Ll_transcript_3787

• Id Trinity: FTRINITY_DN50112_c0_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_3787
• Sequence: CTAATTTTAACGGGTTTGTCTATGTCAATTCCTTCTCGTCAAAAACCATCTCTTCGCCTTTGAATTTATCCATGTTCATTTTTGTTTTTGTTATTCAATT CAATTTTGGGACAGGATCATTTCTGTTATGGATCCAACTAGGAGTTGGGCGGCACGTTGGTTGAGAATTGGAAGATTTGTTCCTGGTGTTTACACTCTTG CTGTCTCAGAGGCTCTTCCAGAAGAGATGCAGGTTTGTAATTTTTTTTGGTTACATATGCTTGATCCTTCTGCTAGAGAAAAGGGTATAAATATGATAGT GGCCTATAGATACTCTTGTACTGAATCTTGGGCATTAAAATGCCAACAAGAGCATAAAGTGCGGCAGAGATGAGAATGTTAGTGTTGGCCATTGGATGAG TGAGTACCTGAGAAGATAAGATCAGGAATGGATGTAGAGGGAAGTAGGATTGACATGTATTGAGGAAAAGATTTAGCATCGTACCTTAGATAGTTTAGAC ATTGAAGACCAATAGGAGCCGTAATTAGAAAGTTGATTTGATGAAGGGTAGTCCAATAATTACTAATTAGAGAGGAAGGCATAAATTTTTTTGGTGAAAC ATTATAAAGGATTTACACCTAAATGTCGTATCGAGTGATTTGATTTTTAATGGAATACACTGGTATTGTTGACCCATGTAGCTATTCTATCTAGTGGAAA AATGCTTTGGTTGTTGTATTTTCTTGGTCAAACACAAGTGTACAAGATAACACTCTTACCCGACACTAATAATCTTAGTATTCTAACAGACAAAAAAGTT CAGTCAGCCTCTTTGAGATTTCTATCCCCTCCACTATCCAGTGATAGCATACCTGGCTATCATGGAGAGTTTTTACTTGCCCACCCGAATCCTCAGTAGC TTGTTCTTCAATTTGGTTGACTTGGCTTACTATGATTGTACGTGGAAAGAAATTATATTCATGATGAAATAATAGGATTTTGAATTTTGAAGCAGCTGTC ACTGTAGACTTGAATATATCAACAATTGAACTCTATTGAATGCAGTCTGTAATAACAAAAGGTCTCCACAACTCATTGAAATTCTCATTTCCAAAACTTA AGAGCTTTTATTGCATTTTCAATAATTTAACTCCAGCTTTTTTATGTGTCTTCAACTGGTTGGATGTAAAGTAAATGGTCGTTTTTAATTTGTCTTGTTT AAGCATTTCAATTTTAATTTTCCTAGATCCAAAGTACAACATGGGAAACTAGAAATTCAGTAAGTCAACTTATCACTTGTGTACTACCCAGTTGCTTTTG GGACTTCAAAAAAATGCTTATGTTAGGTATATTGTTTGGTAAATACAATGAGATAATCTATGTAATTAACTAATCACTTTTGTCTCTCCTTTGTATCATC ATCTTTTGCACTGGATTTTTTTATTATAACCAAGGGTGTCCCCGCACCCAATGCGTAATGAACTAGTCTCTTTCGGGGTATGTGATTGCCCCTCTATTGA ACTTTGGACCTTTTGACCTTTTAGCCTCCCTGTATTAATGCTGTATAATGATGTTTTTTTATTTATTTGATTGGTAATGTCTTTTGCAGGCTTTATGTGA AGACGAGCGTGTGCAGTATAACCCTCCCAAACGTTTGTGAAACATGTCTAGCATTGAGTTTGTGACAACTTTAACATAAGCTGAATTGTGAGTTCTTTAG TAATGTGGATTTTAATGTTCATAGTTCTGTTATGATGCTTTATGACATCTTTAATTAACATAAACACAGTTTTTAGTCTGTAGTAATGTGGATTTTAATG TTCATAGTTGTGTTCTGCCGTGTTCTTTAAATCACTTGCTAAAATTCTTCAAGCTCTATGTGGCGTTTCTCTTAAGAATAAGATCATATATGATGGGATT GTTGTTATGACTTAAGAGTAGATATCAAGGATTAAACATGAT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_19603;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_3787

FPKM

• FPAB: 0
• FPNAB: 0.2
• LF1: 0.2
• LF2: 0.2
• LF3: 0
• LF4: 0.1
• UF1: 0.2
• UF2: 0.2
• UF3: 0.2
• UF4: 0.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_3787

• Blastp: -
• Blastx: Transcription elongation factor SPT4 homolog 2 from Arabidopsis with 80.95% of identity
• Eggnog: Transcription elongation factor(COG5204)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G63670)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_020219406.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;