAACTAGAGGAAGAAAGAAATGCTTCTGCTATTGCTGCAAATGAAGCA ATGTCTATGATAACAAGGTTACAGGAGGAGAAGGCAGCACTGCAAATGGAGACTCTTCAATATTTAAGAATGATGGAAGAGCAAGCAGAATATGACAATG ATGAATTGGATAAAGTTAATGACCTACTGACAGAAAAGGAAAAGGAGATACAAGATTTGGAAGCAGAGCTGGAGTTTTATAGGTTAAACTTGACAGATGA CCATGCAGACCACAACATGCCTGTGGAATGTTGTGATTCAGAAGGAGGAAGTATGACAGCAAAAAATGTTGGTGTCCATAACAGCACTGATACTCTTAAC ATTGTTTCTGATTTGAAGTTCCCTGAGGTATCCGAAGTCAGTAATGAAGCTGTGCCTTCTGGAACATCTTTAGAATTTGAAGAGGAAAAGCAATATATTT CACAGTGTTTGAAAAACTTGGAAAATAAACTTCATCAAATTTCTTGGAATGGGAGTTCCTCTGATATATACAATGCCAGACCTGAAAAGCTTGAAGTCAG TGAATCAAATGAACTAGGATATTCTAAAGGTGAAGGTCCTCAATTAGATAGTCACGAAGAGACTGATTTGTCCATACAGAAAAATATTGGTACAAGTAAT GGAAACCACACTGATAAGGGTTGCTCAGCTGCTTTAGATAGTGGTGATTGTTCTCTTGGTGAAGAAAACATTAATTCGACATGCGTTGGACAAAAAGATT CACCACCCATGAGAGAAGTTGATTTGGTTGCTCTAGAAAATGAAATATCAGACCTTAATGACAGGTTGGAAGCACTCGAATTTGATCGTGATCTTCTTGA GCATATAATAAACTCTCTTCGAAATGGAGATGGTGGGAAACAATTTATTGAAGATATAGCTCATCAATTGCACGAGCTACGGAAAATTGGGATAAGATCA AAATGACATGTAAATAATGGTGAGCATACTTTTTTGCCTGGAGGGGTGTTGTTCAATGGTCATAGAAGTTTATGATGCCTTTTACAAATTCTTATTACAT ATGTATGCAAAGATAAGAATGCAGCACAAGGAGGAAGAAACTTGTAATCTATTGCAAGCAACAGGTAAAAATGACACAGCTTGCTTTATTCTTTTGACGT GACTGCATATTAATGAGAACCAGAGGACAGAATGTGAAGCAATGGGCATCTCTATATATTGCTTTGAATAAGATTATAGAATACATTATATGAATAGTAA ACTTTGGCTTTTAGTCTCTTGATCCTTCCCTTCCTTAGGACTCTTGCCCTCTATGTTTTGTGAACTGAATAGAATGTGGAGTTTAGTGTTGGTGTATTGA TAAGATGGTACATGAATGAATTGATATTTTTGTATGTTTGGGTGATGGAAAACACCTCCTCTGTGACACTGAGTGAATTTATCCCCAGCACTGCAAAGAT TGATTGAGCTGAAATCATGACATGTTAGTAATTTTTGAGGATACAATAATTTCTCAATGTTGTCTGTGATCTTATATAAAAACATTTAAAAACTTTAATT TACTCATTTGTCTTAAAA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_19446;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_275160

FPKM

• FPAB: 0.2
• FPNAB: 0.1
• LF1: 0.5
• LF2: 0.3
• LF3: 0.8
• LF4: 0.2
• UF1: 0.2
• UF2: 0.7
• UF3: 0.3
• UF4: 0.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_275160

• Blastp: Probable myosin-binding protein 4 from Arabidopsis with 46.77% of identity
• Blastx: Probable myosin-binding protein 4 from Arabidopsis with 42.55% of identity
• Eggnog: Pfam:DUF593(ENOG410YFIM)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G30690)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019441923.1)
• Pfam: Zein-binding (PF04576.14)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;